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中国人HLA-I基因多态性与HIV-1免疫逃逸变异的相关性研究
结题报告
批准号:
81273137
项目类别:
面上项目
资助金额:
60.0 万元
负责人:
李林
学科分类:
H3009.传染病流行病学
结题年份:
2016
批准年份:
2012
项目状态:
已结题
项目参与者:
李韩平、庄道民、李天一、王晓林、隋洪帅、贾磊、韩婧婉
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中文摘要
HIV-1的变异在机体免疫压力作用下呈现一定的规律性。阐明这种变异模式对于研究机体特异性免疫机制、寻找特异性免疫表位、研究有效的HIV-1疫苗至关重要。HLA-I分子为机体特异性细胞免疫反应提呈表位,其多态性直接影响机体的免疫应答效率。大量研究显示HLA-I基因多态性与HIV-1的感染和复制相关。不同人群的HLA-I分子具有很大的差异,本研究拟以中国的HIV-1感染者为研究对象,对HLA-I遗传背景不同的个体进行横断面研究,对HLA-I遗传背景相似的个体进行队列研究,结合运用生物信息学和统计学方法,分析HLA-I基因多态性和HIV-1感染者体内病毒基因序列变异的关系,观察HIV-1变异模式,筛选、鉴定能够引起病毒复制能力降低的HLA-I限制性免疫逃逸突变,为研究适合我国人群使用的HIV-1疫苗奠定基础。
英文摘要
Host immune presssure always leads to typical escape mutations of HIV-1. Study on the pattern of HIV-1 mutation under host immune pressure will be helpful for illustration of host specific immunol mechanism, finding of specific immunol epitope, and success of HIV-1 vaccine. HLA-I plays important role in presentation of epitopes to cytotoxic T cells. The polymorphism of MHC-I gene, which codes HLA-I protein, has important effects on host immune response. Many studies suggested close relationship between MHC-I polymorphism and HIV-1 infection or replication. Since much difference of HLA-I protein could be found among different populations, Chinese participants will be enrolled as the study subjects. Several epidemiological studies , including cross-sectional study basing on participants containing different HLA-I genetic backgroud, cohort study basing on populations containing similar HLA-I genetic background, will be fulfilled as the study design. Bioinformatic and statistical methods will be combined to analyze the correlation between host HLA-I genetic polymorphism and HIV-1 genetic mutations, observe the specific evolution pattern of HIV-1, screen and identify mutations in epitopes targeted by CTL mediated by specific HLA-I. Then those mutations which can cause the decrease of viral repliation fitness will be identified. The results of the study will be important for the study of HIV-1 vaccines which can be used in Chinese population.
高度的变异性是HIV-1的主要特点之一,是抗病毒治疗和疫苗研究的重大挑战。大量的研究显示,HIV-1在体内的变异模式与HLA-I类分子限制性细胞毒性T细胞(CTL)反应相关。中国人的HLA-I基因多态性明显区别于其他人群,因此,分析中国人HLA分子多态性与HIV变异的相关性,筛选中国人群HLA-I限制性病毒表位突变对于研究适合中国人使用的HIV-1疫苗至关重要。本研究以中国的HIV-1感染者为研究对象,分析不同HLA-I分型的HIV-1感染者体内HIV-1基因序列,筛选HIV-1逃逸HLA-I限制性免疫的突变位点,构建中国HIV-1流行毒株感染性克隆,分析基因突变对HIV复制能力的影响,为研究针对中国HIV流行毒株的疫苗奠定基础。主要研究结果包括:(1)建立了基于单分子扩增测序和深度测序方法的高分辨率的HLA-I类分子基因多态性检测方法。(2)完成了我国部分优势毒株的基因多态性和系统进化分析。针对全国流行的CRF07_BC毒株分析显示, 来自MSMs人群的毒株形成一个大簇,传入时间为2000年(HPD:1999-2003),CRF07_BC传入MSMs人群导致了其第二次快速播散。(3)HIV-1逃逸HLA-I限制性免疫的基因突变的筛选及突变模式研究:完成552例感染了我国优势HIV毒株(CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC和B)的感染者的HLA-I类分子高分辨率基因分型,发现HLA-A*11:01:01为发生频率最高的HLA-A类分子(24.19%),HLA-B*46:01:01为发生频率最高的HLA-B类分子(14.04%),HLA-C*01:02:01为发生频率最高的HLA-C类分子(23.43%),各地HLA-I类分子分型分布存在差异。经过系统进化分析,共发现11种HLA-A分型、26种HLA-B分型,13种HLA-C分型与HIV基因突变相关,突变的位点数目分别为302、150、95个。(4)HIV-1感染性克隆的构建及突变对HIV-1复制能力影响研究:成功构建了我国流行的CRF01_AE毒株的感染性克隆,证实其体外复制能力与野生型毒株无差异;分析了Rev101位点突变对病毒复制能力的影响,发现Rev101提前终止子明显降低B亚型毒株的体外复制能力。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
HIV-1 is spreading out of former high-risk population through heterosexual transmission in Hebei, China
HIV-1 正在中国河北省通过异性传播从原高危人群中传播
DOI:--
发表时间:2016
期刊:Current HIV Research
影响因子:1
作者:Yongjian Liu;Zuoyi Bao;Lin Li;Jingyun Li
通讯作者:Jingyun Li
HIV-1 Thai B strain has spread out of former plasma donors into general population through sexual contact in Henan, China
HIV-1 泰国 B 株已通过中国河南省的性接触从前血浆捐献者传播到普通人群
DOI:10.1002/jmv.24383
发表时间:2016-04-01
期刊:JOURNAL OF MEDICAL VIROLOGY
影响因子:12.7
作者:Li, Lin;Sun, Guoqing;Li, Jingyun
通讯作者:Li, Jingyun
DOI:10.1089/aid.2016.0027
发表时间:2016-04
期刊:AIDS research and human retroviruses
影响因子:1.5
作者:Tian-yi Li;G. Sun;Dijing Jia;Changrong Sun;Zhe Wang;Si-yang Liu;Yongjian Liu;Han-ping Li;Xiao-lin Wang;Jingyun Li;Lin Li
通讯作者:Tian-yi Li;G. Sun;Dijing Jia;Changrong Sun;Zhe Wang;Si-yang Liu;Yongjian Liu;Han-ping Li;Xiao-lin Wang;Jingyun Li;Lin Li
DOI:--
发表时间:2015
期刊:中华流行病学杂志
影响因子:--
作者:鲍作义;刘思扬;李敬云;李林
通讯作者:李林
DOI:--
发表时间:2015
期刊:中国艾滋病性病
影响因子:--
作者:庄道民;刘思扬;李敬云;李林
通讯作者:李林
中国HIV CRF01_AE毒株不同进化簇基因组特征及其与致病相关性研究
可诱导广谱中和抗体的HIV膜蛋白基因变异模式研究
Tetherin蛋白和vpu基因与HIV-1异性性传播及致病的相关性研究
我国HIV流行毒株env蛋白中和表位的筛选和鉴定
国内基金
海外基金