Physiological and molecular interplay between stress and immune responses in Atlantic salmon
大西洋鲑鱼应激与免疫反应之间的生理和分子相互作用
基本信息
- 批准号:2746683
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:英国
- 项目类别:Studentship
- 财政年份:2022
- 资助国家:英国
- 起止时间:2022 至 无数据
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Aquaculture is the fastest growing human food sector worldwide. Global consumption of farm produced fish and shellfish has exceeded that from wild capture fisheries with further growth being crucial to the improvement of human food security globally. The UK Atlantic salmon industry is currently worth > £1.8 Billion per year to the UK economy. However, reduction of stress in aquaculture practices and improved fish growth and disease resilience are key challenges that need to be addressed to improve sustainability and industry growth. Stress associated with fish handling leads to suppressed immunity and increased disease susceptibility, with crosstalk between stress and immune responses not fully understood. This project will, therefore, utilize physiological and cutting-edge molecular approaches to gain a deeper understanding of stress and immune interactions during health and disease. New data will help pinpoint gene markers that to help inform on future stress and disease mitigation strategies in fish management practices.Recent results from our lab have begun to unravel fish immune and stress interactions. This PhD will use whole animal and cell culture models to investigate (non)infectious stressors and how key stress hormones and immune proteins influence immune and endocrine cells respectively. In vitro and in vivo work will incorporate single cell transcriptomic sequencing (scRNA-Seq) combining physiological and state-of-the-art molecular techniques. scRNA-Seq will differentiate fish immune and stress hormone-producing cells under different physiological conditions, enabling a deep understanding of fish immune-endocrine interactions during health and disease.This project is highly relevant to the improvement of Atlantic salmon production and links to existing collaborative projects at the Scottish Fish Immunology Research Centre (SFIRC) at Aberdeen and Stirling. The project will be supervised by Dr Holland and Prof Martin at University of Aberdeen and Dr Monaghan at University of Stirling. SFIRC is a world leader in fish immunology with a focus on fish health, host-pathogen interactions and nutrition using state-of-the-art functional gemomics, including scRNA-Seq available within Aberdeen's Centre for Genome Enabled Biology and Medicine. SFIRC labs are equipped for physiological, cellular, and molecular approaches with access to state-of-the-art aquarium and pathogen challenge facilities. Excellent training opportunities are available in cell culture, molecular and physiological techniques, including respirometry, histology, qRT-PCR, and enzyme-based assays to determine serum hormone levels. All training needs will be provided by the project team, including bioinformatics at Aberdeen and other courses as required.References:(1) Castro R, Zou Z, Secombes CJ, Martin, SAM (2011). Cortisol modulates the induction of inflammatory gene expression in a rainbow trout macrophage cell line. Fish & shellfish immunology 30 (1), 215-223(2) Faber, M; Yoon, S; Shaw, S; de Paiva Alves, E; Wang, B; Qi, Z; Okamura, B; Hartikainen, H; Secombes, CJ; Holland, JW (2021). Comparative transcriptomics and host-specific parasite gene expression profiles inform on drivers of proliferative kidney disease. Scientific Reports, 11, 2149.(3) West, AC; Mizoro, Y; Wood, SH; Ince, LM; Iversen, M; Jorgensen, EH; Nome, T; Sandve, SR; Martin, SAM; Loudon, ASI; Hazlerigg, DG (2021). Immunologic profiling of the Atlantic salmon gill by single nuclei transcriptomics. Frontiers in Immunology, 12, Art No: 669889.(4) Chang YC, Hamlin-Wright H, Monaghan S, Herath T, Baily J, Del Pozo J, Downes J, Preston A, Chalmers L, Jayasuriya N, Bron JE, Adams A, Fridman S. Changes in distribution, morphology and ultrastructure of chloride cell in Atlantic salmon during an AGD infection. J Fish Dis. 2019 Oct;42(10):1433-1446. doi: 10.1111/jfd.13073. Epub 2019 Aug 20. PMID: 31429104.
水产养殖是全球增长最快的人类食品部门。全球养殖鱼和贝类消费量已超过野生捕捞渔业,进一步增长对改善全球人类粮食安全至关重要。目前,英国大西洋鲑鱼产业每年为英国经济带来18亿英镑的收入。然而,减少水产养殖实践中的压力以及改善鱼类生长和抗病能力是需要解决的关键挑战,以改善可持续性和产业增长。与处理鱼类相关的压力会导致免疫力受抑和疾病易感性增加,而压力和免疫反应之间的串扰尚不完全清楚。因此,该项目将利用生理学和尖端分子方法来更深入地了解健康和疾病期间的应激和免疫相互作用。新的数据将有助于准确定位基因标记,帮助了解未来在鱼类管理实践中的压力和疾病缓解策略。我们实验室最近的结果已经开始揭开鱼类免疫和压力的相互作用。该博士将使用全动物和细胞培养模型来研究(非)感染性应激源,以及关键应激激素和免疫蛋白如何分别影响免疫和内分泌细胞。在体外和体内的工作将结合生理和最先进的分子技术的单细胞转录序列(scRNA-Seq)。ScRNA-Seq将在不同的生理条件下分化鱼类免疫和应激激素产生细胞,使人们能够深入了解鱼类在健康和疾病期间的免疫-内分泌相互作用。该项目与大西洋鲑鱼产量的改善高度相关,并与位于阿伯丁和斯特林的苏格兰鱼类免疫研究中心(SFIRC)现有的合作项目相联系。该项目将由阿伯丁大学的霍兰德博士和马丁教授以及斯特林大学的莫纳汉博士监督。SFIRC是鱼类免疫学领域的世界领先者,利用最先进的功能基因组学,包括阿伯丁基因组使能生物和医学中心提供的scRNA-Seq,专注于鱼类健康、宿主与病原体的相互作用和营养。SFIRC实验室配备了生理、细胞和分子方法,可以访问最先进的水族馆和病原体挑战设施。在细胞培养、分子和生理技术方面有很好的培训机会,包括呼吸测量、组织学、qRT-PCR和以酶为基础的测定血清激素水平的方法。所有培训需求将由项目团队提供,包括阿伯丁的生物信息学和其他需要的课程。参考资料:(1)Castro R,Zou Z,Secombes CJ,Martin,SAM(2011)。皮质醇调节虹鱼巨噬细胞系炎症基因表达的诱导。鱼和贝类免疫学30(1),215-223(2)Faber,M;Yoon,S;Shaw,S;de Paiva Alves,E;Wang,B;齐,Z;Okamura,B;Hartikainen,H;Secombes,CJ;Holland,JW(2021年)。比较转录学和宿主特异性寄生虫基因表达谱为增殖性肾脏疾病的驱动因素提供信息。(3)West,AC;Mizoro,Y;Wood,SH;Ince,LM;Iversen,M;Jorgensen,EH;Nome,T;Sandve,SR;Martin,SAM;Loudon,ASI;Hazlerigg,DG(2021)。用单核转录组学方法研究大西洋鲑鱼鳃的免疫学特征。免疫学前沿,12,艺术编号:669889。(4)张玉秋,Hamlin-Wright H,Monaghan S,Herath T,Baly J,Del Pozo J,Downes J,Preston A,Chalmers L,Jayasuriya N,Bron Je,Adams A,Fridman S。大西洋鲑鱼在AGD感染过程中氯细胞的分布、形态和超微结构的变化。J Fish Dis.2019年10月;42(10):1433-1446。DOI:10.1111/jfd.13073.EPub2019年8月20日。PMID:31429104。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
其他文献
吉治仁志 他: "トランスジェニックマウスによるTIMP-1の線維化促進機序"最新医学. 55. 1781-1787 (2000)
Hitoshi Yoshiji 等:“转基因小鼠中 TIMP-1 的促纤维化机制”现代医学 55. 1781-1787 (2000)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
LiDAR Implementations for Autonomous Vehicle Applications
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
吉治仁志 他: "イラスト医学&サイエンスシリーズ血管の分子医学"羊土社(渋谷正史編). 125 (2000)
Hitoshi Yoshiji 等人:“血管医学与科学系列分子医学图解”Yodosha(涉谷正志编辑)125(2000)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Effect of manidipine hydrochloride,a calcium antagonist,on isoproterenol-induced left ventricular hypertrophy: "Yoshiyama,M.,Takeuchi,K.,Kim,S.,Hanatani,A.,Omura,T.,Toda,I.,Akioka,K.,Teragaki,M.,Iwao,H.and Yoshikawa,J." Jpn Circ J. 62(1). 47-52 (1998)
钙拮抗剂盐酸马尼地平对异丙肾上腺素引起的左心室肥厚的影响:“Yoshiyama,M.,Takeuchi,K.,Kim,S.,Hanatani,A.,Omura,T.,Toda,I.,Akioka,
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('', 18)}}的其他基金
An implantable biosensor microsystem for real-time measurement of circulating biomarkers
用于实时测量循环生物标志物的植入式生物传感器微系统
- 批准号:
2901954 - 财政年份:2028
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Exploiting the polysaccharide breakdown capacity of the human gut microbiome to develop environmentally sustainable dishwashing solutions
利用人类肠道微生物群的多糖分解能力来开发环境可持续的洗碗解决方案
- 批准号:
2896097 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
A Robot that Swims Through Granular Materials
可以在颗粒材料中游动的机器人
- 批准号:
2780268 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Likelihood and impact of severe space weather events on the resilience of nuclear power and safeguards monitoring.
严重空间天气事件对核电和保障监督的恢复力的可能性和影响。
- 批准号:
2908918 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Proton, alpha and gamma irradiation assisted stress corrosion cracking: understanding the fuel-stainless steel interface
质子、α 和 γ 辐照辅助应力腐蚀开裂:了解燃料-不锈钢界面
- 批准号:
2908693 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Field Assisted Sintering of Nuclear Fuel Simulants
核燃料模拟物的现场辅助烧结
- 批准号:
2908917 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Assessment of new fatigue capable titanium alloys for aerospace applications
评估用于航空航天应用的新型抗疲劳钛合金
- 批准号:
2879438 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Developing a 3D printed skin model using a Dextran - Collagen hydrogel to analyse the cellular and epigenetic effects of interleukin-17 inhibitors in
使用右旋糖酐-胶原蛋白水凝胶开发 3D 打印皮肤模型,以分析白细胞介素 17 抑制剂的细胞和表观遗传效应
- 批准号:
2890513 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Understanding the interplay between the gut microbiome, behavior and urbanisation in wild birds
了解野生鸟类肠道微生物组、行为和城市化之间的相互作用
- 批准号:
2876993 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
相似国自然基金
配子生成素GGN不同位点突变损伤分子伴侣BIP及HSP90B1功能导致精子形成障碍的发病机理
- 批准号:82371616
- 批准年份:2023
- 资助金额:49.00 万元
- 项目类别:面上项目
MYRF/SLC7A11调控施万细胞铁死亡在三叉神经痛脱髓鞘病变中的作用和分子机制研究
- 批准号:82370981
- 批准年份:2023
- 资助金额:48.00 万元
- 项目类别:面上项目
PET/MR多模态分子影像在阿尔茨海默病炎症机制中的研究
- 批准号:82372073
- 批准年份:2023
- 资助金额:48.00 万元
- 项目类别:面上项目
GREB1突变介导雌激素受体信号通路导致深部浸润型子宫内膜异位症的分子遗传机制研究
- 批准号:82371652
- 批准年份:2023
- 资助金额:45.00 万元
- 项目类别:面上项目
靶向PARylation介导的DNA损伤修复途径在恶性肿瘤治疗中的作用与分子机制研究
- 批准号:82373145
- 批准年份:2023
- 资助金额:49.00 万元
- 项目类别:面上项目
O6-methyl-dGTP抑制胶质母细胞瘤的作用及分子机制研究
- 批准号:82304565
- 批准年份:2023
- 资助金额:30.00 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
OBSL1功能缺失导致多指(趾)畸形的分子机制及其临床诊断价值
- 批准号:82372328
- 批准年份:2023
- 资助金额:49.00 万元
- 项目类别:面上项目
Irisin通过整合素调控黄河鲤肌纤维发育的分子机制研究
- 批准号:32303019
- 批准年份:2023
- 资助金额:30.00 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
转录因子LEF1低表达抑制HMGB1致子宫腺肌病患者子宫内膜容受性低下的分子机制
- 批准号:82371704
- 批准年份:2023
- 资助金额:49.00 万元
- 项目类别:面上项目
上皮细胞黏着结构半桥粒在热激保护中的作用机制研究
- 批准号:31900545
- 批准年份:2019
- 资助金额:24.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
相似海外基金
Primary cilia loss in bile duct cells- the interplay with the autophagy machinery
胆管细胞中初级纤毛的损失——与自噬机制的相互作用
- 批准号:
10605658 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Decoding dynamic interplay between signaling and membranes in chemotaxis bymolecular actuators
通过分子致动器解码趋化中信号传导和膜之间的动态相互作用
- 批准号:
10846921 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
CAREER: The molecular interplay between integrin adhesion, allostery and shape-shifting
职业:整合素粘附、变构和变形之间的分子相互作用
- 批准号:
2239492 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Continuing Grant
Interplay of the T Cell Repertoire Development and Early Life Exposure on Incident Risk of Peanut Allergy
T 细胞库发育和生命早期接触对花生过敏事件风险的相互作用
- 批准号:
10742029 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Decoding dynamic interplay between signaling and membranes in chemotaxis by molecular actuators
通过分子致动器解码趋化中信号传导和膜之间的动态相互作用
- 批准号:
10623376 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Primary cilia loss in bile duct cells- the interplay with the autophagy machinery
胆管细胞初级纤毛损失——与自噬机制的相互作用
- 批准号:
10898187 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Interplay of the HIV-1 Env cytoplasmic tail, Gag-MA, and membrane: resolving molecular detail and blocking assembly
HIV-1 Env 胞质尾部、Gag-MA 和膜的相互作用:解析分子细节并阻断组装
- 批准号:
10772333 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Interplay between tau and PKA condensates in ADRD
ADRD 中 tau 蛋白和 PKA 缩合物之间的相互作用
- 批准号:
10584358 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Investigating the interplay between hallmarks of aging; protein glycation, nutrient sensing, and senescence
研究衰老特征之间的相互作用;
- 批准号:
10901045 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Functional Architecture and Interplay of Transcription Regulatory Elements of the Human Genome
人类基因组转录调控元件的功能结构和相互作用
- 批准号:
10639574 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别: