课题基金 / 基金详情

水稻磷响应基因及蛋白介导根发育的系统生物学研究

批准号:
30971743
项目类别:
面上项目
资助金额:
26.0 万元
负责人:
陈铭
依托单位:
学科分类:
作物基因组及遗传学
结题年份:
2012
批准年份:
2009
项目状态:
已结题
项目参与者:
张麝龙、孟一君、马孝霞、陈祥、曹俊杰、罗聪、陈迪俊、白琳

项目摘要

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项目成果

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中文摘要
根系是植物养分、水分吸收的重要器官。根毛的发生发育受土壤养分,尤其是磷含量水平的调控。探明根系发生发育的调控机制及其与养分、水分、胁迫信号之间的交叉互作,是当前重要的科学命题。该研究对基因工程提高植物养分、水分吸收效率具有重要的分子基础理论指导意义。本项目在前期研究成果的基础上,结合高度发展的生物学实验技术,有效结合生物信息学分析手段,挖掘和整合现有的水稻根系发育分子生物学数据(包括基因芯片、蛋白质表达数据等),对水稻磷响应基因及蛋白介导根发育的调控网络进行构建和分析,系统分析水稻如何响应磷信号而影响其根生长和代谢的机制,为水稻养分抗逆定向遗传育种提供依据。
英文摘要
本项目在前期研究成果的基础上,结合高度发展的生物学实验技术,有效结合生物信息学分析手段,挖掘和整合现有的水稻根系发育分子生物学数据(包括基因芯片、蛋白质表达数据等),对水稻磷响应基因及蛋白介导根发育的调控网络进行构建和分析,系统分析水稻如何响应磷信号而影响其根生长和代谢的机制,为水稻养分抗逆定向遗传育种提供依据。项目完成了植物分子生物学数据库的数据挖掘及整合,完善了RiceDB(OsCAS),抗逆基因数据库等;对水稻基因芯片数据进行了整合,建立了数据分析平台BioChip;建立了水稻蛋白质双向电泳表达谱功能注释平台,进行了功能分析过程的建立。以水稻基因芯片表达谱、双向电泳蛋白表达谱分析为基础,进行水稻磷响应功能基因、蛋白调控机制研究,开展具有我国自主知识产权的水稻磷介导根发育重要功能基因、蛋白系统生物学分析。后期结合高通量第二代测序数据进行了相关的研究分析,深入研究植物相关microRNA,取得了喜人的成果。受项目资助,已合作、协助发表27篇SCI论文论文,期间获得专利3项,申报2项。项目研究小组积极参与国内外的学术交流,并培养了多名研究生。研究成果为水稻系统生物学研究打下了很好的基础。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Toward microRNA-mediated gene regulatory networks in plants
植物中 microRNA 介导的基因调控网络
DOI: 10.1093/bib/bbq091
发表时间: 2011-11-01
期刊: BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
影响因子: 9.5
作者: [Meng, Yijun, Shao, Chaogang, Chen, Ming]
通讯作者: Chen, Ming
DOI: 10.1111/j.1742-4658.2010.07706.x
发表时间: 2010-07
期刊: The FEBS Journal
影响因子: --
作者: [Chenjia Shen;Youhuang Bai;Suikang Wang;Saina Zhang;Yunrong Wu;Ming Chen;D. Jiang;Yanhua Qi]
通讯作者: Chenjia Shen;Youhuang Bai;Suikang Wang;Saina Zhang;Yunrong Wu;Ming Chen;D. Jiang;Yanhua Qi
A reversed framework for the identification of microRNA-target pairs in plants
用于识别植物中 microRNA-靶标对的反向框架
DOI: 10.1093/bib/bbs040
发表时间: 2013-05-01
期刊: BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
影响因子: 9.5
作者: [Shao, Chaogang, Chen, Ming, Meng, Yijun]
通讯作者: Meng, Yijun
Computational identification of protein-protein interactions in rice based on the predicted rice interactome network.
基于预测的水稻相互作用组网络的水稻中蛋白质-蛋白质相互作用的计算鉴定
DOI: 10.1016/s1672-0229(11)60016-8
发表时间: 2011-10
期刊: GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS
影响因子: 9.5
作者: [Zhu, Pengcheng, Gu, Haibin, Jiao, Yinming, Huang, Donglin, Chen, Ming]
通讯作者: Chen, Ming
16
    基于ANDSystem与多组学的水稻和小麦胁迫响应分子调控网络及智能作物平台(Smart Crop)的构建
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      --
    • 资助金额:
      105万元
    • 批准年份:
      2022
    • 负责人:
      陈铭
    • 依托单位:
    基于bulk和单细胞转录组挖掘水稻lncRNA参与调控非生物胁迫响应机制的研究
    • 批准号:
      32261133526
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      54万元
    • 批准年份:
      2022
    • 负责人:
      陈铭
    • 依托单位:
    植物非编码RNA的潜在翻译产物及其调控网络研究
    • 批准号:
      32070677
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      58.0万元
    • 批准年份:
      2020
    • 负责人:
      陈铭
    • 依托单位:
    植物非编码RNA多层级调控网络的构建与分析
    • 批准号:
      31771477
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      60.0万元
    • 批准年份:
      2017
    • 负责人:
      陈铭
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金