I型聚酮合酶中酰基转移酶的分子作用机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31470212
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    88.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2102.合成生物学与生物改造技术
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Many valuable microbial medicines are biosynthesized by type I polyketide synthase (PKS). Acyltransferase (AT) domain plays an essential role to type I PKS via transfer acyl units into acyl carrier proteins (ACP) of PKS. Since incorporation of acyl units into PKS machineries is the first and rate-limiting step of biosynthesis, and determine the sturcture of polyketide,unveiling mechanism of AT under molecular level has great value. In this project, we chose four ATs of FK506 PKS from an industrial producing strain, Streptomyces sp.YN06, as a model to reveal molecular mechanism of AT. This project focus on main contents as following: (i)catalytic mechanism of AT, including substrate specificity, substrate competition, product inhibition, and kinetic assay in the transfer pathway of acyl units; (ii) relationship between structure and function, especially the effects of acyl-specific motif of AT and configuration of intermediates, (iii) evolutionary analysis of AT from different prokaryotes.Our research not only reveal the catalytic mechanism of AT under molecular level, but also may help us to improve the activities and substrate specificity by engineering of AT, resulting in an high efficiency biosynthetic pathway of microbial medicine.
许多重要的微生物药物由I型聚酮合酶(PKS)合成,酰基转移酶(AT)是其不可或缺的功能域,它负责将酰基底物转移到PKS酰基载体蛋白ACP上,该过程是I型PKS药物合成的首步决速反应,也决定了药物的分子结构,因此深入揭示AT的分子机制具有重要的科学意义和应用价值。本项目以FK506工业菌(链霉菌YN06)的PKS中4个AT(转移不同酰基)为模式研究对象,通过研究AT催化酰基转移过程中底物选择性、底物竞争性、产物抑制效应,阐明AT的催化机理;通过研究AT的酰基特异性模序、催化过程系列复合物晶体构象变化,解析其结构与功能的关系;结合其它原核生物I型PKS进行AT进化分析,研究酰基特异性模序与酰基底物选择性、催化效率之间的关系,阐释原核生物AT的分子进化。同时,基于机制研究改造AT结构,提高其催化活性和底物选择性,并强化合成通路中的前体供应,从而为建立I型PKS微生物药物高效生物合成通路奠定基础。

结项摘要

本项目以他克莫司(FK506)产生菌筑波链霉菌为研究对象,解析了I型聚酮合酶(PKS)次级代谢产物合成途径中酰基转移酶(AT)识别与转运酰基的底物选择性机制,阐述了AT上载酰基的特异性模序结构,揭示了聚酮合酶合成天然产物的生物多样性奥秘;基于上述机制,我们发现通过对AT结构域关键位点进行点突变改变酰基的选择性,从而将所需酰基引入到主链中,产生了新颖人工天然产物。 上述AT底物选择性的分子机制研究,揭示了聚酮天然化合物生物多样性的奥秘,是聚酮药物生产菌高产改造和人工设计新衍生物的重要理论基础。. 本项目已发表SCI论文6篇,尚有1篇正在修回,授权发明专利3项,培养博士生2名、硕士生2名。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
Substrate Specificity of Acyltransferase Domains for Efficient Transfer of Acyl Groups
酰基转移酶结构域的底物特异性,可有效转移酰基
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2018.01840
  • 发表时间:
    2018-08
  • 期刊:
    Frontiers in Microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Shen Jie Jie;Chen Fu;Wang Xiao Xuan;Liu Xiao Fang;Chen Xin Ai;Mao Xu Ming;Li Yong Quan
  • 通讯作者:
    Li Yong Quan
An acyltransferase domain of FK506 polyketide synthase recognizing both an acyl carrier protein and coenzymeA as acyl donors to transfer allylmalonyl and ethylmalonyl units
FK506 聚酮合酶的酰基转移酶结构域识别酰基载体蛋白和辅酶 A 作为酰基供体以转移烯丙基丙二酰基和乙基丙二酰基单位
  • DOI:
    10.1111/febs.13296
  • 发表时间:
    2015-07-01
  • 期刊:
    FEBS JOURNAL
  • 影响因子:
    5.4
  • 作者:
    Jiang, Hui;Wang, Yue-Yue;Li, Yong-Quan
  • 通讯作者:
    Li, Yong-Quan
Biochemical characterization of a malonyl specific acyltransferase domain of FK506 biosynthetic polyketide synthase
FK506 生物合成聚酮合酶的丙二酰基特异性酰基转移酶结构域的生化表征。
  • DOI:
    10.2174/0929866521666140926113322
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Protein & Peptide Letters
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Yue-Yue Wang;Yong-Quan Li;Hui Jiang
  • 通讯作者:
    Hui Jiang
Development of Series of Affinity Tags in Streptomyces.
亲和系列的开发
  • DOI:
    10.1038/s41598-017-07377-4
  • 发表时间:
    2017-07-31
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Mao XM;Sun N;Zheng Y;Li YQ
  • 通讯作者:
    Li YQ

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    张立杰

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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