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基于生物芯片表达谱数据的水稻磷响应关键功能基因的生物信息学挖掘

批准号：
30771326
项目类别：
面上项目
资助金额：
30.0 万元
负责人：
陈铭
依托单位：
浙江大学
学科分类：
作物基因组及遗传学
结题年份：
2010
批准年份：
2007
项目状态：
已结题
项目参与者：
于杰、何芬芳、朱振兴、施清芸、邵钏、陈祥、宁开达
关键词：
生物信息学水稻关键功能基因磷响应基因芯片

项目摘要

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项目成果

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中文摘要
水稻对磷的高效吸收利用的研究是水稻生长、发育生物学的重要命题；同时对基因工程改良植物对养分水分的高效吸收具有重要的理论指导意义。本项目研究利用生物信息学技术，基于大规模基因芯片表达谱数据的分析，通过对水稻芯片基因的多功能注释，对基因芯片基因调控网络的构建和分析，实现了水稻磷响应关键功能基因的生物信息学挖掘和系统分析。为揭示水稻遗传型到表型的过程机理，尤其是水稻如何响应磷信号而影响其生长和代谢的机制打下基础。
英文摘要
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专利列表
RNA editing of nuclear transcripts in Arabidopsis thaliana.
拟南芥核转录本的 RNA 编辑
DOI： 10.1186/1471-2164-11-s4-s12
发表时间： 2010-12-02
期刊： BMC genomics
影响因子： 4.4
作者： [Meng Y, Chen D, Jin Y, Mao C, Wu P, Chen M]
通讯作者： Chen M
Genome-wide survey of rice microRNAs and microRNA–target pairs in the root of a novel auxin-resistant mutant
DOI： 10.1007/s00425-009-0994-3
发表时间： 2009-08
期刊： Planta
影响因子： 4.3
作者： [Y. Meng;Fangliang Huang;Qingyun Shi;Jun-Xia Cao;Dijun Chen;Jinwei Zhang;J. Ni;Ping Wu;Ming Chen]
通讯作者： Y. Meng;Fangliang Huang;Qingyun Shi;Jun-Xia Cao;Dijun Chen;Jinwei Zhang;J. Ni;Ping Wu;Ming Chen
VIRS: A Visual Tool for Identifying Restriction Sites in Multiple DNA Sequences
VIRS：用于识别多个 DNA 序列中限制性位点的可视化工具
DOI： 10.1002/btpr.259
发表时间： 2009-09-01
期刊： BIOTECHNOLOGY PROGRESS
影响因子： 2.9
作者： [Chen，Xiang, Luo，Cong, Chen，Ming]
通讯作者： Chen，Ming
MicroRNA-mediated signaling involved in plant root development
DOI： --
发表时间： --
期刊： Biochem Biophys Res Commun
影响因子：
作者： [M. Chen, D. Chen, P. Wu, X. Ma, Y. Meng, ]
通讯作者：
共 17 条
    基于ANDSystem与多组学的水稻和小麦胁迫响应分子调控网络及智能作物平台（Smart Crop）的构建
    • 批准号：
      --
    • 项目类别：
      --
    • 资助金额：
      105万元
    • 批准年份：
      2022
    • 负责人：
      陈铭
    • 依托单位：
      浙江大学
    基于bulk和单细胞转录组挖掘水稻lncRNA参与调控非生物胁迫响应机制的研究
    • 批准号：
      32261133526
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      54万元
    • 批准年份：
      2022
    • 负责人：
      陈铭
    • 依托单位：
      浙江大学
    植物非编码RNA的潜在翻译产物及其调控网络研究
    • 批准号：
      32070677
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      58.0万元
    • 批准年份：
      2020
    • 负责人：
      陈铭
    • 依托单位：
      浙江大学
    植物非编码RNA多层级调控网络的构建与分析
    • 批准号：
      31771477
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      60.0万元
    • 批准年份：
      2017
    • 负责人：
      陈铭
    • 依托单位：
      浙江大学
    国内基金
    海外基金