Etude de la spéciation écologique par une approche post-génomique intégrée.

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L'objectif à long terme de mon programme de recherche est d'élucider le rôle des facteurs biogéographiques, environnementaux et évolutifs sur les changements génétiques, phénotypiques et écologiques menant à l'origine de nouvelles espèces. L'étude de populations limnétiques et benthiques de corégone (poissons, genre Coregonus, Salmonidae) est la pierre angulaire sur laquelle repose ce programme de recherche. Au cours des 5 dernières années, j'ai approfondi la compréhension des bases génomiques de la spéciation et du rôle de la sélection naturelle dans l'évolution de ces populations. Au cours des 5 prochaines années, je capitaliserai sur ces connaissances afin d'investiguer, dans un cadre post-génomique et intégrateur, l'importance de la contingence historique et de la variation à des niveaux fonctionnels d'organisation qui ont encore été très peu ou jamais étudiés dans le contexte de la spéciation chez des espèces non-modèle de vertébrés. Quatre objectifs à courts termes seront ciblés : i) Assemblage du premier génome de grand corégone; ii) Contingence historique; incidence sur le processus de spéciation écologique; iii) Divergence et parallélisme de l'épigénome; iv) Rôle du microbiome dans la divergence adaptative et la spéciation. L'originalité et l'importance prévue des travaux reposent sur le fait qu'il s'agit d'un des rares programmes de recherche à longs termes visant une pleine intégration de connaissances biogéographiques, écologiques, génétiques, et physiologiques et de l'application combinée d'approches moléculaires de fine pointe dans un contexte de spéciation. L'application d'une telle démarche au système corégone offre de l'avis de plusieurs experts dans le domaine d'excellentes opportunités d'une contribution réelle et substantielle à l'élucidation des processus de la divergence adaptative menant à la naissance de nouvelles espèces tel qu'envisagée par Darwin il y a 150 ans. D'un point de vue appliqué, la compréhension de ces mécanismes évolutifs procure une base solide afin de mieux prédire comment les organismes peuvent s'adapter aux perturbations environnementales causées par l'homme et affecter le fonctionnement des écosystèmes. Ce programme de recherche apporte de plus des connaissances de base sur la biologie du grand corégone, l'espèce de poissons d'eau douce de plus grande valeur commerciale au Canada, lesquelles pourront contribuer à une meilleure définition des unités de gestion et par le fait même, assurer la pérennité de cette importante ressource partout où l'espèce est exploitée au Canada.