用dsDNA微阵列筛选NF-κB DNA靶点及靶基因

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    60871014
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    35.0万
  • 负责人：
    王进科
  • 依托单位：
    东南大学
  • 学科分类：
    F0124.生物电子学与生物信息处理
  • 结题年份：
    2011
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2011-12-31

项目摘要

本研究运用我们发展的发卡引物在片延伸技术制备含有连续碱基突变的双链DNA 微阵列芯片[MS-dsDNA microarray],考察转录因子NF-κB与众多突变DNA位点的相互作用，筛选出对NF-κB 具有较高亲合性的DNA 位点；再通过对人全基因组序列的扫描，确定这些位点在基因组中的分布图谱（profile）,预测其为基因组中NF-κB 的假定结合位点（putative binding sites，PBS）；并将这些PBS上下文中分布的基因预测为NF-κB的假定靶基因（target genes）；最后通过文献检索和实验验证，鉴定新的NF-κB 功能性（functional）结合靶点和靶基因，构建NF-κB 控制的基因转录调控网络（transcriptional regulatory network），描绘NF-κB 的完整生物学全貌，为NF-κB的生物医学应用提供科学依据。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（12）
专著数量（1）
科研奖励数量（1）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
人工诱骗子的入核分布对核因子-κB 活性的调控作用
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物工程学报，2010, 26(12)：1683?1689（一级学报）
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
In vitro DNA-binding profile of transcription factors: methods and new insights.
转录因子的体外 DNA 结合谱：方法和新见解。
  • DOI：
    10.1530/joe-11-0010
  • 发表时间：
    2011-07
  • 期刊：
    The Journal of endocrinology
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Manufacture of IRDye800CW-coupled Fe3O4 nanoparticles and their applications in cell labeling and in vivo imaging.
IRDye800CW 耦合 Fe3O4 纳米粒子的制造及其在细胞标记和体内成像中的应用。
  • DOI：
    10.1186/1477-3155-8-25
  • 发表时间：
    2010-10-29
  • 期刊：
    Journal of nanobiotechnology
  • 影响因子：
    10.2
  • 作者：
    Hou Y;Liu Y;Chen Z;Gu N;Wang J
  • 通讯作者：
    Wang J
近红外荧光电泳迁移率变动分析的实验方法.
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物技术通讯，2011，22（1）：71-76
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
ASPP2基因启动子区DNA甲基化及转录因子DNA结合位点的干湿研究.
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物医学工程研究, 2010，29（4）：254-258（核心刊物）
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：

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其他文献

双链DNA微阵列:原理、技术和应用
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    遗传
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    潘艳;王进科
  • 通讯作者：
    王进科
一种筛选种质特异性gDNA探针用于种质鉴定的新方法
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Nucleic Acids Research
  • 影响因子：
    14.9
  • 作者：
    李同祥;王进科;白云飞;孙向东;陆祖宏
  • 通讯作者：
    陆祖宏
转录因子NF-kappa;B活性检测技术
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    遗传
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    凌小倩;王进科
  • 通讯作者：
    王进科
哺乳动物转录因子DNA结合谱
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    遗传
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    谷光明;王进科
  • 通讯作者：
    王进科
多重种特异性探针对石斛近缘品种的准确鉴定
  • DOI：
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  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    J. Biochem. Biophys. Methods
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李同祥;王进科;陆祖宏
  • 通讯作者：
    陆祖宏

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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