Cloning QTL Genes for Plasma HDL Cholesterol

克隆血浆 HDL 胆固醇 QTL 基因

基本信息

  • 批准号:
    7230440
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 36.7万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2006
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2006-05-05 至 2010-04-30
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

DESCRIPTION (provided by applicant): Atherosclerosis is the pathological basis for ischemic cardiovascular disease (CVD), the leading cause of death in the industrialized nations. Two lines of evidence indicate that high levels of plasma high-density lipoprotein cholesterol (HDL-C) protect against CVD. First, epidemiological studies have shown an inverse relationship between HDL-C levels and the incidence of CVD. Second, raising plasma HDL-C levels is associated with reduced atherosclerosis in mice, rabbits and humans. Because plasma HDL-C levels are largely genetically determined, quantitative trait locus (QTL) mapping has been used to localize HDL-regulating chromosomal (Chr) loci. Comparison of mouse and human HDL QTLs revealed that they are concordant, therefore finding genes underlying HDL-C QTLs in mice may reveal HDL-regulating genes in humans, which may provide therapeutic targets. Our long-term objective is to find new genes regulating plasma HDL-C levels to provide new therapeutic targets for CVD. In this proposal, we have chosen to identify the genes for one HDL-C QTL on Chr 1 (Hdlq33) and one on Chr 6 (Hdlq12) based on the following criteria: 1) at least one human homologous HDL-C QTL has been found; 2) the QTL has been found in multiple crosses, and/or they coincide with in silico HDL-C QTLs; 3) the QTL can be separated from closely linked QTL(s) so we know which crosses have detected the QTL we want to study; 4) the crosses involve sequenced strains (B6, A, DBA/2 and 129) because sequence differences will then be easier to find; and 5) other genetic resources are available: congenic strains, consomic strains, recombinant inbred strains. We propose to identify the genes of these two QTLs through the following specific aims. First, we will narrow the QTLs using genomic, statistical and bioinformatic tools. Second, we will narrow the QTLs genetically. Third, we will test candidate genes in mice according to their sequence, expression and functions, and test their relevance to human CVD in association studies. Through this grant, we will find genes that regulate blood HDL cholesterol (the so-called "good cholesterol") levels. Drugs acting on these genes may increase HDL cholesterol, and decrease the incidence of cardiovascular disease.
描述(申请人提供):动脉粥样硬化是缺血性心血管疾病(CVD)的病理基础,是工业化国家的主要死亡原因。有两条证据表明,高水平的血浆高密度脂蛋白胆固醇(HDLC)可以预防心血管疾病。首先,流行病学研究表明,高密度脂蛋白胆固醇水平与心血管疾病的发病率呈负相关。其次,提高血浆高密度脂蛋白胆固醇水平与减少小鼠、兔子和人类的动脉粥样硬化有关。由于血浆高密度脂蛋白-C水平在很大程度上是由遗传决定的,数量性状基因座(QTL)已被用来定位高密度脂蛋白调节染色体(Chr)基因座。比较小鼠和人类的高密度脂蛋白QTL,发现它们是一致的,因此,在小鼠中寻找隐藏在高密度脂蛋白-C QTL的基因可能揭示人类的高密度脂蛋白调节基因,这可能为治疗提供靶点。我们的长期目标是寻找调节血浆高密度脂蛋白胆固醇水平的新基因,为心血管疾病提供新的治疗靶点。在这一方案中,我们选择了基于以下标准来确定位于Chr1(Hdlq33)和Chr6(Hdlq12)上的一个高密度脂蛋白-C QTL的基因:1)至少发现了一个人类同源的高密度脂蛋白-C QTL;2)在多个杂交组合中发现了该QTL,和/或它们与电子高密度脂蛋白-C QTL中的QTL一致;3)该QTL可以从紧密连锁的QTL(S)中分离出来,因此我们知道哪些杂交组合检测到了我们要研究的QTL;4)这些杂交涉及到测序的菌株(B6、A、DBA/2和129),因为这样更容易找到序列差异;5)可利用的遗传资源有:同源品系、共生品系、重组近交系。我们建议通过以下特定的目标来识别这两个QTL的基因。首先,我们将使用基因组、统计和生物信息学工具来缩小QTL。其次,我们将从基因上缩小QTL。第三,我们将根据候选基因的序列、表达和功能在小鼠身上进行测试,并在关联性研究中测试它们与人类心血管疾病的相关性。通过这笔赠款,我们将找到调节血液高密度脂蛋白胆固醇(即所谓的“好胆固醇”)水平的基因。作用于这些基因的药物可能会增加高密度脂蛋白胆固醇,降低心血管疾病的发生率。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Beverly J Paigen其他文献

Erratum to: Intraocular pressure in genetically distinct mice: an update and strain survey: Correction
  • DOI:
    10.1186/1471-2156-2-16
  • 发表时间:
    2001-09-26
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.500
  • 作者:
    Olga V Savinova;Fumihiro Sugiyama;Janice E Martin;Stanislav I Tomarev;Beverly J Paigen;Richard S Smith;Simon WM John
  • 通讯作者:
    Simon WM John

Beverly J Paigen的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Beverly J Paigen', 18)}}的其他基金

From QTL to Gene for HDL Cholesterol
从 QTL 到 HDL 胆固醇基因
  • 批准号:
    9100877
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
From QTL to Gene for HDL Cholesterol
从 QTL 到 HDL 胆固醇基因
  • 批准号:
    8822597
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
From QTL to Gene for HDL Cholesterol
从 QTL 到 HDL 胆固醇基因
  • 批准号:
    8836570
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
From QTL to Gene for HDL Cholesterol
从 QTL 到 HDL 胆固醇基因
  • 批准号:
    9303428
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
Cloning QTL Genes for Plasma HDL Cholesterol
克隆血浆 HDL 胆固醇 QTL 基因
  • 批准号:
    7413961
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
Phenotyping and In Silico Mapping of Quantitative Traits
数量性状的表型分析和计算机绘图
  • 批准号:
    7299597
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
Cloning QTL Genes for Plasma HDL Cholesterol
克隆血浆 HDL 胆固醇 QTL 基因
  • 批准号:
    7089778
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
Cloning QTL Genes for Plasma HDL Cholesterol
克隆血浆 HDL 胆固醇 QTL 基因
  • 批准号:
    7626269
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
Cloning QTL Genes for Plasma HDL Cholesterol
克隆血浆 HDL 胆固醇 QTL 基因
  • 批准号:
    7895203
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
Cloning QTL Genes for Plasma HDL Cholesterol
克隆血浆 HDL 胆固醇 QTL 基因
  • 批准号:
    7685759
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:

相似海外基金

Linkage of HIV amino acid variants to protective host alleles at CHD1L and HLA class I loci in an African population
非洲人群中 HIV 氨基酸变异与 CHD1L 和 HLA I 类基因座的保护性宿主等位基因的关联
  • 批准号:
    502556
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
Olfactory Epithelium Responses to Human APOE Alleles
嗅觉上皮对人类 APOE 等位基因的反应
  • 批准号:
    10659303
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
Deeply analyzing MHC class I-restricted peptide presentation mechanistics across alleles, pathways, and disease coupled with TCR discovery/characterization
深入分析跨等位基因、通路和疾病的 MHC I 类限制性肽呈递机制以及 TCR 发现/表征
  • 批准号:
    10674405
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
An off-the-shelf tumor cell vaccine with HLA-matching alleles for the personalized treatment of advanced solid tumors
具有 HLA 匹配等位基因的现成肿瘤细胞疫苗,用于晚期实体瘤的个性化治疗
  • 批准号:
    10758772
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
Identifying genetic variants that modify the effect size of ApoE alleles on late-onset Alzheimer's disease risk
识别改变 ApoE 等位基因对迟发性阿尔茨海默病风险影响大小的遗传变异
  • 批准号:
    10676499
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
New statistical approaches to mapping the functional impact of HLA alleles in multimodal complex disease datasets
绘制多模式复杂疾病数据集中 HLA 等位基因功能影响的新统计方法
  • 批准号:
    2748611
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
    Studentship
Genome and epigenome editing of induced pluripotent stem cells for investigating osteoarthritis risk alleles
诱导多能干细胞的基因组和表观基因组编辑用于研究骨关节炎风险等位基因
  • 批准号:
    10532032
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
Recessive lethal alleles linked to seed abortion and their effect on fruit development in blueberries
与种子败育相关的隐性致死等位基因及其对蓝莓果实发育的影响
  • 批准号:
    22K05630
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Investigating the Effect of APOE Alleles on Neuro-Immunity of Human Brain Borders in Normal Aging and Alzheimer's Disease Using Single-Cell Multi-Omics and In Vitro Organoids
使用单细胞多组学和体外类器官研究 APOE 等位基因对正常衰老和阿尔茨海默病中人脑边界神经免疫的影响
  • 批准号:
    10525070
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
Leveraging the Evolutionary History to Improve Identification of Trait-Associated Alleles and Risk Stratification Models in Native Hawaiians
利用进化历史来改进夏威夷原住民性状相关等位基因的识别和风险分层模型
  • 批准号:
    10689017
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 36.7万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了