D1蛋白酶是植物光合系统II中将D1蛋白前体转化为D1蛋白的酶，是近年来发现的可作为除草剂研究的新作用靶标。本项目在文献报道的斜生栅藻D1蛋白酶单晶结构数据的基础上，同源模建得到菠菜D1蛋白酶的三维结构模型，通过虚拟筛选得到高等植物D1蛋白酶抑制剂先导化合物；合理设计合成先导化合物，采用表面等离子体共振技术（SPR）研究D1蛋白酶与先导化合物之间分子识别的动力学，得到先导化合物的结合速率/离解速率/结合平衡常数和药效团等信息；根据这些分子识别的动力学数据和药效团信息，优化先导化合物分子结构并进行合成，并对这些结构经过优化的先导化合物进行杀草谱生物活性测定。通过本项目的实施，预期发现D1蛋白酶与其先导化合物之间分子识别作用的一般规律，发现新型的、具有应用价值的D1蛋白酶抑制剂。