Séquenceur d’ADN pour un programme de recherche intégré en écologie génomique

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Le programme de recherche des demandeurs s’insère dans une vision de biologie intégrative et d’écologie génomique faisant appel À différents types d’analyses moléculaires et pour chacun de ceux-ci, le séquençage Sanger est un incontournable. C’est dans cette optique que cette demande vise l’acquisition d’un séquenceur «Sanger » (modèle 3500, Applied Biosystems™). Compte-tenu des nombreux besoins et de la pertinence de l’analyse de type Sanger pour l’atteinte des objectifs visés par tous leurs programmes de recherche, l’acquisition de cet appareil est d’autant plus cruciale que les appareils semblables et présentement accessibles arrivent À la fin de leur durée de vie utile et que le support et pièces ne seront plus disponibles au-delÀ de 2018. Contrairement aux séquenceurs de nouvelle génération À très haut débit, l’appareil demandé ici permet des analyses de faible À moyen débit. Il est essentiel pour réaliser des études diversifiées d’envergure relativement modeste, mais néanmoins novatrices et représentant des étapes cruciales À la réalisation des programmes de recherche des demandeurs, notamment pour la mise au point de protocoles préalables À la réalisation de projets d’envergure sur les plates-formes À haut débit. Cet appareil permet aussi une grande diversité d’analyses de séquences très ciblées, par exemple de phylogénie comparative de gènes candidats, de code-barres ADN, de mise au point d’amorces et d’amplicons, mais aussi de génotypage par analyse de fragments. Les programmes de recherche réalisés par l’ensemble des chercheurs couvrent une large gamme domaines de recherche prioritaires pour le Canada, allant de la conservation de la biodiversité, les interactions hôtes-pathogènes, en passant par la gestion des pêches, la production alimentaire et forestière, la protection des écosystèmes terrestres et marins, sans oublier l’acquisition de nouvelles connaissances fondamentales reliées À la biologie des systèmes et intégrative. La recherche réalisée grâce À cet équipement revêt donc une importance évidente pour la société canadienne. L’acquisition de l’appareil demandé bonifiera donc la formation de nombreux PHQ dans plusieurs des domaines de recherche prioritaires pour le Canada. Il contribuera ainsi À fournir de la main d’oeuvre qualifiée autant pour les institutions universitaires et collégiales, que divers organismes gouvernementaux, établissements de santé et entreprises privées oeuvrant dans le domaine de l’environnement.