利用SILAC定向筛选K63泛素连接修饰的蛋白质底物和K63泛素连接新生物学功能的系统研究
结题报告
批准号:
31170780
项目类别:
面上项目
资助金额:
65.0 万元
负责人:
徐平
学科分类:
C2103.生命组学技术
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
饶亚岚、常蕾、王京伟、樊锋凯、平灵艳、徐聪、邢晓华
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中文摘要
泛素是一种高度保守的小蛋白,并通过其自身C-末端甘氨酸的羧基与目的蛋白赖氨酸的ε-氨基共价结合形成泛素化。已连接到蛋白质底物上泛素单体的赖氨酸被后续的泛素分子修饰形成7种不同的泛素连接。其中K6、K11、K27、K29、K33和K48泛素连接引导蛋白质降解分子信号,而K63除主要通过蛋白质聚类、转运、DNA修复等非蛋白质降解功能调节多样的细胞生命活动过程外,也不排除其修饰个别蛋白质底物并引导降解的可能。本研究旨在根据泛素连接结构特征和多重SILAC定量蛋白质组学原理,利用双重标签标记的泛素和纯化技术系统地定向筛选K63泛素连接修饰的目标底物,结合K63泛素连接可能引导蛋白质底物降解的生物学原理定量比较鉴定可能的底物,发现并验证K63泛素连接新生物学功能,并为相关的人类疾病分子机制研究和新药研发提供思路、技术和可能的靶标。
英文摘要
本研究开发了一种正向筛选某一种泛素链特异性底物的方法,通过基因工程改造酵母的泛素基因,构建在同一细胞中两种不同亲和纯化标签标记的人工泛素基因突变体Ub K63(只保留第63位赖氨酸,其它6个赖氨酸被精氨酸替代,简称Ub K63),通过串联亲和纯化富集了高纯度、高可信的特异性泛素链修饰的底物蛋白,通过定量蛋白质组学技术大规模系统正向鉴定了特异性泛素链的底物;以期在此基础上系统研究K63泛素链的新生物学功能。
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Systematic analysis of missing proteins provides an elucidative clue to define all the protein-coding genes on human chromosome 1.
对缺失蛋白质的系统分析为定义人类 1 号染色体上的所有蛋白质编码基因提供了阐明性线索。
DOI:--
发表时间:2014
期刊:J Proteome Res.
影响因子:--
作者:Wang Q;Zhu Y;He F;Xu P
通讯作者:Xu P
DOI:--
发表时间:2012
期刊:Journal of Proteome Research
影响因子:4.4
作者:徐平;樊峰凯
通讯作者:樊峰凯
Systematic Analyses of the Transcriptome, Translatome, and Proteome Provide a Global View and Potential Strategy for the C-HPP
转录组、翻译组和蛋白质组的系统分析为 C-HPP 提供了全局视角和潜在策略
DOI:10.1021/pr4009018
发表时间:2014-01-01
期刊:JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
影响因子:4.4
作者:Chang, Cheng;Li, Liwei;Xu, Ping
通讯作者:Xu, Ping
DOI:--
发表时间:2012
期刊:Journal of Proteome Research
影响因子:4.4
作者:徐平
通讯作者:徐平
Proteome atlas of human chromosome 8 and its multiple 8p deficiencies in tumorigenesis of the stomach, colon, and liver.
人类 8 号染色体的蛋白质组图谱及其在胃、结肠和肝脏肿瘤发生中的多个 8p 缺陷。
DOI:10.1021/pr300834r
发表时间:2013-01
期刊:J Proteome Res.12
影响因子:--
作者:Chang C;Li N;Liu S;He F
通讯作者:He F
微量肝癌组织肿瘤新抗原高效稳定深度覆盖鉴定技术研究
人α-防御素-1(HNP-1)抗菌新机制的定量蛋白质组学研究
乙型肝炎病毒x蛋白激活Rho信号途径诱发肝细胞恶性转化分子机制的定量蛋白质组学研究
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