SmMYB3,SmMYB6和SmMYB109在丹参生物活性化合物生物合成中的调控作用研究

批准号:
81603225
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
18.0 万元
负责人:
李彩丽
依托单位:
学科分类:
H3201.中药资源
结题年份:
2019
批准年份:
2016
项目状态:
已结题
项目参与者:
庞永奇、刘苗苗、李江、邓宇星
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中文摘要
丹参根中活性化合物均具有较强的药理活性。MYB转录因子则是活性化合物生物合成途径中的重要调控因子。我们前期研究表明MYB很可能参与调控了丹参活性化合物的生物合成。本项目将在此基础上,拟通过基因过表达和RNA干扰的方法研究SmMYB3、SmMYB6和SmMYB109转录因子在活性化合物积累中的作用;比较分析转基因和非转基因丹参中活性化合物化合物的组分和含量;高通量分析转基因植株转录组的变化,找出差异表达的基因;采用CHIP-seq在全基因组范围内分析MYB转录因子的靶位点。RNA-seq和CHIP-seq联合分析SmMYBs所调控的差异基因,构建丹参活性化合物合成的调控网络,为彻底揭示丹参活性化合物生物合成的遗传控制机制,利用基因工程手段获得药用活性成分含量较高的丹参新品系,及利用合成生物学技术合成相关的药用活性成分奠定基础。
英文摘要
The main bioactive components of S. miltiorrhiza include the water-soluble (hydrophilic) phenolics and the lipid-soluble tanshinones, and they have strong pharmacological activity. MYB transcription factor is involved in the biosynthesis of bioactive compounds. But now, research on MYB transcription factor regulating the biosynthesis of the bioactive compound is still in its infancy. Our previous studies have shown that MYB probably be involved in the regulation of the biosynthesis of the bioactive compounds. We intend to study the function of SmMYB3, SmMYB6 and SmMYB109 in the accumulation of the bioactive compounds by gene overexpression and RNA interference; compare and analyse components and contents of the bioactive compounds in transgenic and non-transgenic plants; identify differentially expressed genes by high throughput analyses. ChIP-Seq analysis will detect MYB DNA binding sites in the scope of the genome. Overlay of the RNA-Seq and ChIP-Seq results will reveal MYB-modulated target genes. The transcriptional regulatory framework of MYB will be build. The regulatory framework provides foundation for completely reveal the genetic control mechanism of the bioactive compounds.
丹参根中活性化合物均具有较强的药理活性。MYB转录因子则是活性化合物生物合成途径中的重要调控因子。该项目(1)通过基因过表达和RNA干扰的方法研究了SmMYB3、SmMYB6和SmMYB109转录因子在活性化合物积累中的作用,初步阐明了这三个转录因子通过调控合成途径中关键酶基因的表达影响丹参活性物质的合成;(2)分析了转基因的转录组,找到了差异基因,初步揭示了丹参转录因子的调控网路;(3)建立并且优化了丹参组培再生体系,为开展丹参基因功能研究奠定了良好基础;(4)在差异表达基因中,发现了漆酶基因可能参与了丹酚酸和原花青素的聚合,因此,鉴定了65个丹参漆酶基因,对其功能进行了分析。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
The Pentatricopeptide Repeat Gene Family in Salvia miltiorrhiza: Genome-Wide Characterization and Expression Analysis.
丹参中五肽重复基因家族:全基因组表征和表达分析
DOI:10.3390/molecules23061364
发表时间:2018-06-06
期刊:Molecules (Basel, Switzerland)
影响因子:--
作者:Li H;Li C;Deng Y;Jiang X;Lu S
通讯作者:Lu S
Identification and Characterization of Flavonoid Biosynthetic Enzyme Genes in Salvia miltiorrhiza (Lamiaceae).
唇形科丹参黄酮生物合成酶基因的鉴定与表征
DOI:10.3390/molecules23061467
发表时间:2018-06-16
期刊:Molecules (Basel, Switzerland)
影响因子:--
作者:Deng Y;Li C;Li H;Lu S
通讯作者:Lu S
Systematic Analysis of Alkaline/Neutral Invertase Genes Reveals the Involvement of Smi-miR399 in Regulation of SmNINV3 and SmNINV4 in Salvia miltiorrhiza
碱性/中性蔗糖酶基因的系统分析揭示了丹参中 Smi-miR399 参与 SmNINV3 和 SmNINV4 的调节
DOI:10.3390/plants8110490
发表时间:2019-11
期刊:Plants (Basel)
影响因子:--
作者:Zhou hong;Li Caili;Qiu Xiaoxiao;Lu Shanfa
通讯作者:Lu Shanfa
Characterization of the polyphenol oxidase gene family reveals a novel microRNA involved in posttranscriptional regulation of PPOs in Salvia miltiorrhiza.
多酚氧化酶基因家族的表征揭示了一种参与丹参 PPO 转录后调控的新型 microRNA
DOI:10.1038/srep44622
发表时间:2017-03-17
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Li C;Li D;Li J;Shao F;Lu S
通讯作者:Lu S
Analysis of the laccase gene family and miR397-/miR408-mediated posttranscriptional regulation in Salvia miltiorrhiza
丹参漆酶基因家族及miR397/miR408介导的转录后调控分析
DOI:10.7717/peerj.7605
发表时间:2019-08-29
期刊:PEERJ
影响因子:2.7
作者:Li, Caili;Li, Dongqiao;Lu, Shanfa
通讯作者:Lu, Shanfa
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