嗜热自养甲烷杆菌二硫键异构酶的结构功能及其适热性的分子机制
批准号:
31160019
项目类别:
地区科学基金项目
资助金额:
50.0 万元
负责人:
丁霞
依托单位:
学科分类:
微生物生理与生化
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
吴丽萍、彭晓珏、雷涵、吴娣、柳全文、傅奇
中文摘要
生物体的生存依赖于体内蛋白质的正确折叠。嗜热古菌生活在极端高温环境,研究其蛋白质在高温环境下正确折叠的分子机制具有重要意义。申请人前期的工作表明,嗜热自养甲烷杆菌二硫键异构酶(mtPDI)的表达受温度的调控,且mtPDI可以提高细胞的热耐受性,但其分子机制尚不清楚。本项目将从mtPDI操纵子结构解析着手,通过分析操纵子结构基因和免疫共沉淀获得mtPDI功能相关基因,构建mtPDI蛋白质突变体解析其蛋白质结构域,抑制mtPDI酶活性以分析mtPDI功能缺失对细胞的影响,分析不同温度下mtPDI及其功能相关蛋白质的细胞内的定位、表达特征、及功能相关蛋白对mtPDI酶活的影响,分析mtPDI及功能相关蛋白协同表达与大肠杆菌的热耐受性之间的关系,以期阐明mtPDI在二硫键形成和细胞适热的机制。本研究将有助于阐明嗜热古菌适热生存的分子机制。
英文摘要
生物体的生存依赖于体内蛋白质的正确折叠。嗜热古菌生活在极端高温环境,研究其蛋白质在高温环境下正确折叠的分子机制具有重要意义。申请人前期的工作表明,嗜热自养甲烷杆菌二硫键异构酶(mtPDI)的表达受温度的调控,且mtPDI可以提高细胞的热耐受性,但其分子机制尚不清楚。本项目通过RT-PCR分析确定了 mtPDI的ORF组成,结果表明mtPDI操纵子中ORF只由mtPDI组成,mtPDI(MTH1745)、MTH1744 和MTH1746分别会转录成mRNA, 但不与mtPDI在同一个操纵子中。构建mtPDI关键结构域中“CXXC”的两个半胱氨酸的单点突变和双点突变(C74S,C77S,C74S-C77S),发现点突变任何一个半胱氨酸都将影响mtPDI的二硫键异构酶活性。接下来,我们分析mtPDI的细胞定位,实验表明mtPDI主要分布在细胞膜上。高温和冷刺激都会提高mtPDI mRNA的含量。但不同于mRNA水平,蛋白质水平调控与此不同,高温(70℃)可诱导mtPDI蛋白质表达量增高,冷激对mtPDI蛋白质表达量变化影响不显著。可能温度胁迫下,高温和冷激对mtPDI的表达调控作用机制不一样。分别用PDI抑制剂DNTB或mtPDI单克隆抗体抑制细胞膜上的PDI,DTNB会明显抑制细胞的生长,扫描电镜观察到mtPDI单克隆抗体的加入会影响细胞膜的结构,在细胞膜上形成更致密的凸起状结构,其机制还不清楚。我们分析了mtPDI与水稻的耐热性之间的关系,成功构建了mtPDI转基因水稻,证明mtPDI能够帮助水稻耐高温。为了进一步深入研究PDI在细胞中的功能,我们采用CO-IP方法找到一些具有意义的候选相互作用蛋白质,这将为研究mtPDI互作蛋白其功能奠定了基础。同时我们用iTRAQ得到大量与嗜热自养甲烷杆菌高温和冷激胁迫下差异表达的蛋白质,从蛋白质组水平分析不同温度胁迫下,甲烷菌将采用怎样的pathway应对外界胁迫的。本研究得到大量有意义的结果,将有助于阐明嗜热古菌适热生存的分子机制。
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Diversity of bacteria and archaea in the deep-sea low-temperature hydrothermal sulfide chimney of the Northeastern Pacific Ocean
东北太平洋深海低温热液硫化物烟囱细菌和古菌多样性
DOI:
10.5897/ajb11.2692
发表时间:
2011-01
期刊:
African Journal of Biotechnology
影响因子:
--
作者:
[Xia Ding, Xiao-Jue Peng, Xiao-Tong Peng, Huai-Yang Zhou]
通讯作者:
Huai-Yang Zhou
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
应用与环境生物学报
影响因子:
--
作者:
[丁霞, 王芳, 李阳生, 蔡耀辉]
通讯作者:
蔡耀辉
Overexpression of a Vesicle Trafficking Gene, OsRab7, enhances salt tolerance in rice.
囊泡运输基因 OsRab7 的过度表达增强了水稻的耐盐性
DOI:
10.1155/2014/483526
发表时间:
2014
期刊:
TheScientificWorldJournal
影响因子:
--
作者:
[Peng X, Ding X, Chang T, Wang Z, Liu R, Zeng X, Cai Y, Zhu Y]
通讯作者:
Zhu Y
Spatial distribution of bacterial communities driven by multiple environmental factors in a beach wetland of the largest freshwater lake in China.
多重环境因素驱动下中国最大淡水湖滩涂湿地细菌群落空间分布
DOI:
10.3389/fmicb.2015.00129
发表时间:
2015
期刊:
Frontiers in microbiology
影响因子:
5.2
作者:
[Ding X, Peng XJ, Jin BS, Xiao M, Chen JK, Li B, Fang CM, Nie M]
通讯作者:
Nie M
Regulation of ATRIP protein abundance by RAD9 in the DNA damage repair pathway.
DNA 损伤修复途径中 RAD9 对 ATRIP 蛋白丰度的调节。
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
Cell Mol Biol (Noisy-le-grand)
影响因子:
--
作者:
[Cai, Y-H, Li, B-M, Hang, H-Y, Ding, X]
通讯作者:
Ding, X
共 6 条
水稻甲烷代谢微生物的生物固氮及其CH4-N2代谢调控机制
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批准号:32260023
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:33万元
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批准年份:2022
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负责人:丁霞
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依托单位:
皮肤共生菌移植(AMT)抑制特应性皮炎病原菌S. aureus的作用机制研究
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批准号:81960364
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:34.0万元
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批准年份:2019
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负责人:丁霞
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依托单位:
肠道微生态失调与易感基因Neuregulin 1在精神分裂症中的交互作用研究
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批准号:81501162
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:19.0万元
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批准年份:2015
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负责人:丁霞
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依托单位:
长雄野生稻内生菌的群落结构特征及其抗逆功能研究
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批准号:31560041
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:40.0万元
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批准年份:2015
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负责人:丁霞
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依托单位:
国内基金
海外基金