A functional evolutionary genetic approach to combat viral infection
对抗病毒感染的功能进化遗传学方法
基本信息
- 批准号:10664966
- 负责人:
- 金额:$ 114.8万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2020
- 资助国家:美国
- 起止时间:2020-09-30 至 2025-07-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:AnimalsAreaAtlasesBiochemicalBiologicalBiologyBiomedical ResearchCarnivoraCellsChiropteraDevelopmentEbola virusGenesGeneticGenetic ScreeningGoalsHumanImmune responseImmunologyInfluenza A virusInterferonsMammalsMedicalMolecularNatural ImmunityOutcomePrimary Cell CulturesPrimatesProteinsRodentSARS coronavirusTestingViralViral GenesViral GenomeViral ProteinsVirusVirus DiseasesZoonosesantiviral drug developmentarms racecombatefficacy validationepidemic virusgenetic approachhuman modelmouse modelnovelpandemic viruspathogenic virusresponsetherapeutic developmentvirology
项目摘要
Project Summary
Humans are under increasing threat from viruses that spill over from animal reservoirs. Most of
these viral diseases lack targeted treatments. We speculate that this unmet medical need might
be addressable by first understanding the evolutionary principles underlying antiviral immune
responses. A major component of innate immunity in mammals is the interferon response.
Interferon induces hundreds of genes, many of which encode effector proteins that suppress
viral infection. In mammals, these antiviral effectors are rapidly evolving, most likely in
response to the genetic "arms race" continually occurring between virus and host. Further,
certain mammalian orders, such as primates, rodents, bats, and carnivores, are particularly rich
in viruses that have the potential to spill over into humans. We hypothesize that the genomes of
these viral zoonotic reservoirs encode unique antiviral effectors that may be harnessed to
combat human viral pathogens. The goals of this project are to identify, characterize, and
validate the efficacy of novel antiviral proteins from diverse non-model mammalian species.
State-of-the-art genetic screening platforms will be used to discover antiviral genes in primary
cell cultures obtained from multiples species in the following mammalian orders: Primate,
Rodentia, Chiroptera, and Carnivora. Validated effectors will be characterized mechanistically
with a suite of virological, biochemical, molecular, and cell biological approaches. The potential
for these effectors to suppress human viruses will be tested in murine models of human viral
disease. Outcomes will include the creation of the first comprehensive Mammalian Antiviral
Protein Atlas, the discovery of new genetically-encoded antiviral mechanisms, and proof-of-
concept that human viral disease can be thwarted by naturally occurring proteins from other
species. The impact of this proposal will be the development of a new area of biomedical
research at the intersection of virology, immunology, and evolutionary biology. Long term
prospects include harnessing the results of these studies to inspire alternative approaches to
antiviral drug development.
项目摘要
人类正受到来自动物宿主的病毒的日益严重的威胁。大部分
这些病毒性疾病缺乏针对性的治疗。我们推测这种未满足的医疗需求可能
通过首先了解抗病毒免疫的进化原理,
应答哺乳动物先天免疫的一个主要组成部分是干扰素反应。
干扰素诱导数百种基因,其中许多编码抑制
病毒感染在哺乳动物中,这些抗病毒效应物正在迅速进化,最有可能是在
病毒和宿主之间不断发生的遗传“军备竞赛”的反应。此外,本发明还
某些哺乳动物目,如灵长类、啮齿类、蝙蝠和食肉动物,
有可能传染给人类的病毒我们假设,
这些病毒性人畜共患病储库编码独特的抗病毒效应物,
对抗人类病毒病原体。该项目的目标是识别、表征和
验证来自不同非模式哺乳动物物种的新型抗病毒蛋白的功效。
最先进的遗传筛查平台将用于在原发性肝癌中发现抗病毒基因。
细胞培养物得自以下哺乳动物目的多个物种:灵长类,
啮齿目,翼手目,食肉目。将对经确认的效应器进行机械表征
一套病毒学、生物化学、分子和细胞生物学方法。的潜在
将在人类病毒感染的鼠模型中测试这些效应物抑制人类病毒的能力。
疾病成果将包括创建第一个全面的哺乳动物抗病毒药物
蛋白质图谱,新的基因编码的抗病毒机制的发现,以及
人类病毒性疾病可以通过来自其他病毒的天然蛋白质来阻止。
物种这一提议的影响将是生物医学新领域的发展。
病毒学、免疫学和进化生物学的交叉研究。长期
前景包括利用这些研究的结果来启发替代方法,
抗病毒药物开发。
项目成果
期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
CRISPR screening reveals a dependency on ribosome recycling for efficient SARS-CoV-2 programmed ribosomal frameshifting and viral replication.
- DOI:10.1016/j.celrep.2023.112076
- 发表时间:2023-02-28
- 期刊:
- 影响因子:8.8
- 作者:
- 通讯作者:
Laboratory Action Plan for Emerging SARS-CoV-2 Variants.
新兴 SARS-CoV-2 变种实验室行动计划。
- DOI:10.1093/clinchem/hvab020
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:9.3
- 作者:Filkins,Laura;SoRelle,JeffreyA;Schoggins,John;Park,JasonY
- 通讯作者:Park,JasonY
Interferon inhibits a model RNA virus via a limited set of inducible effector genes.
- DOI:10.15252/embr.202356901
- 发表时间:2023-09-06
- 期刊:
- 影响因子:7.7
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
John W. Schoggins其他文献
Development of a mutant aerosolized ACE2 that neutralizes SARS-CoV-2 emin vivo/em
开发一种在体内中和 SARS-CoV-2 的突变体雾化 ACE2
- DOI:
10.1128/mbio.00768-24 - 发表时间:
2024-04-29 - 期刊:
- 影响因子:4.700
- 作者:
Daniel L. Kober;Marley C. Caballero Van Dyke;Jennifer L. Eitson;Ian N. Boys;Matthew B. McDougal;Daniel M. Rosenbaum;John W. Schoggins;Peter Palese - 通讯作者:
Peter Palese
A CRISPR screen identifies IFI6 as an ER-resident interferon effector that blocks flavivirus replication
CRISPR 筛选确定 IFI6 为一种阻断黄病毒复制的内质网驻留干扰素效应因子
- DOI:
10.1038/s41564-018-0244-1 - 发表时间:
2018-09-17 - 期刊:
- 影响因子:19.400
- 作者:
R. Blake Richardson;Maikke B. Ohlson;Jennifer L. Eitson;Ashwani Kumar;Matthew B. McDougal;Ian N. Boys;Katrina B. Mar;Pamela C. De La Cruz-Rivera;Connor Douglas;Genevieve Konopka;Chao Xing;John W. Schoggins - 通讯作者:
John W. Schoggins
Identification of Atovaquone as and Mebendazole as Repurposed Drugs with Antiviral Activity against SARS-CoV-2 (Version 5)
鉴定阿托伐醌和甲苯咪唑为具有抗 SARS-CoV-2 病毒活性的再利用药物(版本 5)
- DOI:
10.33774/chemrxiv-2021-b3fv1-v5 - 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
M. Ahmed;A. Farag;Ping Wang;Ian N. Boys;Jennifer L. Eitson;Maikke B. Ohlson;Wenchun Fan;Matthew B. McDougal;John W. Schoggins;Hesham A. Sadek - 通讯作者:
Hesham A. Sadek
STT3A-mediated mega protein complex assembly during dengue and Zika virus infection
登革热和寨卡病毒感染期间由STT3A介导的大型蛋白质复合物组装
- DOI:
10.1016/j.isci.2025.112535 - 发表时间:
2025-06-20 - 期刊:
- 影响因子:4.100
- 作者:
Tao Liu;Natasha W. Hanners;Huangheng Tao;Claudia Szabo;Dao Xu;Wei Lin;John W. Schoggins;Nan Yan;Jianjun Wu - 通讯作者:
Jianjun Wu
John W. Schoggins的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('John W. Schoggins', 18)}}的其他基金
Cell intrinsic antiviral mechanisms targeting human enteroviruses
针对人类肠道病毒的细胞内在抗病毒机制
- 批准号:
10449724 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Cell intrinsic antiviral mechanisms targeting human enteroviruses
针对人类肠道病毒的细胞内在抗病毒机制
- 批准号:
10595616 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
A functional evolutionary genetic approach to combat viral infection
对抗病毒感染的功能进化遗传学方法
- 批准号:
10010238 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
A functional evolutionary genetic approach to combat viral infection
对抗病毒感染的功能进化遗传学方法
- 批准号:
10238787 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
A functional evolutionary genetic approach to combat viral infection
对抗病毒感染的功能进化遗传学方法
- 批准号:
10468088 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Interactions between type I and III interferon during resolution of HCV infection
I 型和 III 型干扰素在 HCV 感染消退过程中的相互作用
- 批准号:
8280675 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Interactions between type I and III interferon during resolution of HCV infection
I 型和 III 型干扰素在 HCV 感染消退过程中的相互作用
- 批准号:
8816087 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Interactions between type I and III interferon during resolution of HCV infection
I 型和 III 型干扰素在 HCV 感染消退过程中的相互作用
- 批准号:
8639566 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Interactions between type I and III interferon during resolution of HCV infection
I 型和 III 型干扰素在 HCV 感染消退过程中的相互作用
- 批准号:
8588413 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
相似国自然基金
层出镰刀菌氮代谢调控因子AreA 介导伏马菌素 FB1 生物合成的作用机理
- 批准号:2021JJ40433
- 批准年份:2021
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
寄主诱导梢腐病菌AreA和CYP51基因沉默增强甘蔗抗病性机制解析
- 批准号:32001603
- 批准年份:2020
- 资助金额:24.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
AREA国际经济模型的移植.改进和应用
- 批准号:18870435
- 批准年份:1988
- 资助金额:2.0 万元
- 项目类别:面上项目
相似海外基金
Onboarding Rural Area Mathematics and Physical Science Scholars
农村地区数学和物理科学学者的入职
- 批准号:
2322614 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Standard Grant
TRACK-UK: Synthesized Census and Small Area Statistics for Transport and Energy
TRACK-UK:交通和能源综合人口普查和小区域统计
- 批准号:
ES/Z50290X/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Research Grant
Wide-area low-cost sustainable ocean temperature and velocity structure extraction using distributed fibre optic sensing within legacy seafloor cables
使用传统海底电缆中的分布式光纤传感进行广域低成本可持续海洋温度和速度结构提取
- 批准号:
NE/Y003365/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Research Grant
Point-scanning confocal with area detector
点扫描共焦与区域检测器
- 批准号:
534092360 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Major Research Instrumentation
Collaborative Research: Scalable Manufacturing of Large-Area Thin Films of Metal-Organic Frameworks for Separations Applications
合作研究:用于分离应用的大面积金属有机框架薄膜的可扩展制造
- 批准号:
2326714 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Standard Grant
Collaborative Research: Scalable Manufacturing of Large-Area Thin Films of Metal-Organic Frameworks for Separations Applications
合作研究:用于分离应用的大面积金属有机框架薄膜的可扩展制造
- 批准号:
2326713 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Standard Grant
Unlicensed Low-Power Wide Area Networks for Location-based Services
用于基于位置的服务的免许可低功耗广域网
- 批准号:
24K20765 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
RAPID: Collaborative Research: Multifaceted Data Collection on the Aftermath of the March 26, 2024 Francis Scott Key Bridge Collapse in the DC-Maryland-Virginia Area
RAPID:协作研究:2024 年 3 月 26 日 DC-马里兰-弗吉尼亚地区 Francis Scott Key 大桥倒塌事故后果的多方面数据收集
- 批准号:
2427233 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Standard Grant
Postdoctoral Fellowship: OPP-PRF: Tracking Long-Term Changes in Lake Area across the Arctic
博士后奖学金:OPP-PRF:追踪北极地区湖泊面积的长期变化
- 批准号:
2317873 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Standard Grant
RAPID: Collaborative Research: Multifaceted Data Collection on the Aftermath of the March 26, 2024 Francis Scott Key Bridge Collapse in the DC-Maryland-Virginia Area
RAPID:协作研究:2024 年 3 月 26 日 DC-马里兰-弗吉尼亚地区 Francis Scott Key 大桥倒塌事故后果的多方面数据收集
- 批准号:
2427232 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 114.8万 - 项目类别:
Standard Grant