K11泛素链修饰蛋白质底物的定量蛋白质组学筛选及其生物学功能研究

批准号:
31070673
项目类别:
面上项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
徐平
依托单位:
学科分类:
C0502.分子生物物理
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
甄蓓、洪海燕、王坤、常蕾、吴振宇、史冬梅、刘伟、张雪莉
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中文摘要
蛋白质底物赖氨酸残基的ε-氨基可为体内广泛存在的泛素蛋白的C-末端甘氨酸的羧基共价修饰形成泛素化。由于泛素本身具有7个赖氨酸,已连接到蛋白质底物上的泛素单体还可为后续的泛素分子修饰,从而形成7种不同的泛素链。蛋白质组学研究证明这7种泛素链在体内广泛存在,并具有各自特定的生物学功能。泛素化蛋白质的命运主要取决于被修饰的泛素链的长度和种类。定量蛋白质组学研究表明K11泛素链在酵母体内的丰度最高,但至今已知的K11泛素链修饰的底物只有两个。鉴定和发现特定泛素链修饰的蛋白质底物是解析这些泛素链功能的必要条件。本研究的目的是利用基因工程改造酵母的泛素基因,并在串联亲和纯化条件下只富集K11泛素链修饰的蛋白质底物,由此建立正向的K11泛素链修饰底物筛选技术,并利用定量蛋白质组学技术大规模系统鉴定K11泛素链修饰的新蛋白质底物。在此基础上系统研究K11泛素链的新生物学功能。
英文摘要
蛋白的泛素化修饰是细胞内广泛存在的一类修饰方式,具有重要的生物学意义。由于泛素本身具有7个赖氨酸,已连接到蛋白质底物上的泛素单体还可被后续的泛素分子修饰,从而形成7种不同的泛素链。蛋白质组学研究证明这7种泛素链在体内广泛存在,并具有各自特定的生物学功能。泛素化蛋白质的命运主要取决于被修饰的泛素链的长度和种类。鉴定和发现特定泛素链修饰的蛋白质底物是解析不同泛素链功能的必要条件。本研究利用基因工程改造技术,构建了双标签标记的3个泛素基因串联的基因工程菌株,考察了双标签泛素基因菌株的生长特性,及三种泛素分子的表达特性。研究并建立变性条件下带有不同标签的泛素化蛋白亲和纯化技术,考察不同标签的泛素化蛋白的纯化收率及纯度,为串联亲和纯化只富集K11泛素链修饰的蛋白质底物提供技术依据。在此基础上可有利于利用定量蛋白质组学技术大规模系统鉴定K11泛素链修饰的新蛋白质底物,系统研究K11泛素链的生物学功能。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Stable isotope labeling with amino acids in Drosophila for quantifying proteins and modifications.
果蝇中氨基酸的稳定同位素标记用于定量蛋白质和修饰。
DOI:10.1021/pr300613c
发表时间:2012-09-07
期刊:Journal of proteome research
影响因子:4.4
作者:Xu P;Tan H;Duong DM;Yang Y;Kupsco J;Moberg KH;Li H;Jin P;Peng J
通讯作者:Peng J
Systematic Analyses of the Transcriptome, Translatome, and Proteome Provide a Global View and Potential Strategy for the C-HPP
转录组、翻译组和蛋白质组的系统分析为 C-HPP 提供了全局视角和潜在策略
DOI:10.1021/pr4009018
发表时间:2014-01-01
期刊:JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
影响因子:4.4
作者:Chang, Cheng;Li, Liwei;Xu, Ping
通讯作者:Xu, Ping
Proteome atlas of human chromosome 8 and its multiple 8p deficiencies in tumorigenesis of the stomach, colon, and liver.
人类 8 号染色体的蛋白质组图谱及其在胃、结肠和肝脏肿瘤发生中的多个 8p 缺陷。
DOI:10.1021/pr300834r
发表时间:2013-01
期刊:J Proteome Res.12
影响因子:--
作者:Chang C;Li N;Liu S;He F
通讯作者:He F
Qualitative and Quantitative Expression Status of the Human Chromosome 20 Genes in Cancer Tissues and the Representative Cell Lines
人类20号染色体基因在癌组织和代表性细胞系中的定性和定量表达状况。
DOI:10.1021/pr3008336
发表时间:2013-01-01
期刊:JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
影响因子:4.4
作者:Wang,Quanhui;Wen,Bo;Liu,Siqi
通讯作者:Liu,Siqi
CAPER: a Chromosome-Assembled human Proteome browsER
CAPER:染色体组装的人类蛋白质组浏览器。
DOI:10.1021/pr300831z
发表时间:2013-01-01
期刊:JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
影响因子:4.4
作者:Guo, Feifei;Wang, Dan;He, Fuchu
通讯作者:He, Fuchu
微量肝癌组织肿瘤新抗原高效稳定深度覆盖鉴定技术研究
- 批准号:32371503
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:50万元
- 批准年份:2023
- 负责人:徐平
- 依托单位:
人α-防御素-1(HNP-1)抗菌新机制的定量蛋白质组学研究
- 批准号:31870824
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:59.0万元
- 批准年份:2018
- 负责人:徐平
- 依托单位:
基于人工杂合高亲和泛素结合蛋白的肝癌转移复发蛋白质泛素化失调分子机制的定量泛素化蛋白质组研究
- 批准号:31670834
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:60.0万元
- 批准年份:2016
- 负责人:徐平
- 依托单位:
乙型肝炎病毒x蛋白激活Rho信号途径诱发肝细胞恶性转化分子机制的定量蛋白质组学研究
- 批准号:31470809
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:85.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:徐平
- 依托单位:
利用SILAC定向筛选K63泛素连接修饰的蛋白质底物和K63泛素连接新生物学功能的系统研究
- 批准号:31170780
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:65.0万元
- 批准年份:2011
- 负责人:徐平
- 依托单位:
国内基金
海外基金
