Single molecule analyses of RNA polymerase II elongation
RNA 聚合酶 II 延伸的单分子分析
基本信息
- 批准号:6640558
- 负责人:
- 金额:$ 4.99万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2002
- 资助国家:美国
- 起止时间:2002-08-01 至 2005-07-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
DESCRIPTION (provided by applicant):
The fundamental goal of this project is to establish a method for continuous, real-time analysis of eukaryotic RINA polymerase II transcription through a chromatin template using single-molecule optical trapping techniques. Optical trapping technology permits direct observation of movement by individual RNA polymerase molecules, yielding high-resolution measurement of transcription elongation rates, pausing patterns, and pause durations. This approach allows us to focus on the dynamic interactions that are averaged out during conventional population analyses, providing previously inaccessible information concerning the kinetic aspects of translocation by RNA polymerase and the mechanism by which specific transcription factors regulate this activity.
This proposal involves the systematic development of single-molecule techniques specifically tailored for the study of RNA polymerase elongation. Foundational for these analyses is a novel strategy for immobilization of single RNA polymerase molecules without disturbing native elongation activity. Initially, the method will be optimized using an easily manipulable E. coli transcription system, which will serve as a model for establishing single molecule assays of elongation by Drosophila RNA polymerase II. These assays will first be employed to determine the underlying characteristics of RNA polymerase II transcription on naked DNA templates before being exploited for a detailed investigation of the mechanism by which RNA polymerase II navigates through a nucleosomal barrier.
描述(由申请人提供):
该项目的基本目标是建立一种方法,用于连续,实时分析真核细胞RINA聚合酶II转录通过染色质模板使用单分子光捕获技术。光学捕获技术允许直接观察单个RNA聚合酶分子的运动,产生高分辨率的转录延伸率,暂停模式和暂停持续时间的测量。这种方法使我们能够专注于动态的相互作用,平均在传统的人口分析,提供以前无法访问的信息有关的动力学方面的易位由RNA聚合酶和机制,特定的转录因子调节这种活动。
这项建议涉及系统的发展单分子技术专门为RNA聚合酶延伸的研究。这些分析的基础是一种新的策略,用于固定单个RNA聚合酶分子而不干扰天然延伸活性。最初,该方法将使用易于操作的E. coli转录系统,为建立果蝇RNA聚合酶II延伸的单分子检测方法奠定了基础。这些试验将首先用于确定RNA聚合酶II转录的基本特征,然后利用裸露的DNA模板进行详细的研究,RNA聚合酶II通过核小体屏障导航的机制。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Karen L Adelman其他文献
Karen L Adelman的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('Karen L Adelman', 18)}}的其他基金
Identifying the sequences and factors that govern the fate of elongating RNAPII
鉴定控制延长 RNAPII 命运的序列和因素
- 批准号:
10534168 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Identifying the sequences and factors that govern the fate of elongating RNAPII
鉴定控制延长 RNAPII 命运的序列和因素
- 批准号:
10092655 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Identifying the sequences and factors that govern the fate of elongating RNAPII
鉴定控制延长 RNAPII 命运的序列和因素
- 批准号:
10320370 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Probing the specificity and activity of the metazoan Integrator complex
探讨后生动物整合复合体的特异性和活性
- 批准号:
10224260 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Probing the specificity and activity of the metazoan Integrator complex
探讨后生动物整合复合体的特异性和活性
- 批准号:
10437741 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Single molecule analyses of RNA polymerase II elongation
RNA 聚合酶 II 延伸的单分子分析
- 批准号:
6762373 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Single molecule analyses of RNA polymerase II elongation
RNA 聚合酶 II 延伸的单分子分析
- 批准号:
6552228 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Investigating Transcriptional Responses to the Environment
研究对环境的转录反应
- 批准号:
7968206 - 财政年份:
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Investigating Transcriptional Responses to the Environme
研究对环境的转录反应
- 批准号:
7330699 - 财政年份:
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Investigating Transcriptional Responses to the Environment
研究对环境的转录反应
- 批准号:
8553780 - 财政年份:
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
相似海外基金
Linking the HTLV-1 pre-integration complex to the chromatin
将 HTLV-1 预整合复合物连接至染色质
- 批准号:
MR/Y002083/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Research Grant
Role of chromatin remodeling in gene regulation during maize basal endosperm development
染色质重塑在玉米基础胚乳发育过程中基因调控中的作用
- 批准号:
2341575 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Continuing Grant
How does the chromatin remodeller CHD4 regulate gene expression?
染色质重塑因子 CHD4 如何调节基因表达?
- 批准号:
DP240102119 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Discovery Projects
Mechanistic characterisation of enhancer hijacking: identifying essential and targetable chromatin interactions
增强子劫持的机制表征:识别必要的和可靶向的染色质相互作用
- 批准号:
MR/Y011902/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Research Grant
Visualising chromatin changes in 3 dimensions: super to ultra resolution
三维可视化染色质变化:超分辨率到超分辨率
- 批准号:
DP230103211 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Discovery Projects
Chromatin-binding deubiquitinase MYSM1 as a putative drug target for cMYC-driven B cell lymphoma
染色质结合去泛素酶 MYSM1 作为 cMYC 驱动的 B 细胞淋巴瘤的推定药物靶点
- 批准号:
478278 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Operating Grants
Structural studies for understanding the mechanism of DNA repair in chromatin
了解染色质 DNA 修复机制的结构研究
- 批准号:
23H05475 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
ILLUMINATION OF CHROMATIN REGULATION VIA CHEMICAL CONTROLLED PROXIMITY
通过化学控制的接近来阐明染色质调控
- 批准号:
10550480 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Cancer-based discovery of novel mechanisms of chromatin control
基于癌症的染色质控制新机制的发现
- 批准号:
10660680 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Chemical Genetic Dissection of SWI/SNF Chromatin Remodeling Complex Functions in Cerebral Cortex Development
大脑皮层发育中 SWI/SNF 染色质重塑复杂功能的化学遗传学解析
- 批准号:
10660367 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:














{{item.name}}会员




