PROTEIN SHAPE DESCRIPTORS

蛋白质形状描述符

• 批准号: 6119170
• 负责人: DONNA HENDRIX
• 金额: $ 0.54万
• 依托单位: UNIVERSITY OF CALIFORNIA, SAN FRANCISCO
• 依托单位国家: 美国
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 美国
• 起止时间: 1999-07-01 至 2000-06-30
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://reporter.nih.gov/project-details/6119170
• 关键词: biological products; biomedical resource; enzymes; proteins; statistics /biometry; technology /technique

The DOCK program uses geometric methods to find possible protein-ligand and protein-protein orientations. I have developed shape descriptors which can be used by the DOCK program to explore and evaluate possible orientations. My current method uses the solid angle of the surface to identify shape-based regions on the protein surface. Graphical programs such as MidasPlus are used to examine the surfaces and project the solid angle values onto the surface by varying the color of the surface.

DOCK程序使用几何方法来寻找可能的 蛋白质-配体和蛋白质-蛋白质取向。 I have developed 形状描述符，可用于DOCK程序，以探索和 评估可能的方向。 我目前的方法使用固体 表面的角度，以识别蛋白质上基于形状的区域 面 图形程序，如MidasPlus，用于检查 曲面，并通过以下方式将立体角值投影到曲面上 改变表面的颜色。