Construction of a ZIKV-host protein-protein interaction network
ZIKV-宿主蛋白-蛋白相互作用网络的构建
基本信息
- 批准号:9338992
- 负责人:
- 金额:$ 24.53万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2017
- 资助国家:美国
- 起止时间:2017-08-16 至 2019-07-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:AfricanAlgorithmsBioinformaticsBiological AssayCambodianCaribbean regionCell DeathCellsCo-ImmunoprecipitationsCountryCoupledCulicidaeDataData SetDengue VirusDevelopmentEmbryoEtiologyEventFamilyFlavivirusGlycoproteinsGuillain-Barré SyndromeHomologous GeneHumanImmunoblot AnalysisImmunoprecipitationIndividualInfectionIntegration Host FactorsInternationalJapanese encephalitis virusLabelLatin AmericaLentivirus InfectionsLife Cycle StagesLinkMacaca mulattaMicrocephalyMissionMitotic Cell CycleMolecularMonkeysMusNational Institute of Allergy and Infectious DiseaseNeurologicNewborn InfantOpen Reading FramesPathogenesisPathway interactionsPlayProcessProteinsProteomePublic HealthPublishingRNA VirusesReagentReportingResolutionRoleSentinelSerial PassageSeriesStructureSymptomsTestingTicksTimeTropismUgandaValidationViral ProteinsVirusVirus DiseasesWest Nile virusYellow fever virusZika Virusbasecyanine dye 5fetalforestimprovedin vivoinduced pluripotent stem cellnerve stem cellnew therapeutic targetnovel therapeuticsnovel vaccinespathogenprogenitorprotein protein interactionpublic health emergencysuccesstherapeutic targettranscriptome sequencingvirus host interactionyeast protein
项目摘要
Zika virus (ZIKV), a mosquito-borne flavivirus, is now reported to be circulating in 26 countries and territories in
Latin America and the Caribbean. While infected individuals can often be asymptomatic or have only mild
symptoms, emerging evidence starts to link ZIKV infection to fetal and newborn microcephaly and serious
neurological complications, such as Guillain-Barré syndrome. The WHO declared a Public Health Emergency of
International Concern on Feb 1 of 2016. Though the structure, tropism and pathogenesis of ZIKV are largely
unknown, several recent studies started to shed lights on the etiology of the virus. Indeed, recent studies
published by Ming and colleagues demonstrated that ZIKV specifically infect human neuronal progenitor cells.
The next important step is to elucidate the molecular mechanism of ZIKV-host interactions. It has been well
documented that once a virus enters the host cell, it hijacks the cellular machineries, mainly via direct, physical
contacts with host proteins. Therefore, construction of a ZIKV-host protein-protein interaction network will greatly
facilitate our understanding of the molecular mechanism of ZIKV life cycle. In addition, comparison of the ZIKV-
host interactions with dengue virus (DENV)-host interactions will provide us important clues to identify novel
therapeutic targets. Specifically, we plan to: 1) Construct ZIKV and DENV-host protein-protein interaction
networks; 2) Predict which host factor(s) plays an important role in ZIKV-host interactions; and 3) Validate newly
identified ZIKV-host PPIs using cell-based approaches. The success of this project will provide us a global PPI
network between ZIKV and human proteome. The comparison between ZIKV-host and DENV-host PPI networks
will improve the likelihood for us to identify important host factors and/or pathways that are commonly exploited
by the flavivirus. We believe that PPI datasets will serve as an important stepping stone towards identifying novel
drug targets that will greatly facilitate development of novel therapeutics and vaccines.
寨卡病毒(ZIKV)是一种由蚊子传播的黄病毒,据报道目前正在26个国家和地区传播。
拉丁美洲和加勒比地区。虽然感染者通常没有症状或只有轻微的
症状,新的证据开始将ZIKV感染与胎儿和新生儿小头畸形和严重的
神经系统并发症,如格林-巴利综合征。世界卫生组织宣布中国进入公共卫生紧急状态
2016年2月1日国际关注。虽然ZIKV的结构、嗜性和致病机理在很大程度上
未知的是,最近的几项研究开始揭示该病毒的病原学。事实上,最近的研究
明和他的同事发表的文章证明了ZIKV特异性地感染人类神经前体细胞。
下一步重要的工作是阐明ZIKV与宿主相互作用的分子机制。一切都很好
据记载,一旦病毒进入宿主细胞,它就会劫持细胞机器,主要是通过直接的、物理的
与宿主蛋白质接触。因此,构建ZIKV-宿主蛋白-蛋白质相互作用网络将具有重要意义
有助于我们理解ZIKV生命周期的分子机制。此外,ZIKV的比较-
宿主与登革病毒(DENV)的相互作用将为我们提供重要线索来识别新的
治疗靶点。具体来说,我们计划:1)构建ZIKV和DENV-宿主蛋白-蛋白质相互作用
网络;2)预测哪些宿主因素(S)在ZIKV-宿主相互作用中起重要作用;3)新验证
使用基于细胞的方法确定ZIKV宿主PPI。这个项目的成功将为我们提供一个全球性的PPI
ZIKV与人类蛋白质组之间的网络。ZIKV-HOST和DENV-HOST PPI网络的比较
将提高我们识别重要的宿主因子和/或通常被利用的途径的可能性
被黄病毒感染。我们相信,PPI数据集将成为识别小说的重要踏脚石
药物靶点将极大地促进新疗法和疫苗的开发。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Heng Zhu其他文献
Heng Zhu的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('Heng Zhu', 18)}}的其他基金
Project 3-Proteomic Analysis of Explanted Livers with characterization of Autoantigens
项目 3 - 外植肝脏的蛋白质组学分析及自身抗原的表征
- 批准号:
10356015 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Project 3-Proteomic Analysis of Explanted Livers with characterization of Autoantigens
项目 3 - 外植肝脏的蛋白质组学分析及自身抗原的表征
- 批准号:
10560561 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Project 3-Proteomic Analysis of Explanted Livers with characterization of Autoantigens
项目 3 - 外植肝脏的蛋白质组学分析及自身抗原的表征
- 批准号:
10093988 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Proteome-wide analysis of AD-associated SNPs
AD 相关 SNP 的全蛋白质组分析
- 批准号:
10405083 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Proteome-wide analysis of AD-associated SNPs
AD 相关 SNP 的全蛋白质组分析
- 批准号:
10171751 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Proteome-wide analysis of AD-associated SNPs
AD 相关 SNP 的全蛋白质组分析
- 批准号:
9789168 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
TCP1: ANALYSIS OF LYSINE MODIFICATION USING PROTEIN MICROARRAYS
TCP1:使用蛋白质微阵列分析赖氨酸修饰
- 批准号:
7724685 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
TCP1: ANALYSIS OF LYSINE MODIFICATION USING PROTEIN MICROARRAYS
TCP1:使用蛋白质微阵列分析赖氨酸修饰
- 批准号:
7622839 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Structural Protein Networks ("Interactome") in Herpesviruses
疱疹病毒中的结构蛋白网络(“Interactome”)
- 批准号:
7132444 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Structural Protein Networks ("Interactome") in Herpesviruses
疱疹病毒中的结构蛋白网络(“Interactome”)
- 批准号:
7268146 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
相似海外基金
Novel Data Structures And Scalable Algorithms For High Throughput Bioinformatics
高通量生物信息学的新颖数据结构和可扩展算法
- 批准号:
RGPIN-2019-06640 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Bioinformatics Algorithms for Protein Interactions and Applications
蛋白质相互作用和应用的生物信息学算法
- 批准号:
RGPIN-2021-03978 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Novel Data Structures And Scalable Algorithms For High Throughput Bioinformatics
高通量生物信息学的新颖数据结构和可扩展算法
- 批准号:
RGPIN-2019-06640 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Bioinformatics Algorithms for Protein Interactions and Applications
蛋白质相互作用和应用的生物信息学算法
- 批准号:
RGPIN-2021-03978 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Bioinformatics Algorithms
生物信息学算法
- 批准号:
CRC-2017-00215 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Canada Research Chairs
Bioinformatics Algorithms and Software for Proteomics
蛋白质组学生物信息学算法和软件
- 批准号:
RGPIN-2016-03998 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Novel Data Structures And Scalable Algorithms For High Throughput Bioinformatics
高通量生物信息学的新颖数据结构和可扩展算法
- 批准号:
RGPIN-2019-06640 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Bioinformatics algorithms
生物信息学算法
- 批准号:
CRC-2017-00215 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Canada Research Chairs
Bioinformatics algorithms
生物信息学算法
- 批准号:
CRC-2017-00215 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Canada Research Chairs
Bioinformatics Algorithms and Software for Proteomics
蛋白质组学生物信息学算法和软件
- 批准号:
RGPIN-2016-03998 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 24.53万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual