miRNA/novel_167靶向抑制Dmrt1的表达在红鳍东方鲀性别分化过程中的功能研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31902347
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1903.水产生物繁殖与发育
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Accumulating evidence suggests that miRNAs play important roles in sex differentiation of animals, however, the regulatory and functional roles of miRNAs in gonadal sex differentiation have not been well clarified in fish yet. The tiger pufferfish (Takifugu rubripes) was considered as one of the most economically important marine fish in China. As male fugu are more valuable than female, study on the molecular mechanism of sex determination and differentiation of this species is essential for achieving all-male mono-sex culture. Dmrt1 has a conserve role in the signaling pathway during male sex-determination sex-differentiation across vertebrates. Our previous studies systematically analyzed the miRNAs expression profiles in undifferentiated gonad tissues and screened numerous sex-bias expressed miRNAs in Takifugu rubripes. Among them, miRNA/novel_167 were expressed higher in female gonads and predicted to target Dmrt1. Therefore, in this project, we will use qPCR, in situ hybridization and dual-luciferase reporter assay to investigate whether miRNA/novel_167 negatively regulate the Dmrt1 expression firstly. Then, miRNA/novel_167 knockdown and overexpression experiments will be carried out to figure out the functions of miRNA/novel_167 in sex differentiation. Finally, gene knockdown and hormone treatment will be performed to study the relationship of miRNA/novel_167 with key genes involved in male and female sex determination. The results will help us to clarify the role of miRNAs in sex determination and differentiation in fish.
miRNAs在动物的性别分化过程具有重要作用,但其在鱼类性别分化过程中的功能和作用机制尚不明确。红鳍东方鲀是我国重要海水养殖经济鱼类,雄性商品鱼价格较高,对其性别决定和分化机制的研究是生产上实现单雄养殖的必要基础。Dmrt1基因是脊椎动物雄性性别决定和分化通路上的保守基因。我们前期在未分化性腺中筛选了性别差异表达的miRNAs,其中,miRNA/novel_167在雌性性腺高表达,且靶基因是Dmrt1。本项目拟在前期工作的基础上,首先采用qPCR、原位杂交、双荧光素酶报告基因等技术进一步明确miRNA/novel_167对Dmrt1的靶向抑制关系。然后,通过miRNA/novel_167敲降和过表达实验研究其在性别分化过程中的功能。最后通过基因敲降和激素处理实验,研究miRNA/novel_167与雌、雄通路关键基因之间关系。研究结果将为解读miRNAs在鱼类的性别分化过程的功能提供参考。

结项摘要

红鳍东方鲀是我国重要海水养殖经济鱼类,雄性商品鱼价格较高,对其性别决定和分化机制的研究是生产上实现全雄养殖的必要基础。近年来,越来越多的研究发现非编码RNAs在动物的性别分化过程具有重要作用,本研究首先利用高通量测序技术对河鲀幼鱼未分化性腺进行全转录组测序分析,筛选了性别差异表达的miRNA、lncRNA和cirRNA,其中,与XX性腺相比,分别有3个成熟 miRNAs, 79个lncRNAs和34个cirRNAs在XY性腺中上调,5个成熟miRNAs, 51个lncRNAs和26个cirRNAs下调。在这些差异表达的非编码RNA中,miRNA/novel_167在雌性性腺高表达,且预测靶基因是雄性性别分化相关基因Dmrt1。采用双荧光素酶报告基因进一步明确miRNA/novel_167对Dmrt1的靶向抑制关系。然后,对河鲀幼鱼进行AI、MT或E2处理,结果发现,AI和MT可诱导XX河鲀雄性化,E2可以诱导XY河鲀雌性化。转录组分析后发现在性别转变过程中dmrt1, gsdf, foxl2以及其它与类固醇激素合成相关的基因 (如star, hsd3b1, cyp11c1, cyp19a1a, etc.) 表达发生变化。此外,转录组和qPCR结果均显示在对照组XY性腺中,dmrt1和gsdf的表达显著高于XX性腺;在对照组XX性腺中,foxl2和cyp19a1a的表达显著高于XY性腺;AI处理后,XX性腺中的foxl2和cyp19a1a的表达水平降低,dmrt1和gsdf 表达上升;MT处理后,XX性腺中的foxl2, cyp19a1a, dmrt1和gsdf的表达均下降;E2 处理后,XY性腺中dmrt1和gsdf的表达水平下降。因此,上述基因在河鲀的性别分化过程中具有重要作用。同时,还发现,AI处理后,XX性腺中novel_167的表达水平下降,而E2处理后,XY性腺中novel_167的表达水平上升。最后,novel 167 agomir和antagomir性腺注射实验表明novel 167可在体下调dmrt1基因的表达水平,但敲降dmrt1对novel 167的表达无影响。研究结果将帮助我们解析miRNAs和其他非编码RNA在河鲀的性别分化过程的功能。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Retinal development and the expression profiles of opsin genes during larval development in Takifugu rubripes
红鳍东方鲀幼虫发育过程中的视网膜发育和视蛋白基因的表达谱
  • DOI:
    10.1111/jfb.15270
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Journal of Fish Biology
  • 影响因子:
    2
  • 作者:
    Qi Zhang;Yumeng Wu;Weiyuan Li;Jia Wang;Huiting Zhou;Lei Zhang;Qi Liu;Liu Ying;Hongwei Yan
  • 通讯作者:
    Hongwei Yan
Profile of gene expression changes during estrodiol-17β-induced feminization in the Takifugu rubripes brain.
雌二醇 17β 诱导 Takifugu rubripes 大脑女性化过程中基因表达变化的概况
  • DOI:
    10.1186/s12864-021-08158-0
  • 发表时间:
    2021-11-24
  • 期刊:
    BMC genomics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Shen X;Yan H;Jiang J;Li W;Xiong Y;Liu Q;Liu Y
  • 通讯作者:
    Liu Y
Effects of the Thyroid Endocrine System on Gonadal Sex Ratios and Sex-Related Gene Expression in the Pufferfish Takifugu rubripes.
甲状腺内分泌系统对红鳍东方鲀性腺性别比及性别相关基因表达的影响
  • DOI:
    10.3389/fendo.2021.674954
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in endocrinology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Yuan Z;Shen X;Yan H;Jiang J;Liu B;Zhang L;Wu Y;Liu Y;Liu Q
  • 通讯作者:
    Liu Q
Effects of different light conditions on growth, muscle nutrients content, and clock gene circadian expression of Takifugu rubripes
不同光照条件对红鳍东方鲀生长、肌肉营养成分含量及时钟基因昼夜节律表达的影响
  • DOI:
    10.1016/j.aqrep.2022.101294
  • 发表时间:
    2022-10
  • 期刊:
    Aquaculture Reports
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Yumeng Wu;Hongwei Yan;Xufang Shen;Jieming Jiang;Zhen Yuan;Qi Liu;Ziwei Wang;Liyu Bai;Changbin Song;Ying Liu
  • 通讯作者:
    Ying Liu
Identifcation of sex diferentiation‑related microRNA and long non‑coding RNA in Takifugu rubripes gonads
红鳍东方鲀性腺性别分化相关 microRNA 和长链非编码 RNA 的鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Hongwei Yan;Qi Liu;Jieming Jiang;Xufang Shen;Lei Zhang;Zhen Yuan;Yumeng Wu;Ying Liu
  • 通讯作者:
    Ying Liu

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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