课题基金 / 基金详情

PROTEIN FUNCTIONAL ANNOTATION

PROTEIN FUNCTIONAL ANNOTATION
蛋白质功能注释
批准号：
7955521
负责人：
MATTHEW P JACOBSON
金额：
$0.89万
依托单位：
UNIVERSITY OF CALIFORNIA, SAN FRANCISCO
依托单位国家：
美国
项目类别：
财政年份：
2009
资助国家：
美国
项目状态：
已结题
起止时间：
2009-07-01 至 2010-06-30
来源：
https://reporter.nih.gov/project-details/7955521
关键词：
AreaBindingComputer Retrieval of Information on Scientific Projects DatabaseDockingFundingGrantHomology ModelingImageryInformaticsInstitutionLigandsMethodsRelative (related person)ResearchResearch PersonnelResourcesSourceStructureSurfaceTestingUnited States National Institutes of Healthbasebiocomputingmolecular mechanicsnumb protein

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
这个子项目是许多研究子项目中利用 资源由NIH/NCRR资助的中心拨款提供。子项目和 调查员(PI)可能从NIH的另一个来源获得了主要资金， 并因此可以在其他清晰的条目中表示。列出的机构是 该中心不一定是调查人员的机构。 大量的蛋白质已经被测序，它们的结构 和功能还没有被正确地描述。我们使用同源建模， 基于对接和分子力学广义玻恩表面积(MM-GBSA) 计算相对结合能和代谢物配基排序的方法。这些 化合物随后在UIUC的Gerlt实验室进行测试。
英文摘要
This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. The subproject and investigator (PI) may have received primary funding from another NIH source, and thus could be represented in other CRISP entries. The institution listed is for the Center, which is not necessarily the institution for the investigator. An enormous number of proteins have been sequenced and their structure and function have not been correctly characterized. We use homology modeling, docking and molecular-mechanics generalized Born surface area (MM-GBSA) based method to calculate relative binding energy and rank metabolite ligands. These compounds are subsequently tested in the Gerlt's lab at UIUC.
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会议论文
Modeling Project
CORRELATED MOTIONS AND ALLOSTERY
REFINEMENT AND RESCORING THE DOCKING RESULTS
PROTEIN FUNCTIONAL ANNOTATION
国内基金
海外基金
帽结合蛋白(cap binding protein)调控乙烯信号转导的分子机制
  • 批准号：
    32170319
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    58.00万元
  • 批准年份：
    2021
  • 负责人：
    董春海
  • 依托单位：
    青岛农业大学
帽结合蛋白（cap binding protein）调控乙烯信号转导的分子机制
  • 批准号：
    --
  • 项目类别：
    --
  • 资助金额：
    58万元
  • 批准年份：
    2021
  • 负责人：
    董春海
  • 依托单位：
    青岛农业大学
ID1 (Inhibitor of DNA binding 1) 在口蹄疫病毒感染中作用机制的研究
番茄EIN3-binding F-box蛋白2超表达诱导单性结实和果实成熟异常的机制研究
  • 批准号：
    31372080
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    80.0万元
  • 批准年份：
    2013
  • 负责人：
    杨迎伍
  • 依托单位：
    重庆大学