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ROSETTA BASED MODELING OF CRYO-EM MAP

ROSETTA BASED MODELING OF CRYO-EM MAP
基于 ROSETTA 的冷冻电镜图建模
批准号：
8361083
负责人：
DAVID BAKER
金额：
$4.9万
依托单位：
BAYLOR COLLEGE OF MEDICINE
依托单位国家：
美国
项目类别：
财政年份：
2011
资助国家：
美国
项目状态：
已结题
起止时间：
2011-01-01 至 2011-12-31
来源：
https://reporter.nih.gov/project-details/8361083
关键词：
Cryoelectron MicroscopyElectron MicroscopyFundingGrantMapsMethodsModelingNational Center for Research ResourcesPrincipal InvestigatorResearchResearch InfrastructureResolutionResourcesSourceUnited States National Institutes of Healthbasecostdensitymacromoleculerestraint

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
这个子项目是许多利用资源的研究子项目之一 由NIH/NCRR资助的中心拨款提供。子项目的主要支持 而子项目的主要调查员可能是由其他来源提供的， 包括其它NIH来源。 列出的子项目总成本可能 代表子项目使用的中心基础设施的估计数量， 而不是由NCRR赠款提供给子项目或子项目工作人员的直接资金。 CryoEM能够将密度图解析至3.5至5埃分辨率。一个挑战是建立强大而准确的模型。我们正在探索使用Rosetta和cryoEM图约束来优化通过各种方法构建的初始模型。
英文摘要
This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. Primary support for the subproject and the subproject's principal investigator may have been provided by other sources, including other NIH sources. The Total Cost listed for the subproject likely represents the estimated amount of Center infrastructure utilized by the subproject, not direct funding provided by the NCRR grant to the subproject or subproject staff. CryoEM is capable of resolving density map to 3.5 to 5 Angstrom resolution. A challenge is to build robust and accurate model. We are exploring the use of Rosetta with cryoEM map restraints to optimize initial model which was built by a variety of methods.
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会议论文
De Novo Design of Minibinder Antagonists for COVID-19 and Future Pandemics
  • 批准号：
    10296596
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $72.36万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    DAVID BAKER
  • 依托单位：
    UNIVERSITY OF WASHINGTON
De Novo Design of Minibinder Antagonists for COVID-19 and Future Pandemics
  • 批准号：
    10460648
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $71.39万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    DAVID BAKER
  • 依托单位：
    UNIVERSITY OF WASHINGTON
De Novo Design of Minibinder Antagonists for COVID-19 and Future Pandemics
  • 批准号：
    10672446
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $70.38万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    DAVID BAKER
  • 依托单位：
    UNIVERSITY OF WASHINGTON
Project 4: Novel reagent development to enable molecular characterization
  • 批准号：
    10359195
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $44.88万
  • 财政年份：
    2020
  • 负责人：
    DAVID BAKER
  • 依托单位：
    UNIVERSITY OF WASHINGTON
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