MKK7基因编码区罕见遗传变异对人群肺癌发病和预后的影响
批准号:
81273149
项目类别:
面上项目
资助金额:
80.0 万元
负责人:
吕嘉春
依托单位:
学科分类:
H3010.非传染病流行病学
结题年份:
2016
批准年份:
2012
项目状态:
已结题
项目参与者:
宾晓农、方沈应、黎银燕、张岚、王辉、杨磊、杨荣荣、姜岚、邓杰琼
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中文摘要
"罕见变异引起常见疾病"是探讨疾病易感基因的新思路,肿瘤被认为是多个罕见事件累积的结果。课题组前期发现MKK7基因罕见的遗传变异E116K与肺癌发病高度关联且使患者生存期缩短;MKK7是丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路的核心分子,能抑制H-ras1等癌基因的作用,广泛参与调控细胞增殖、分化、衰老、凋亡及炎症等过程,被认为是肿瘤抑制基因。生物信息学分析发现该基因还有4个具潜在功能的编码区罕见变异,其累积效应极可能影响肺癌的发生发展。本项目拟在两中心、大样本人群(3000对)检测上述变异及酶活性等表型,探讨其与肺癌发病和预后的关联;构建系列含上述变异的人支气管上皮模式细胞系,观察致癌物作用下其癌变的动态过程;建立哺乳动物双杂交系统检测蛋白-蛋白相互作用,并利用模式细胞系研究上述变异对H-ras1致癌作用的影响;揭示MKK7罕见变异的生物学功能,阐明肺癌变机制,为肺癌防治提供科学依据。
英文摘要
"Common diseases-Rare variant" is recently proposed rationale for screening susceptible gene of complex diseases, and tumor is considered to be the result of cumulative events. Our previous study have found that a rare variant (E116K) in coding region of MKK7 gene contributed to a significantly increased risk and poor survival of lung cancer. As we known, MKK7 is a core molecule of mitogen-activated protein kinase pathway (MAPK) that plays decisive role in regulation of multiple cell process including cell proliferation, differentiation, senescence, apoptosis and inflammation. By inhibiting the tumorgenesis role of oncogenes like H-ras1, MKK7 is considered to be a tumor suppressor gene. Further bioinformatics analysis shown that there are five putative functional rare genetic variants in coding region of MKK7, these variants may influence the function of MKK7, therefore, we hypothesize that the cumulative genetic effect of MKK7 rare variants may harbor role in the occurrence and development of lung cancer. Here, this project intends to investigate the association between MKK7 rare variants and lung cancer risk as well as prognosis by genotyping these variants and detecting genotype-phenotype (i.e., kinase activity) correlation in two independent case-control studies with large sample size (3000 cases and 3000 controls); and to observe the genetic effect of these variants on influencing the kinetic alterations of lung canceration under the stimulation of carcinogens or X-ray through construction of a series human bronchial epithelial model cell lines comprising the above variants; with the model cell lines and constructed mammalian two-hybrid system, to detect the protein-protein interaction to reveal the effect of above variant on carcinogenic function of H-ras1. Eventually, to illustrate the biological mechanism of MKK7 rare variations on lung carcinogenesis, the project will help to clarify the mechanism of lung cancer pathology, and provide scientific evidences for prevention and treatment of lung cancer.
本研究基于“罕见变异-常见疾病”的理论假说,采用大样本,双中心的病例对照研究,探索了MKK7编码区多个潜在功能性罕见变异与我国人群肺癌发生发展的关系及关联位点的分子生物学功能。项目共新收集肺癌病例3000余例和性别相同,年龄相近的对照3000余例。利用直接测序法,在共计5016例病例和5181例对照中检测了MKK7基因5个罕见变异位点p. Glu116Lys(rs28395770G>A)、p.Asn118Ser (rs56316660A>G)、p.Arg138Cys(rs56106612C>T)、p.Ala195Thr (rs55800262G>A)和p.Leu259Phe(rs1053566 C>T)的基因型,仅发现p.Glu116Lys位点与我国人群肺癌发生发展存在显著相关,而其他四个位点不存在显著关联。相较于116Glu纯合基因型携带者,116Lys变异基因型携带者发生肺癌的风险显著上升(OR=3.29; 95%CI=2.70-4.01)。并且,116Lys基因型能显著增加肺癌发生转移的概率,缩短携带肺癌患者的中位生存期(-5个月),提高肺癌病死率(HR=1.53; 95%CI=1.32-1.78)。位点组合分析同样显示p. Glu116Lys在我国人群肺癌易感性中占主要效应。系列功能研究证实MKK7蛋白116位氨基酸由Glu变异为Lys,在体内和体外水平,均能显著增加MKK7蛋白的促肿瘤细胞生长、增殖、转移和侵袭能力,但其不影响MKK7蛋白的激酶活性。基因芯片分析显示该变异能显著改变多个肿瘤关联基因的表达及信号通路的活性。此外,两种携带不同氨基酸的MKK7蛋白均未检测到与H-ras1蛋白存在交互效应。上述结果表明MKK7基因编码区p.Glu116Lys罕见变异能显著影响我国人群肺癌的发病风险和肺癌患者的预后,是我国人群肺癌易感和预后效果评估的潜在生物标志。本结果后续可用于我国人群肺癌风险和预后效果评估,为肺癌高危人群的筛选和肺癌的靶向防治提供科学依据。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.3390/ijms151017457
发表时间:2014-09-29
期刊:International journal of molecular sciences
影响因子:5.6
作者:Zhang L;Qiu F;Lu X;Li Y;Fang W;Zhang L;Zhou Y;Yang L;Lu J
通讯作者:Lu J
Functional genetic polymorphisms in PP2A subunit genes confer increased risks of lung cancer in southern and eastern Chinese.
PP2A 亚基基因的功能性遗传多态性导致中国南部和东部地区患肺癌的风险增加
DOI:10.1371/journal.pone.0077285
发表时间:2013
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Yang R;Yang L;Qiu F;Zhang L;Wang H;Yang X;Deng J;Fang W;Zhou Y;Lu J
通讯作者:Lu J
Risk factors shared by COPD and lung cancer and mediation effect of COPD: two center case-control studies
COPD与肺癌共有的危险因素及COPD的中介作用:两项中心病例对照研究
DOI:10.1007/s10552-014-0475-2
发表时间:2015
期刊:Cancer Causes & Control
影响因子:2.3
作者:Yang Lei;Lu Xiaoxiao;Deng Jieqiong;Zhou Yumin;Huang Dongsheng;Qiu Fuman;Yang Xiaorong;Yang Rongrong;Fang Wenxiang;Ran Pixin;Zhong Nanshan;Zhou Yifeng;Fang Shenying;Lu Jiachun
通讯作者:Lu Jiachun
Sequence Variation in Mature MicroRNA-499 Confers Unfavorable Prognosis of Lung Cancer Patients Treated with Platinum-Based Chemotherapy
成熟 MicroRNA-499 的序列变异导致接受铂类化疗的肺癌患者预后不良。
DOI:10.1158/1078-0432.ccr-14-1174
发表时间:2015-04-01
期刊:CLINICAL CANCER RESEARCH
影响因子:11.5
作者:Qiu, Fuman;Yang, Lei;Lu, Jiachun
通讯作者:Lu, Jiachun
The role of WWOX polymorphisms on COPD susceptibility and pulmonary function traits in Chinese: a case-control study and family-based analysis.
WWOX 多态性对中国人 COPD 易感性和肺功能特征的作用:病例对照研究和基于家系的分析。
DOI:10.1038/srep21716
发表时间:2016-02-23
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Xie C;Chen X;Qiu F;Zhang L;Wu D;Chen J;Yang L;Lu J
通讯作者:Lu J
生物燃料烟雾诱发X染色体失活偏移在女性肺癌发病中的作用及机制研究
- 批准号:82373678
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:49万元
- 批准年份:2023
- 负责人:吕嘉春
- 依托单位:
外泌体内癌基因CEACAM6在吸烟和PM2.5复合暴露致肺癌发病风险中的作用及功能验证
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55万元
- 批准年份:2021
- 负责人:吕嘉春
- 依托单位:
Alu序列的indel遗传变异影响circRNA0050386剪接在肺癌发生发展的作用及机制研究
- 批准号:81872694
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:58.0万元
- 批准年份:2018
- 负责人:吕嘉春
- 依托单位:
假基因GOLGA2P10拷贝数变异调控癌基因GOLGA2与人群肺癌发生发展的关联及其分子机制研究
- 批准号:81673267
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:65.0万元
- 批准年份:2016
- 负责人:吕嘉春
- 依托单位:
长链非编码RNA FENDRR拷贝数变异调控Snail1基因影响人群肺癌发病和预后的研究
- 批准号:81473040
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:85.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:吕嘉春
- 依托单位:
WWOX基因拷贝数和单核苷酸遗传变异影响人群肺癌发病的分子流行病学研究
- 批准号:81072366
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:10.0万元
- 批准年份:2010
- 负责人:吕嘉春
- 依托单位:
NBS1基因功能性遗传变异的证实与人群肺癌易感性研究
- 批准号:30872178
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:34.0万元
- 批准年份:2008
- 负责人:吕嘉春
- 依托单位:
Pin1基因启动子的遗传变异与肺癌环境危险因素的交互作用
- 批准号:30671813
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:29.0万元
- 批准年份:2006
- 负责人:吕嘉春
- 依托单位:
芳香烃受体(AhR)介导二恶英致癌机制的研究
- 批准号:30371196
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:7.0万元
- 批准年份:2003
- 负责人:吕嘉春
- 依托单位:
DNA损伤的识别分子在肺癌发生中的作用
- 批准号:30200235
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:19.0万元
- 批准年份:2002
- 负责人:吕嘉春
- 依托单位:
国内基金
海外基金















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