施氏假单胞菌中新型NAD非依赖性L-乳酸脱氢酶研究

批准号:
31170052
项目类别:
面上项目
资助金额:
56.0 万元
负责人:
马翠卿
依托单位:
学科分类:
C0103.微生物组学与代谢
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
姜天翼、徐友强、窦培培、张文、胡春辉、盛彬彬
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中文摘要
已报道的NAD非依赖性L-乳酸脱氢酶(L-iLDH)均以FMN为辅因子,在某些微生物L-乳酸代谢及致病过程中起重要作用。申请者基于多种微生物的比较基因组学分析与前期实验结果,推断施氏假单胞菌A1501中由lldA、lldB和lldC三个基因构成的基因簇lldABC编码一种新型多亚基蛋白,以Fe-S中心为辅因子,行使催化L-乳酸生成丙酮酸的功能。该蛋白与目前已报道的L-iLDH具有明显区别,为一种新型L-iLDH。本申请以施氏假单胞菌A1501为研究对象,克隆获得基因簇lldABC,基因敲除手段确定lldABC在施氏假单胞菌A1501 L-乳酸代谢中的关键作用;外源表达并分离纯化该新型L-iLDH,研究其基本酶学性质;生物信息学与生化分析相结合确定亚基LldA、LldB和LldC在L-iLDH催化氧化L-乳酸过程中的作用;分析该新型L-iLDH获取、传递电子过程,阐明其催化机理。
英文摘要
NAD-非依赖性L-乳酸脱氢酶(L-iLDH)在微生物L-乳酸代谢及致病过程中起重要作用。已报道的L-iLDH均为同型多聚体蛋白,以FMN为辅因子。项目组基于比较基因组学分析,推测Pseudomonas stutzeri A1501中基因簇lldABC编码一种异型多聚体蛋白LldABC,以Fe-S簇为辅因子,行使催化L-乳酸生成丙酮酸的L-iLDH功能。.P. stutzeri A1501中LldABC为膜蛋白,外源表达与分离纯化困难,项目组克隆获得lldABC,通过系统的条件优化,成功实现lldABC的外源表达,检测到L-iLDH活性;采用硫酸铵沉淀、离子交换、亲和层析等手段,得到的目的蛋白经SDS-PAGE及MALDI-TOF检测,三条条带分别与LldA、LldB和LldC相符;结合凝胶过滤色谱确定LldABC中LldA、LldB和LldC间比例为1:1:1;对LldABC的基本酶学性质及稳态动力学机制进行分析,确定LldABC催化反应遵循乒乓机制。.基因敲除、回补及酶活测定相结合,证实LldABC在菌株L-乳酸代谢中起关键作用,确定了LldABC的体内功能。lldA、lldB和lldC的敲除均会导致菌株L-乳酸代谢能力丧失,而克隆表达LldAB、LldAC和LldBC,均未检测到L-iLDH活力,证实LldA、LldB和LldC对L-iLDH功能缺一不可。吸收光谱及元素分析表明LldABC中不存在黄素辅因子,仅存在Fe-S簇,且L-乳酸脱氢过程中Fe-S簇氧化还原状态发生改变,而对LldA、LldB中Fe-S簇结合位点定点突变后LldABC的酶活明显降低。综合生物信息学、酶学以及定点突变结果,推测LldABC催化L-乳酸脱氢的机理:LldA与乙醇酸氧化酶具有同源性,以Fe-S簇为活性中心,催化L-乳酸生成丙酮酸;LldB亚基通过Fe-S簇将LldA产生的电子传递至外源电子受体;而LldC通过自身膜整合区及亚基间相互作用,将LldABC锚定于细胞膜上;三者相互配合完成催化L-乳酸脱氢同时提供电子给电子传递链产生能量的生物学功能。.本项目揭示了LldABC在P. stutzeriA1501 L-乳酸代谢过程中的具体作用,首次对该新型L-iLDH的生物学功能、生化性质与催化机理进行了系统研究;研究结果对深刻了解微生物L-乳酸代谢机制及后续致病机理分析具有重要理论意义
期刊论文列表
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Utilization of D-Lactate as an Energy Source Supports the Growth of Gluconobacter oxydans
利用 D-乳酸作为能源支持氧化葡萄糖杆菌的生长
DOI:10.1128/aem.00527-15
发表时间:2015-06-01
期刊:APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
影响因子:4.4
作者:Sheng, Binbin;Xu, Jing;Xu, Ping
通讯作者:Xu, Ping
DOI:--
发表时间:2014
期刊:Trends in Microbiology
影响因子:--
作者:Tianyi Jiang;Chao Gao;Cuiqing Ma;Ping Xu;
通讯作者:
Production of hydroxypyruvate from glycerate by a novel biotechnological route
通过新型生物技术路线从甘油酸生产羟基丙酮酸
DOI:10.1016/j.biortech.2013.01.062
发表时间:2013-03-01
期刊:BIORESOURCE TECHNOLOGY
影响因子:11.4
作者:Gao, Chao;Wang, Xiuqing;Xu, Ping
通讯作者:Xu, Ping
DOI:10.1371/journal.pone.0104204
发表时间:2014
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Sheng B;Zheng Z;Lv M;Zhang H;Qin T;Gao C;Ma C;Xu P
通讯作者:Xu P
Genome Sequence of the Nonpathogenic Pseudomonas aeruginosa Strain ATCC 15442.
非致病性铜绿假单胞菌菌株 ATCC 15442 的基因组序列。
DOI:10.1128/genomea.00421-14
发表时间:2014-05-01
期刊:Genome announcements
影响因子:--
作者:Wang Y;Li C;Gao C;Ma C;Xu P
通讯作者:Xu P
DhcR调控D-2-羟基戊二酸分解代谢机制及其在生物传感器构建中的应用
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:58万元
- 批准年份:2021
- 负责人:马翠卿
- 依托单位:
L-苹果酸醌氧化还原酶在铜绿假单胞菌乙酸代谢与绿脓菌素产生中的作用研究
- 批准号:31970056
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:58.0万元
- 批准年份:2019
- 负责人:马翠卿
- 依托单位:
阴沟肠杆菌中乙酸代谢溢流消除机制研究
- 批准号:31670041
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:59.0万元
- 批准年份:2016
- 负责人:马翠卿
- 依托单位:
Pseudomonas putida KT2440中2,3-丁二醇分解代谢机制研究
- 批准号:31470164
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:92.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:马翠卿
- 依托单位:
微生物乳酸代谢调控蛋白LldR的结构及机制研究
- 批准号:31270090
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:82.0万元
- 批准年份:2012
- 负责人:马翠卿
- 依托单位:
膜整合NAD非依赖型乳酸脱氢酶的催化机理及其应用基础研究
- 批准号:31070062
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:8.0万元
- 批准年份:2010
- 负责人:马翠卿
- 依托单位:
生物法生产高纯度手性乙偶姻和2,3-丁二醇的应用基础研究
- 批准号:30770064
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:30.0万元
- 批准年份:2007
- 负责人:马翠卿
- 依托单位:
生物催化乳酸生产丙酮酸的基础研究
- 批准号:20676072
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:30.0万元
- 批准年份:2006
- 负责人:马翠卿
- 依托单位:
一株嗜温细菌脱有机硫反应机制及其基因研究
- 批准号:30270045
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:7.0万元
- 批准年份:2002
- 负责人:马翠卿
- 依托单位:
国内基金
海外基金
