水稻(Oryza sativa)磷代谢网络的预测重建及其系统生物学的研究
批准号：
30500106
项目类别：
青年科学基金项目
资助金额：
25.0 万元
负责人：
陈铭
依托单位：
学科分类：
物理生物学
结题年份：
2008
批准年份：
2005
项目状态：
已结题
项目参与者：
吴忠长、王栩鸣、张麝龙、储俊、秦诚
项目摘要
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项目成果
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中文摘要
水稻基因组计划的完成后，目前面临着巨量分子生物学数据的功能分析，除常规的序列注释外，系统生物学为揭示遗传型到表型的过程机理提供了解决方法。生物反应网络的预测重建是解决系统生物学分析的关键环节，是全面了解细胞生命过程，如细胞生长，代谢活动，基因调控，蛋白质间相互作用及细胞信号转导等的基本要求。在遗传育种，生物工程，医药医疗方面具有巨大的应用潜力。.本项目将挖掘和整合现有的分子生物学数据，对水稻的生物反应网络，特别是磷代谢网络进行预测重建和系统生物学的分析研究。拟提出并优化一适用性较强的生物反应网络的预测重建方法；构建完整的水稻磷代谢网络；确定水稻生物反应网络的结构与功能特性；并通过系统生物学的分析，结合生产应用，揭示水稻遗传型到表型的过程机理，尤其是水稻如何利用磷而影响其生长和代谢的机制。本项目的研究成功经验还可以适用于其它农业作物的系统生物学研究。
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btl491
发表时间：
2006-12-01
期刊：
BIOINFORMATICS
影响因子：
5.8
作者：
[Chen, Xiaohui, Chen, Ming, Ning, Kaida]
通讯作者：
Ning, Kaida
DOI：
--
发表时间：
--
期刊：
影响因子：
作者：
[]
通讯作者：
DOI：
--
发表时间：
--
期刊：
中国水稻科学, 2007, 21(3): 235-241.Rice Science, 2007, 14(4): 256-264
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
DOI：
10.1016/j.ygeno.2007.02.001
发表时间：
2007-06-01
期刊：
GENOMICS
影响因子：
4.4
作者：
[Du, Liming, Jiao, Fangchan, Wu, Ping]
通讯作者：
Wu, Ping
DOI：
--
发表时间：
--
期刊：
生物信息学中的智能计算理论与研究方法（黄德双等主编），2006, pp.65-69.
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
共 10 条
基于bulk和单细胞转录组挖掘水稻lncRNA参与调控非生物胁迫响应机制的研究
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批准号：32261133526
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项目类别：面上项目
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资助金额：54万元
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批准年份：2022
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负责人：陈铭
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依托单位：
基于ANDSystem与多组学的水稻和小麦胁迫响应分子调控网络及智能作物平台（Smart Crop）的构建
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批准号：--
-
项目类别：--
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资助金额：105万元
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批准年份：2022
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负责人：陈铭
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依托单位：
植物非编码RNA的潜在翻译产物及其调控网络研究
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批准号：32070677
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项目类别：面上项目
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资助金额：58.0万元
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批准年份：2020
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负责人：陈铭
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依托单位：
植物非编码RNA多层级调控网络的构建与分析
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批准号：31771477
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项目类别：面上项目
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资助金额：60.0万元
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批准年份：2017
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负责人：陈铭
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依托单位：
水稻生长过程多层次基因调控网络的构建
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批准号：31571366
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项目类别：面上项目
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资助金额：65.0万元
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批准年份：2015
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负责人：陈铭
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依托单位：
基于高通量测序数据发掘植物长非编码RNA及其调控网络研究
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批准号：31371328
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项目类别：面上项目
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资助金额：80.0万元
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批准年份：2013
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负责人：陈铭
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依托单位：
水稻磷响应基因及蛋白介导根发育的系统生物学研究
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批准号：30971743
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项目类别：面上项目
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资助金额：26.0万元
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批准年份：2009
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负责人：陈铭
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依托单位：
基于生物芯片表达谱数据的水稻磷响应关键功能基因的生物信息学挖掘
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批准号：30771326
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项目类别：面上项目
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资助金额：30.0万元
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批准年份：2007
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负责人：陈铭
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依托单位：
国内基金
海外基金