Bases génétiques et physiologiques des performances aquicoles de croissance, de reproduction et de résistance aux infections opportunistes chez l'omble de fontaine

点击翻译按钮获取中文摘要

Au Canada, l'aquaculture d'eau douce est dominée par la production de truite arc-en-ciel et d'omble de fontaine. Au Québec, la production d'omble de fontaine occupe une place particulière et vise principalement le marché de l'ensemencement. Comme pour le reste de l'industrie agro-alimentaire, le développement de l'aquaculture passe par une utilisation accrue des nouveaux outils moléculaires qui peuvent être utilisés en sélection assistée par des marqueurs génétiques. Les programmes de sélection animale visent l'amélioration de l'efficacité, du rendement et de la durabilité de la production, mais sont souvent limités par un manque d'information quant aux bases génétiques sous-jacentes à l'expression des phénotypes d'intérêt. En utilisant l'omble de fontaine comme modèle expérimental, nos objectifs sont : i) d'identifier les gènes associés à l'expression de traits phénotypiques d'intérêt, ii) de vérifier les effets de la sélection basée sur l'élimination des individus à maturation précoce sur le succès reproducteur et iii) d'évaluer des stratégies alternatives de prévention des infections opportunistes basées sur la sélection de traits liés à la résistance et à une meilleure connaissance des communautés bactériennes mises en cause. À court terme, ces connaissances permettront d'améliorer les processus de sélection en identifiant des marqueurs moléculaires et/ou des gènes associés aux traits fonctionnels, la qualité du cheptel de géniteurs et la gestion sanitaire des élevages. À plus long terme, l'identification des interactions génétiques sous-jacentes à l'expression de traits fonctionnels améliorera notre compréhension des relations génotype-phénotype, voie future du développement de stratégies d'intervention génétique en production. Le modèle de recherche s'appuie sur la production d'omble de fontaine, mais nombre de résultats seront directement exportables vers la production d'autres salmonidés. Ainsi, les travaux de cartographie énétique pourront directement servir à la cartographie comparative entre l'omble de fontaine et les autres espèces de salmonidés et ceux sur l'effet du mode de sélection sur le succès reproducteur et des stratégies alternatives de soins de santé seront d'intérêt pour l'ensemble des producteurs de salmonidés.