课题基金 / 基金详情

大豆抗裂荚新基因和功能标记的挖掘

批准号:
31571688
项目类别:
面上项目
资助金额:
64.0 万元
负责人:
黄方
依托单位:
学科分类:
作物基因组及遗传学
结题年份:
2019
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
王娇、马玉杰、张晋玉、王婷婷、杨慧

项目摘要

结项摘要

项目成果

黄方的其他基金

相似基金

相关文献

中文摘要
大豆炸荚是影响大豆产量的一个重要因素。大豆种质资源中蕴含了丰富的抗裂荚基因。为了高效发掘大豆中抗裂荚的优异新基因,本项目一方面利用219份大豆材料组成的自然群体进行全基因组关联分析,另一方面利用两个重组自交家系群体,其中一个为栽培大豆和野生大豆杂交的重组自交家系,进行主效QTL的精细定位。通过这两个手段结合大豆基因组信息和生物信息学等方法挖掘和克隆抗裂荚新的候选基因。该研究通过对抗裂荚基因的功能研究,探讨大豆裂荚的分子机理;同时发掘大豆种质资源中优异的抗裂荚种质和基因资源,开发新的功能标记,有望通过分子标记辅助选择技术进行大豆抗裂荚的种质资源创新和遗传改良。
英文摘要
The pod dehiscence is one of the important factors affecting the yield of soybean. Allelic genes for pod dehiscence tolerance are abundant in soybean germplasm. In order to identify the new genes with tolerance to pod dehiscence in soybean, the research on the one hand will carry out genome-wide association analysis through using a natural soybean population with 219 varieties. On the other hand, we will identify the major QTL loci through linkage mapping using two recombinant inbred lines (RILs) populations. Through these ways, the candidate genes related to soybean pod dehiscence will be identified by combining the soybean genome resources and bioinformatics. Through analyzing the biological roles for the genes involved in pod dehiscence tolerance, this study aims to explain the molecular mechanism for pod dehiscence. This project will explore the excellent soybean germplasm with pod dehiscence tolerance and identify and develop new genes and functional markers, to improve the pod dehiscence tolerance in soybean through marker assistant selection.
荚在收获之前或期间开裂会导致产量损失,高效发掘大豆种质资源中蕴含的抗裂荚优异新基因具有重要意义。本研究利用重组自交家系获得与裂荚相关的5个主效QTL;利用全基因组关联分析的方法共检测到与裂荚显著相关的163个的SNP位点,其中Chr.9和Chr.16上形成SNP标记簇,并且这两个位点被多个环境都鉴定到。在此基础上利用生物信息学方法确定了Glyma02g302400、Glyma08g42120、Glyma08g42220、Glyma08g4199和Glyma09g06290作为候选基因,并进行了功能研究,同时筛选出抗裂荚的优异种质资源和易裂荚的种质资源各20份。此外本研究还分析了Glyma09g06290等位基因变异与大豆裂荚的关系,共鉴定出三个SNP和两个Indel(插入和删除),关联研究表明这5个位点与大豆裂荚显著相关,根据其中一个SNP标记S_500开发了dCAPS标记,进而通过不同高低裂荚率的材料证实了基于S_500的dCAPS是有效的,可通过分子标记辅助选择技术针对抗裂荚性状进行大豆种质创新和改良。本研究已经发表该项目资助的SCI收录论文5篇,核心期刊论文1篇,申请国家发明专利2项,培养博士研究生2名,硕士研究生2名。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
GmMYB181, a Soybean R2R3-MYB Protein, Increases Branch Number in Transgenic Arabidopsis.
GmMYB181 是一种大豆 R2R3-MYB 蛋白,可增加转基因拟南芥的分枝数量。
DOI: 10.3389/fpls.2018.01027
发表时间: 2018
期刊: Frontiers in plant science
影响因子: 5.6
作者: [Yang H, Xue Q, Zhang Z, Du J, Yu D, Huang F]
通讯作者: Huang F
Overexpression of a soybean YABBY gene, GmFILa, causes leaf curling in Arabidopsis thaliana
大豆 YABBY 基因 GmFILa 的过度表达导致拟南芥卷叶
DOI: 10.1186/s12870-019-1810-2
发表时间: 2019-06
期刊: BMC Plant Biology
影响因子: 5.3
作者: [Yang Hui, Shi Guixia, Li Xiao, Hu Dezhou, Cui Yanmei, Hou Jinfeng, Yu Deyue, Huang Fang]
通讯作者: Huang Fang
Identification of Loci and Candidate Genes Responsible for Pod Dehiscence in Soybean via Genome-Wide Association Analysis Across Multiple Environments
通过跨多个环境的全基因组关联分析鉴定导致大豆豆荚开裂的基因座和候选基因
DOI: 10.3389/fpls.2019.00811
发表时间: 2019-06-21
期刊: FRONTIERS IN PLANT SCIENCE
影响因子: 5.6
作者: [Hu, Dezhou, Kan, Guizhen, Yu, Deyue]
通讯作者: Yu, Deyue
Genome-Wide Analysis of Soybean LATERAL ORGAN BOUNDARIES Domain-Containing Genes: A Functional Investigation of GmLBD12
大豆侧器官边界含结构域基因的全基因组分析:GmLBD12 的功能研究
DOI: 10.3835/plantgenome2016.07.0058
发表时间: 2017
期刊: Plant Genome
影响因子: 4.2
作者: [Yang Hui, Shi Guixia, Du Hongyang, Wang Hong, Zhang Zhenzhen, Hu Dezhou, Wang Jiao, Huang Fang, Yu Deyue]
通讯作者: Yu Deyue
6
    一个PP2C蛋白磷酸酶调控大豆光合效率和产量的机理研究
    • 批准号:
      32372174
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      50万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      黄方
    • 依托单位:
    大豆高蛋白新基因的鉴定和功能标记的开发
    • 批准号:
      31871649
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      60.0万元
    • 批准年份:
      2018
    • 负责人:
      黄方
    • 依托单位:
    GmAGL1调控大豆裂荚的分子机理研究
    • 批准号:
      31371644
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      70.0万元
    • 批准年份:
      2013
    • 负责人:
      黄方
    • 依托单位:
    GmMADS1在大豆花发育中的调控机理研究
    • 批准号:
      30800692
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      22.0万元
    • 批准年份:
      2008
    • 负责人:
      黄方
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金