Discovery and characterization of new natural products from uncultured bacteria

来自未培养细菌的新天然产物的发现和表征

基本信息

  • 批准号:
    7494029
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 32万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2006
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2006-09-01 至 2011-08-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Project Summary: The study of biologically active natural products has been a very effective gateway to the identification of compounds with unique cellular targets that have been useful both as therapeutics and,more recently in the emerging field of chemical genetics, as modulators of complex biological systems. One of the key revelations to come from molecular phylogenetic analyses of environmental samples is that only a small fraction of bacteria present in the environment is easily cultured. Traditional approaches used for the discovery of new natural products are therefore unlikely to provide access to the vast majority of natural products that exist in nature. Soil microbes that have not yet been cultured and as a result have not been examined for the production of useful natural products outnumber their cultured counterparts by at least two to three orders of magnitude. Using PCR with degenerate primers based on conserved regions in genes known to be involved in the biosynthesis of natural products and high throughput sequencing we are proposing to screen cosmid libraries of DNA extracted directly from soil for biosynthetic pathways that encode the production of new natural products. Heterologous expression will then be used to access the molecules encoded by these new gene clusters and the resulting molecules screened for biological activity in a variety of human disease related screens. Relevance: Natural products, naturally derived small organic compounds, have traditionally been one of the major sources of FDA approved therapeutics. Uncultured bacteria are one of the largest remaining pools of genetic diversity that have not yet been examined for the production of secondary metabolites. The development of methods to functionally access the previously inaccessible natural products produced by uncultured bacteria should significantly increase the number and diversity of natural products that are available to test as probes of biological processes and therapeutic agents.
项目概要: 生物活性天然产物的研究一直是鉴定 具有独特的细胞靶点的化合物,其既可用作治疗剂, 化学遗传学的新兴领域,作为复杂生物系统的调节剂。的一个关键 从环境样本的分子系统发育分析中得到的启示是, 存在于环境中的细菌的一部分容易培养。传统方法用于 因此,新的天然产品的发现不太可能提供对绝大多数天然产品的获取。 自然界中存在的产品。土壤微生物还没有被培养,因此没有被 被检测为生产有用的天然产品的数量超过了他们的培养同行至少两个 到三个数量级。基于基因保守区的简并引物PCR 已知参与天然产物的生物合成和高通量测序, 建议筛选直接从土壤中提取的DNA的粘粒文库的生物合成途径, 编码新的天然产物的生产。然后,将使用heterocycle表达式访问 由这些新基因簇编码的分子和由此产生的分子筛选生物活性, 各种人类疾病相关的屏幕。 相关性: 天然产物,天然衍生的小有机化合物,传统上是主要的有机化合物之一。 FDA批准的治疗药物的来源。未培养的细菌是最大的剩余池之一, 尚未对次级代谢产物的产生进行检测的遗传多样性。的 开发方法,以功能性地获得以前无法获得的天然产品, 未培养的细菌应该显着增加天然产物的数量和多样性, 可作为生物过程和治疗剂的探针进行测试。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

SEAN F BRADY其他文献

SEAN F BRADY的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('SEAN F BRADY', 18)}}的其他基金

Discovery and characterization of synthetic bioinformatic natural product anticancer agents
合成生物信息天然产物抗癌剂的发现和表征
  • 批准号:
    10639302
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Synthetic environmental peptide libraries as a source of novel antibiotics
合成环境肽库作为新型抗生素的来源
  • 批准号:
    10394993
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Synthetic environmental peptide libraries as a source of novel antibiotics
合成环境肽库作为新型抗生素的来源
  • 批准号:
    10613900
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Discovery of Antibiotics from Soil Microbiomes Using Metagenomics
利用宏基因组学从土壤微生物组中发现抗生素
  • 批准号:
    9906905
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Discovery of GPCR-active natural products and their biosynthetic genes from the human associated bacteria
从人类相关细菌中发现具有 GPCR 活性的天然产物及其生物合成基因
  • 批准号:
    10229230
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Discovery of Antibiotics from Soil Microbiomes Using Metagenomics
利用宏基因组学从土壤微生物组中发现抗生素
  • 批准号:
    10552394
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Discovery of GPCR-active natural products and their biosynthetic genes from the human associated bacteria
从人类相关细菌中发现具有 GPCR 活性的天然产物及其生物合成基因
  • 批准号:
    10198774
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Development and application of a functional metagenomic antibiotic discovery pipeline
功能性宏基因组抗生素发现管道的开发和应用
  • 批准号:
    9123633
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Development and application of a functional metagenomic antibiotic discovery pipeline
功能性宏基因组抗生素发现管道的开发和应用
  • 批准号:
    8932426
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
A minimally invasive synthetic bio-driven approach for natural products discovery
用于天然产物发现的微创合成生物驱动方法
  • 批准号:
    9102130
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:

相似海外基金

Bone-Adipose Interactions During Skeletal Anabolism
骨骼合成代谢过程中骨-脂肪相互作用
  • 批准号:
    10590611
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Bone-Adipose Interactions During Skeletal Anabolism
骨骼合成代谢过程中的骨-脂肪相互作用
  • 批准号:
    10706006
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Bone-Adipose Interactions During Skeletal Anabolism
骨骼合成代谢过程中骨-脂肪相互作用
  • 批准号:
    10368975
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
BCCMA: Foundational Research to Act Upon and Resist Conditions Unfavorable to Bone (FRACTURE CURB): Combined long-acting PTH and calcimimetics actions on skeletal anabolism
BCCMA:针对和抵抗不利于骨骼的条件的基础研究(遏制骨折):长效 PTH 和拟钙剂联合作用对骨骼合成代谢的作用
  • 批准号:
    10365254
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Bone-Adipose Interactions During Skeletal Anabolism
骨骼合成代谢过程中骨-脂肪相互作用
  • 批准号:
    10202896
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
BCCMA: Foundational Research to Act Upon and Resist Conditions Unfavorable to Bone (FRACTURE CURB): Combined long-acting PTH and calcimimetics actions on skeletal anabolism
BCCMA:针对和抵抗不利于骨骼的条件的基础研究(遏制骨折):长效 PTH 和拟钙剂联合作用对骨骼合成代谢的作用
  • 批准号:
    10531570
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Dissecting molecular mechanisms implicated in age- and osteoarthritis-related decline in anabolism in articular cartilage
剖析与年龄和骨关节炎相关的关节软骨合成代谢下降有关的分子机制
  • 批准号:
    10541847
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Dissecting molecular mechanisms implicated in age- and osteoarthritis-related decline in anabolism in articular cartilage
剖析与年龄和骨关节炎相关的关节软骨合成代谢下降有关的分子机制
  • 批准号:
    10319573
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Dissecting molecular mechanisms implicated in age- and osteoarthritis-related decline in anabolism in articular cartilage
剖析与年龄和骨关节炎相关的关节软骨合成代谢下降有关的分子机制
  • 批准号:
    10062790
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
Promotion of NAD+ anabolism to promote lifespan
促进NAD合成代谢以延长寿命
  • 批准号:
    DE170100628
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 32万
  • 项目类别:
    Discovery Early Career Researcher Award
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了