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基于介体烟粉虱的宏基因组学方法研究双生病毒种群多样性
结题报告
批准号:
31171814
项目类别:
面上项目
资助金额:
58.0 万元
负责人:
谢艳
依托单位:
学科分类:
C1401.植物病理学
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
张馨月、徐毅、李方方、包敏、赵丽玲、矫晓阳
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中文摘要
由烟粉虱传播的双生病毒(WTG)已在世界范围内引起多种作物的严重病害。受研究方法和技术的限制,目前WTG的研究仅限于引起作物产生严重病害、经济损失大的一类病毒,但对WTG的种群结构没有研究。本项目拟采集食性杂、具迁飞能力的传毒介体烟粉虱,从烟粉虱体内分离病毒DNA基因组,利用宏基因组学方法(Metagenomics),研究我国WTG种群多样性和变异进化规律,完善我国双生病毒种群数据库;鉴定WTG新种和新类型DNA分子;构建病毒新种和新类型DNA分子的侵染性克隆,明确其在病毒致病和病害传播中的作用;评估新病害发生流行的潜在风险。项目的开展有助于我们全面了解我国粉虱传双生病毒的种群结构、挖掘病毒新种、弄清病毒变异进化规律,同时深入开展病毒的致病性及病害流行研究,为全面预防和控制这类病毒病打下基础。
英文摘要
由烟粉虱传播的双生病毒(WTG)已在世界范围内引起多种作物的严重病害。本项目采集传毒介体烟粉虱,从烟粉虱体内分离病毒DNA基因组,利用宏基因组学方法搜索疑似双生病毒,PCR扩增病毒基因组全序列,研究我国WTG种群多样性和变异进化规律。在云南省的烟粉虱中共发现11种双生病毒,5种betasatellites,2种alphasatellites及各类缺陷型DNA小分子。双生病毒为云南烟草曲叶病毒、丁香黄脉病毒、越南丁香黄脉病毒、云南赛葵黄脉病毒、甘薯曲叶病毒、番茄黄曲叶病毒、中国番木瓜曲叶病毒、巴豆黄脉花叶病毒、中国番茄黄曲叶病毒、中国胜红蓟黄脉病毒、中国辣椒黄曲叶病毒。广西省烟粉虱中共检测9种双生病毒,2种betasatellites。分别为中国番木瓜曲叶病毒、中国胜红蓟黄脉病毒、中国番茄曲叶病毒、广西番茄曲叶病毒和巴豆黄脉花叶病毒、雾水葛金色花叶病毒、云南赛葵黄脉病毒、中国南瓜曲叶病毒、甘薯曲叶病毒,海南省烟粉虱共检测到4种病毒:中国南瓜曲叶病毒、黄花稔曲叶病毒、甘薯曲叶病毒和越南丁香黄脉病毒。浙江省烟粉虱共发现4种病毒:番茄黄曲叶病毒、甘薯曲叶病毒、乔治亚甘薯曲叶病毒、河南甘薯曲叶病毒。山东省只发现番茄黄曲叶病毒。在云南和广西的烟粉虱样品中发现一个单组份双生病毒新种,其与巴豆黄脉花叶病毒的全序列同源性最高(87%),将其命名为中国巴豆黄脉花叶病毒(Croton yellow vein mosaic China virus, CYVMCNV)。在云南和海南的烟粉虱样品中还分离到越南丁香黄脉病毒分离物,这是越南丁香黄脉病毒在我国的首次发现。病毒全基因组序列同源性比较、核酸多态性变异分析及系统进化分析发现,与植物上分离的病毒相比,烟粉虱所携带病毒的同源性较高,变异率相对较小。发现一类不编码ORF的新型缺陷型DNA小分子,全长为738nt,含有保守的茎环结构和九核苷酸TAATATTAC,互补链上还含有一个与alphasatellite类似的茎环结构和九核苷酸TAGTATTAC。序列分析发现这是一种由alphasatellite和betasatellite重组形成的新型缺陷性DNA分子,这类卫星分子在双生病毒感染的烟粉虱中普遍存在。构建了中国巴豆黄脉花叶病毒、越南丁香黄脉病毒及乔治亚甘薯曲叶病毒的侵染性克隆。研究结果丰富了我国粉虱传双生病毒的种群。
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Highly sensitive serological methods for detecting tomato yellow leaf curl virus in tomato plants and whiteflies.
用于检测番茄植株和粉虱中番茄黄曲叶病毒的高灵敏血清学方法
DOI:10.1186/1743-422x-10-142
发表时间:2013-05-06
期刊:Virology journal
影响因子:4.8
作者:Xie Y;Jiao X;Zhou X;Liu H;Ni Y;Wu J
通讯作者:Wu J
A naturally occurring defective DNA satellite associated with a monopartite begomovirus: evidence for recombination between alphasatellite and betasatellite.
与单部分 Begomovirus 相关的天然存在的缺陷 DNA 卫星:α 卫星和 Beta 卫星之间重组的证据
DOI:10.3390/v5092116
发表时间:2013-09-06
期刊:Viruses
影响因子:--
作者:Huang C;Xie Y;Zhao L;Ren H;Li Z
通讯作者:Li Z
DOI:--
发表时间:2013
期刊:植物病理学报
影响因子:--
作者:矫晓阳;周雪平;杨悦俭;谢 艳
通讯作者:谢 艳
A naturally occuring defective DNA satellite associated with a monopartite begomovirus:Evidence for recombination between alphasatellite and betasatellite
与单部分 Begomovirus 相关的天然存在的缺陷 DNA 卫星:α 卫星和 β 卫星之间重组的证据
DOI:--
发表时间:2013
期刊:Viruses 5: 2116-218
影响因子:--
作者:Yan Xie;Liling Zhao;He Ren;Zhenghe Li
通讯作者:Zhenghe Li
DOI:10.1094/pdis-01-13-0074-re
发表时间:2013-10
期刊:Plant disease
影响因子:4.5
作者:Xiaoyang Jiao;Huanran Gong;Xue-jian Liu;Yan Xie;Xue-ping Zhou
通讯作者:Xiaoyang Jiao;Huanran Gong;Xue-jian Liu;Yan Xie;Xue-ping Zhou
PAT介导的C4棕榈酰化在双生病毒致病中的作用机理
  • 批准号:
    32172357
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    谢艳
  • 依托单位:
多功能V2蛋白在新种番茄黄脉花叶病毒致病中的作用机理
  • 批准号:
    31972236
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    谢艳
  • 依托单位:
中国番茄黄化曲叶病毒卫星编码的βC1干扰植物MAPK信号途径机制研究
  • 批准号:
    31772126
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    谢艳
  • 依托单位:
Alphasatellite伴随双生病毒病害复合体的生物学功能研究
  • 批准号:
    31571977
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    62.0万元
  • 批准年份:
    2015
  • 负责人:
    谢艳
  • 依托单位:
番茄黄化曲叶病毒抑制转录水平基因沉默和DNA甲基化研究
  • 批准号:
    31371914
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万元
  • 批准年份:
    2013
  • 负责人:
    谢艳
  • 依托单位:
双生病毒卫星DNA编码的βC1蛋白抑制转录水平基因沉默研究
  • 批准号:
    31070128
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    38.0万元
  • 批准年份:
    2010
  • 负责人:
    谢艳
  • 依托单位:
我国双生病毒伴随的DNA1分子的变异及其功能研究
  • 批准号:
    30671360
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    35.0万元
  • 批准年份:
    2006
  • 负责人:
    谢艳
  • 依托单位:
与烟草曲茎病毒伴随的卫星DNA在致病中的作用机制
  • 批准号:
    30400015
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万元
  • 批准年份:
    2004
  • 负责人:
    谢艳
  • 依托单位:
国内基金
海外基金