丛枝菌根在多个被子植物科中演变丢失的分子遗传机制
批准号:
31000105
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
18.0 万元
负责人:
王斌
依托单位:
学科分类:
C0202.植物系统发生与进化
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
张远莉、丁静、吴娟子、仲昭朝、袁璟、薛佳宇、刘静、冯雪影、许颖
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中文摘要
地球上绝大多数陆地植物的根部会与真菌形成一种互相交换营养的共生体,称为菌根。但在被子植物中,大约14%的物种在自然条件下却不再依赖菌根这一原始的营养获取方式,其演变过程及内在原因一直未被深入研究。近年来随着分子遗传学和基因组学的快速发展,控制菌根形成的多个共生基因被陆续发现,这为调查菌根在多个被子植物类群中演变丢失的内在机制提供了重要基石。本研究项目选取有代表性,且背景研究较清晰的十字花科、伞形科、莎草科、禾本科共四个类群为研究对象,从分子进化的角度,调查多个共生基因(DMI1, DMI2, DMI3)在其代表性物种中的分布及演化表达规律。其研究结果不仅将系统的验证这些类群中共生基因与菌根性状的关联性;而且可揭示当物种向非菌根转化时,其内在遗传机制演化变异、丢失或被调控抑制的具体过程。本项目还将有助于鉴别不同经济作物品种形成菌根能力的差异性,为改善种植模式,推广绿色农业奠定理论基础。
英文摘要
地球上绝大多数陆地植物的根部会与丛枝真菌形成互相交换营养的共生体,称为丛枝菌根。但在以十字花科为代表的一些被子植物类群中,许多物种在自然条件下却不再形成丛枝菌根,其丢失演变的过程及分子机制值得深入研究。针对于此,本项目首先仔细调查了35个陆地植物与6个绿藻类植物基因组数据,鉴定了三个重要共生基因(DMI1/Pollux, Castor, DMI3/CCaMK)在这些植物基因组中的存在情况。总体上看,在多数植物基因组中,三个共生基因都倾向于维持单个拷贝,在少数物种中存在基因复制。数据表明:DMI3/CCaMK基因的起源节点与陆地植物大体上同步,而DMI1/Pollux, Castor两个基因的起源时间早于陆地植物。在十字花科植物基因组中,DMI3/CCaMK基因与Castor两个基因已经缺失,这与其不形成共生菌根的性状一致。接下来,本项目收集了以十字花科为代表的多个植物类群的相关物种材料,尝试通过分子手段从这些物种中分离得到相关共生基因的序列,并进行分析。结果表明,在十字花科物种中,DMI3/CCaMK基因与Castor两个基因确实缺失,而DMI1/Pollux基因却不仅被保存下来,还经常复制出多个不同拷贝。而在伞形科的物种中,三个共生基因基本全部存在。菌根性状的鉴定实验结果也同时表明,十字花科物种根部基本不形成丛枝菌根,而伞形科物种根部经常观察到菌根结构。综合结果表明DMI3/CCaMK基因与菌根性状的关联性最好,可用于今后植物物种菌根形成能力的分子鉴定。而DMI1/Pollux基因很可能在十字花科等类群中参与了其他功能,这一点值得进一步研究。此外,我们还分离、培养了多个丛枝真菌物种,并在实验室环境下利用这些丛枝真菌分别与不同植物物种,以及禾本科的一些重要经济作物(如水稻、小麦的不同品种)进行了接种实验,关注了植物物种或作物品种与不同丛枝真菌的配合生长情况。这也是我们今后将要关注的一个重要研究方向。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
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专利列表
Synonymous codon ordering: a subtle but prevalent strategy of bacteria to improve translational efficiency.
同义密码子排序:细菌提高翻译效率的一种微妙但普遍的策略
DOI:10.1371/journal.pone.0033547
发表时间:2012
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Shao ZQ;Zhang YM;Feng XY;Wang B;Chen JQ
通讯作者:Chen JQ
DOI:10.1111/j.1744-7909.2011.01033.x
发表时间:2011-04
期刊:Journal of integrative plant biology
影响因子:11.4
作者:Bin Wang;Jingjing Yuan;Jing Liu;Liang Jin;Jian-Qun Chen
通讯作者:Bin Wang;Jingjing Yuan;Jing Liu;Liang Jin;Jian-Qun Chen
DOI:10.1111/j.1469-8137.2009.03137.x
发表时间:2010-04
期刊:The New phytologist
影响因子:--
作者:Bin Wang;L. Yeun;J. Xue;Yang Liu;Jean-Michel Ané;Y. Qiu
通讯作者:Bin Wang;L. Yeun;J. Xue;Yang Liu;Jean-Michel Ané;Y. Qiu
Optimal codon identities in bacteria: implications from the conflicting results of two different methods.
细菌中的最佳密码子身份:两种不同方法的冲突结果的含义
DOI:10.1371/journal.pone.0022714
发表时间:2011
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Wang B;Shao ZQ;Xu Y;Liu J;Liu Y;Hang YY;Chen JQ
通讯作者:Chen JQ
A primary survey on bryophyte species reveals two novel classes of nucleotide-binding site (NBS) genes.
对苔藓植物物种的初步调查揭示了两类新的核苷酸结合位点 (NBS) 基因
DOI:10.1371/journal.pone.0036700
发表时间:2012
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Xue JY;Wang Y;Wu P;Wang Q;Yang LT;Pan XH;Wang B;Chen JQ
通讯作者:Chen JQ
水稻胞内激酶OsADK1调控丛枝菌根共生与磷饥饿响应通路的分子机制
- 批准号:32370254
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:50万元
- 批准年份:2023
- 负责人:王斌
- 依托单位:
基于间充质干细胞组织异质性筛选的TLR5(high)-MSCs对炎症性肠炎(IBD)优效治疗作用及机制研究
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:52万元
- 批准年份:2022
- 负责人:王斌
- 依托单位:
HDAC6基于Cavelin-1乙酰化修饰介导巨噬细胞泡沫化调控动脉粥样硬化的作用及机制研究
- 批准号:82070459
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55万元
- 批准年份:2020
- 负责人:王斌
- 依托单位:
植物多个基因家族参与调控丛枝菌根共生的分子机制及其演化
- 批准号:31870203
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:60.0万元
- 批准年份:2018
- 负责人:王斌
- 依托单位:
组蛋白去乙酰化酶-6通过调控免疫炎症反应促进脊髓损伤修复的机制研究
- 批准号:81571213
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:57.0万元
- 批准年份:2015
- 负责人:王斌
- 依托单位:
大豆复合抗病基因位点的变异模式及其多功能化机制
- 批准号:31470327
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:85.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:王斌
- 依托单位:
乳杆菌黏附素抑制肠上皮细胞内化、吞噬肠道细菌移位的实验研究
- 批准号:30801090
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:19.0万元
- 批准年份:2008
- 负责人:王斌
- 依托单位:
国内基金
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