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SENSE - Screening of ENvironmental SEquences to discover novel protein functions, using informatics target selection and high-throughput validation

SENSE - Screening of ENvironmental SEquences to discover novel protein functions, using informatics target selection and high-throughput validation
SENSE - 使用信息学目标选择和高通量验证筛选环境序列以发现新的蛋白质功能
批准号：
BB/T002735/1
负责人：
Christine Orengo
金额：
$29.22万
依托单位：
University College London
依托单位国家：
英国
项目类别：
Research Grant
财政年份：
2020
资助国家：
英国
项目状态：
已结题
起止时间：
2020 至 --
来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=BB%2FT002735%2F1
关键词：
SENSEScreeningENvironmentalSEquencesdiscover

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专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
CATH: increased structural coverage of functional space.
DOI： 10.1093/nar/gkaa1079
发表时间： 2021-01-08
期刊： Nucleic acids research
影响因子： 14.9
作者： [Sillitoe I, Bordin N, Dawson N, Waman VP, Ashford P, Scholes HM, Pang CSM, Woodridge L, Rauer C, Sen N, Abbasian M, Le Cornu S, Lam SD, Berka K, Varekova IH, Svobodova R, Lees J, Orengo CA]
通讯作者： Orengo CA
Novel machine learning approaches revolutionize protein knowledge.
新颖的机器学习方法彻底改变了蛋白质知识。
DOI： 10.1016/j.tibs.2022.11.001
发表时间： 2023-04
期刊： TRENDS IN BIOCHEMICAL SCIENCES
影响因子： 13.8
作者： [Bordin, Nicola, Dallago, Christian, Heinzinger, Michael, Kim, Stephanie, Littmann, Maria, Rauer, Clemens, Steinegger, Martin, Rost, Burkhard, Orengo, Christine]
通讯作者： Orengo, Christine
SARS-CoV-2 spike protein predicted to form complexes with host receptor protein orthologues from a broad range of mammals.
DOI： 10.1038/s41598-020-71936-5
发表时间： 2020-10-05
期刊： Scientific reports
影响因子： 4.6
作者： [Lam SD, Bordin N, Waman VP, Scholes HM, Ashford P, Sen N, van Dorp L, Rauer C, Dawson NL, Pang CSM, Abbasian M, Sillitoe I, Edwards SJL, Fraternali F, Lees JG, Santini JM, Orengo CA]
通讯作者： Orengo CA
BBSRC-NSF/BIO: An AI-based domain classification platform for 200 million 3D-models of proteins to reveal protein evolution
  • 批准号：
    BB/Y001117/1
  • 项目类别：
    Research Grant
  • 资助金额：
    $34.21万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    Christine Orengo
  • 依托单位：
    University College London
ProtFunAI: AI based methods for functional annotation of proteins in crop genomes
  • 批准号：
    BB/Y514044/1
  • 项目类别：
    Research Grant
  • 资助金额：
    $32.43万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    Christine Orengo
  • 依托单位：
    University College London
Improving accuracy, coverage, and sustainability of functional protein annotation in InterPro, Pfam and FunFam using Deep Learning methods PID 7012435
  • 批准号：
    BB/X018563/1
  • 项目类别：
    Research Grant
  • 资助金额：
    $16.68万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    Christine Orengo
  • 依托单位：
    University College London
Transforming the Structural Landscape of CATH to Aid Variant Analyses in Human and Agricultural Organisms and their Pathogens
  • 批准号：
    BB/W018802/1
  • 项目类别：
    Research Grant
  • 资助金额：
    $111.5万
  • 财政年份：
    2022
  • 负责人：
    Christine Orengo
  • 依托单位：
    University College London
国内基金
海外基金
基于Safe screening的多任务稀疏学习理论与算法的研究
  • 批准号：
    12071475
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    51.0万元
  • 批准年份：
    2020
  • 负责人：
    徐义田
  • 依托单位：
    中国农业大学
基于Safe screening 的支持向量机的稀疏理论及其快速求解方法
  • 批准号：
    11671010
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    48.0万元
  • 批准年份：
    2016
  • 负责人：
    徐义田
  • 依托单位：
    中国农业大学