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14N核磁共振研究赖氨酸三甲基化蛋白质的相互作用动力学
结题报告
批准号:
21075132
项目类别:
面上项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
张许
学科分类:
B0403.谱学方法与理论
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
蒋先旺、秦显国、王晶婧、孙鹏、江海鹏
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中文摘要
组蛋白赖氨酸甲基化作为蛋白质共价修饰的一种,在一系列生物学过程中起着非常重要的作用。目前,对于甲基化位点是如何被其它蛋白质所识别的这一问题仍然知之甚少。部分原因是因为缺乏对于这些蛋白质三维结构的认识。NMR是研究蛋白质相互作用位点和结构的一种非常重要的手段,但是通常需要选择性同位素标记(13C,15N等)以提高灵敏度,这些方法不仅操作复杂,而且费用昂贵。本项目拟以天然丰度为99.63%的14N作为探针,建立高灵敏度的14N和甲基1H之间的HSQC谱,选择性检测溶液蛋白质中被三甲基化的赖氨酸的N甲基,并建立以此为基础的多维NOESY谱等,用以研究甲基化蛋白质和配体蛋白质的相互作用强弱以及作用位点等结构信息。所建立的方法灵敏度高,不仅可以提高该类蛋白质动力学研究的效率,而且可用于天然丰度蛋白质的检测,降低研究费用。
英文摘要
甲基化作为蛋白质转录后修饰的一种,在一系列生物学过程中起着非常重要的作用。目前,对于甲基化位点是如何被其它蛋白质所识别的这一问题仍然知之甚少。部分原因是因为缺乏对于这些蛋白质三维结构的认识。NMR是研究蛋白质相互作用位点和结构的一种非常重要的手段,但是通常需要选择性13C,15N等同位素标记蛋白质以提高灵敏度,这些操作不仅复杂,而且费用昂贵。本项目以天然丰度为99.63%的14N作为探针,发展了选择性检测三甲基化蛋白质以及磷脂 的14N-1H HSQC谱,研究了天然提纯的三甲基化蛋白质-细胞色素c在不同pH条件下的多种构象相互转换现象;实现了血清脂蛋白颗粒中磷脂的选择性观测,发现不同组分磷脂在脂蛋白表面的分布不同;初步建立了蛋白质的三甲基化标记方法,用于蛋白质动力学研究。结果表明:这一技术具有较高的灵敏度,能够有效简化谱线,降低谱峰重叠的影响,选择性观测赖氨酸的N甲基信息,无需同位素标记,因此可用于天然丰度三甲基化蛋白质或者脂蛋白纳米颗粒等生物大分子的动力学信息的观测。
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NMR spectroscopic approach reveals metabolic diversity of human blood plasma associated with protein-drug interaction.
核磁共振波谱方法揭示了与蛋白质-药物相互作用相关的人血浆代谢多样性。
DOI:10.1021/ac401738z
发表时间:2013-08
期刊:Anal Chem
影响因子:--
作者:Jiang, Bin;Zhou, Xin;Li, Conggang;Liu, Maili
通讯作者:Liu, Maili
Biomolecular ligands screening using radiation damping difference WaterLOGSY spectroscopy
利用辐射阻尼差 WaterLOGSY 光谱法筛选生物分子配体
DOI:10.1007/s10858-013-9748-4
发表时间:2013-06
期刊:Journal of Biomolecular NMR
影响因子:2.7
作者:Sun, Peng;Jiang, Xianwang;Jiang, Bin;Zhang, Xu;Liu, Maili
通讯作者:Liu, Maili
DOI:10.1021/ac303726p
发表时间:2013-02
期刊:Analytical chemistry
影响因子:7.4
作者:Bin Jiang;Fan Luo;Yiming Ding;Peng Sun;Xu Zhang;Ling Jiang;Conggang Li;X. Mao;Daiwen Yang-
通讯作者:Bin Jiang;Fan Luo;Yiming Ding;Peng Sun;Xu Zhang;Ling Jiang;Conggang Li;X. Mao;Daiwen Yang-
Age- and gender-related metabonomic alterations in striatum and cerebellar cortex in rats
大鼠纹状体和小脑皮质与年龄和性别相关的代谢组改变
DOI:10.1016/j.brainres.2013.02.033
发表时间:2013-04
期刊:Brain Research
影响因子:2.9
作者:Zhang, Xianrong;Wu, Junfang;Liu, Huilang;Zhang, Xu
通讯作者:Zhang, Xu
DOI:--
发表时间:2014
期刊:波谱学杂志
影响因子:--
作者:蒋先旺;孙鹏;肖楠;蒋滨;秦显国;李从刚;刘买利;张许
通讯作者:张许
细胞内乙酰化修饰蛋白质结构和相互作用的磁共振研究
基于核磁共振的磷脂异常代谢药物高内涵筛选技术研究
甲基化生物大分子NMR检测新技术
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