链霉菌基因组岛的比较组学研究
批准号：
30871345
项目类别：
面上项目
资助金额：
33.0 万元
负责人：
欧竑宇
依托单位：
学科分类：
基因表达及非编码序列调控
结题年份：
2011
批准年份：
2008
项目状态：
已结题
项目参与者：
谢新强、吴杭、韩铁生、刘光
项目摘要
结项摘要
项目成果
欧竑宇的其他基金
相似基金
相关文献
中文摘要
链霉菌是研究微生物遗传多样性的良好模式材料。对已测序链霉菌的比较分析表明，其染色体不稳定，结构较其他细菌复杂，由较保守的核心区及高度可变的两臂组成；更为重要的是，许多与抗生素合成和致病性等相关的基因簇以基因组岛的形式插入到染色体上。通过水平转移获得的基因组岛有助于维持宿主在特定生态环境中获得优势。本项目拟分析天蓝色链霉菌的重要基因组岛, 包括砷抗性基因组岛及DNA硫修饰依赖型限制系统基因组岛；结合生物信息学和分子实验技术搜索和确定变铅青链霉菌核心区新基因组岛；识别已测序的井冈霉素高产菌吸水链霉菌井冈变种5008的基因组岛。探讨基因组岛对链霉菌基因组稳定性的影响，并为大规模挖掘链霉菌可移动基因组和研究其对遗传多样性和进化的影响提供坚实基础。
英文摘要
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
登录
查看更多内容
ICEberg: a web-based resource for integrative and conjugative elements found in Bacteria.
ICEberg：细菌中发现的整合和共轭元素的网络资源
ICEberg：细菌中发现的整合和共轭元素的网络资源
DOI：
10.1093/nar/gkr846
发表时间：
2012-01
期刊：
Nucleic acids research
影响因子：
14.9
作者：
[Bi D, Xu Z, Harrison EM, Tai C, Wei Y, He X, Jia S, Deng Z, Rajakumar K, Ou HY]
通讯作者：
Ou HY
DOI：
10.1371/journal.pone.0005132
发表时间：
2009
期刊：
PloS one
影响因子：
3.7
作者：
[Ou HY, He X, Shao Y, Tai C, Rajakumar K, Deng Z]
通讯作者：
Deng Z
DOI：
10.1093/nar/gkq326
发表时间：
2010-07
期刊：
Nucleic acids research
影响因子：
14.9
作者：
[Shao Y, He X, Harrison EM, Tai C, Ou HY, Rajakumar K, Deng Z]
通讯作者：
Deng Z
DOI：
10.1093/nar/gkq908
发表时间：
2011-01
期刊：
Nucleic acids research
影响因子：
14.9
作者：
[Shao Y, Harrison EM, Bi D, Tai C, He X, Ou HY, Rajakumar K, Deng Z]
通讯作者：
Deng Z
Cleavage of Phosphothioated DNA and Methylated DNA by the Type IV Restriction Endonuclease ScoMcrA
IV 型限制性内切酶 ScoMcrA 对硫代磷酸化 DNA 和甲基化 DNA 的切割
IV 型限制性内切酶 ScoMcrA 对硫代磷酸化 DNA 和甲基化 DNA 的切割
DOI：
--
发表时间：
--
期刊：
PLoS Genetics
影响因子：
4.5
作者：
[T. Wang, H.Y. Ou, H. Tan, X. He, G. Liu, K. Rajakumar, X. Zhou, L. Li, Z. Deng]
通讯作者：
Z. Deng
共 6 条
tRNA基因启动子起动整合性接合元件ICEKp1整合酶转录的机制研究
-
批准号：32070572
-
项目类别：面上项目
-
资助金额：58.0万元
-
批准年份：2020
-
负责人：欧竑宇
-
依托单位：
肺炎克雷伯菌VI型分泌系统的功能及其基因水平转移的研究
-
批准号：31670074
-
项目类别：面上项目
-
资助金额：63.0万元
-
批准年份：2016
-
负责人：欧竑宇
-
依托单位：
卡特利链霉菌基因组挖掘: 巨型线性质粒与ε-聚赖氨酸合成
-
批准号：31371261
-
项目类别：面上项目
-
资助金额：100.0万元
-
批准年份：2013
-
负责人：欧竑宇
-
依托单位：
肺炎克雷伯菌基因组岛的功能研究与比较分析
-
批准号：31170082
-
项目类别：面上项目
-
资助金额：60.0万元
-
批准年份：2011
-
负责人：欧竑宇
-
依托单位：
基于比较基因组学的方法搜索细菌外源基因池
-
批准号：30700013
-
项目类别：青年科学基金项目
-
资助金额：16.0万元
-
批准年份：2007
-
负责人：欧竑宇
-
依托单位：
国内基金
海外基金