Monospecific monoclonal antibodies against human protein complexes on an interactome-wide scale.

在相互作用组范围内针对人类蛋白质复合物的单特异性单克隆抗体。

• 批准号: 9202440
• 负责人: John Paul LaCava
• 金额: $ 29.43万
• 依托单位: CDI LABORATORIES, INC.
• 依托单位国家: 美国
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 美国
• 起止时间: 2016-08-24 至 2017-07-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://reporter.nih.gov/project-details/9202440
• 关键词: Antibodies; Antibody Formation; Antigens; Cancer Patient; Cancerous; Capital; Cataloging; Catalogs; Cell Line; Cells; Clinical; Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats; Collection; Complex; Detection; Diagnostic; Diagnostics Research; Disease; Epitopes; Exhibits; Generations; Genomics; Goals; Hela Cells; Human; Immunization; Immunoprecipitation; Injection of therapeutic agent; Laboratories; Length; Link; Malignant Neoplasms; Market Research; Mass Spectrum Analysis; Methods; Mining; Monoclonal Antibodies; Mus; Outcome; Patients; Performance; Phase; Production; Protein Array; Protein Microchips; Proteins; Proteome; Reagent; Research; Sampling; Science; Small Business Technology Transfer Research; Specificity; Techniques; Testing; Therapeutic; Tissues; Validation; Work; base; cancer cell; human tissue; improved; link protein; member; novel; promoter; protein complex; protein protein interaction; scale up; screening; therapeutic target; tissue culture; tissue/cell culture; transcription factor

Project Summary    Antibodies can facilitate the study of associations between different proteins in the cell using a  technique  known  as  immunoprecipitation  (IP).  This  approach  can  reveal  differences  in  protein  associations  present  in  healthy  vs.  diseased  tissues,  provide  targets  for  diagnostics  and  therapeutics, and reveal protein--protein interfaces that could be druggable targets. It is widely  recognized that a lack of high quality antibodies against human proteins is negatively impacting  biomedical  science.  CDI  Laboratories,  Inc.,  has  developed  a  pipeline  that  employs  the  largest  content  full--length  human  protein  array  to  generate  quantifiably  monospecific  mouse  monoclonal  antibodies  (mAbs),  and  has  generated  a  large  number  of  mAbs  against  human  transcription  factors  (TFs).  The  PI  of  this  project  has  developed  methods  that  enable  and  optimize  the  capture  of  endogenous  protein  complexes  by  IP  in  conjunction  with  mass  spectrometry  analysis.  In  Phase  I  of  this  STTR  project,  Aim  1  will  characterize  anti--human  TF  mAbs  for  their  ability  to  IP  endogenous  cancer--related  TF  protein  complexes.  This  will  be  accomplished  initially  using  human  tissue  culture  cell  lines  to  establish  quantitative  functional  metrics  of  the  mAbs,  and  then  applied  to  protein  complexes  isolated  from  patient-­‐derived  cancers. In Aim 2, cancer--related TFs will be used as bait for IP of native complexes, and novel  mAbs  will  be  generated  by  immunization  with  the  endogenous  TF  protein  complexes.  The  target  specificity  of  the  mAbs  will  be  determined  using  the  human  proteome  array,  yielding  a  catalog  of  new,  high  quality  mAbs  with  which  to  study  protein-­‐protein  interactions  within  cancer cells. The long term goal of the project, which will be expanded and achieved in Phase II,  is the production of larger numbers of high quality mAbs against native human proteins that are  normally found as constituents of complexes in healthy and cancerous cells.

项目摘要   抗体可以使用A促进细胞中不同蛋白质之间的关联的研究 被称为免疫沉淀（IP）的技术。这种方法可以揭示蛋白质的差异 健康与解剖组织中存在的关联，为诊断和 治疗，并揭示可能是可拖动靶标的蛋白质 - 蛋白质界面。它是广泛的 认识到，针对人蛋白的高质量抗体稀缺对人类蛋白质产生负面影响 生物医学科学。 CDI Laboratories，Inc。开发了一条管道，该管道是最大的雇员 内容全长的人蛋白阵列以产生量化的单特异性小鼠 单克隆抗体（mAbs），已经对人产生了大量mab 转录因子（TFS）。该项目的PI开发了启用和 通过IP结合质量来优化捕获内源蛋白复合物的捕获 光谱分析。在此STTR项目的第一阶段，AIM 1将表征反人类TF MAB的IP内源性癌症 - 与TF蛋白复合物的能力。这将是 最初使用人体组织培养细胞系来建立定量功能 mAb的指标，然后应用于从患者中分离出的蛋白质复合物 癌症。在AIM 2中，与癌症相关的TF将用作本地复合物IP的诱饵，而新颖 用内源性TF蛋白复合物免疫产生mAb。这 mAb的目标特异性将使用人蛋白质组阵列确定，产生 新的，高质量的mAb目录，研究蛋白质 - 蛋白质 - 蛋白质相互作用 癌细胞。该项目的长期目标将在第二阶段扩展和实现， 是针对本地人类蛋白的生产大量的高质量mAb 通常被认为是健康和取消细胞中配合物的成分。