肿瘤细胞表面RNA生成机制和生物学功能研究

批准号:
31470782
项目类别:
面上项目
资助金额:
85.0 万元
负责人:
郑晓飞
依托单位:
学科分类:
C0509.生物学过程与代谢
结题年份:
2018
批准年份:
2014
项目状态:
已结题
项目参与者:
朱捷、沈远、钟一然、姚婉
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中文摘要
新类型RNA的系统识别和生物学功能研究是RNA研究最重要内容之一。细胞表面RNA(cell surface-bound RNA)的存在已经得到证实,但是对于细胞表面RNA缺少深入系统研究。本研究将在我们已有研究基础上,以肿瘤细胞为模型,对肿瘤细胞表面结合RNA进行高通量RNA测序、验证和生物信息学分析,获得典型的肿瘤细胞系的细胞表面RNA表达谱,发现其表达模式;探讨其在不同的干预条件下RNA分子的完整性、结合状态和递呈变化,阐释细胞表面RNA加工生成机制;进一步选择典型的特定细胞表面RNA分子(线粒体RNA/mRNA/lncRNA等),分析其对细胞增殖、克隆形成、细胞周期、细胞凋亡、侵袭转移能力等细胞生物学功能的影响,进而揭示肿瘤细胞表面RNA的生物学功能。通过基于肿瘤细胞表面RNA研究所获得的发现,将从一个全新的角度揭示RNA生物学功能的多样性,为肿瘤的研究和治疗提供新的技术和思路。
英文摘要
System identification on a new type of RNA and research on its biological function is one of the most important research areas about RNA. Cell surface-bound RNA has been confirmed, however, the scientists don't understand cell surface-bound RNA systematically and deeply. In this study, based on our previous studies, the first, we will identify cell surface-bound RNAs in different cancer cell line models by high-throughut RNA-sequencing and obtain the typical tumor cell line expression profile of cell surface-bound RNA, and we also found the expression pattern of cancer cell surface-bound RNA by bioinformatics analysis. The second, we will investigate the molecule integrity, binding status and presentation on the cell surface of cell surface-bound RNA and preliminary illuminate the biogenesis mechanism of cell surface-bound RNA. The third, further selection of the typical cell surface-bound RNAs(e.g. mitochondrial RNA/mRNA/lncRNA, etc.), we will study their effects on the cell proliferation, cell clone formation, cell cycle, cell apoptosis, cell invasion and metastasis and then reveal the biological function of cancer cell surface-bound RNA. As a result of our research findings based on the tumor cell surface-bound RNA, we will be from a new perspective to reveal the diversity of the biological functions of RNA and these research findings will also provide new technologies and ideas for cancer research and treatment.
细胞中存在不同类型的RNA分子,研究已经证明了不同种类的RNA分子均在生物体中发挥各自重要的生物学功能。但是作为新类型的RNA 分子,人们对于细胞表面RNA的了解还甚少。本研究的主要内容是进一步证实细胞表面RNA的存在,揭示肿瘤细胞表面RNA表达谱和存在状态,阐释细胞表面RNA分子的功能。我们建立了基于超滤技术的细胞表面RNA制备方法,采用该方法制备了不同类型细胞表面RNA,并通过基因芯片等技术获得了其表达谱,生物信息学分析结果表明细胞表面RNA与细胞总RNA相比较具有独自的表达特征。利用RNA酶A对RNA的消化能力研究细胞表面RNA分子的生物学功能表明,使用RNA酶A处理HepG2细胞,细胞离散性增强,细胞迁移性减弱;RNA酶A处理HUVEC细胞,对细胞管腔形成有明显的影响,细胞管腔形成能力减弱。上述结果初步表明细胞表面RNA分子具有重要的生物学功能。细胞表面RNA的证实和初步的功能研究结果为细胞表面RNA的深入研究提供了基础,细胞表面RNA的研究将丰富对RNA的认识,同时对全面阐释RNA的种类和生物功能多样性具有重要意义。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:--
发表时间:2015
期刊:中国医学科学院学报
影响因子:--
作者:郑晓飞
通讯作者:郑晓飞
DOI:--
发表时间:2016
期刊:生命科学
影响因子:--
作者:郑晓飞
通讯作者:郑晓飞
DOI:--
发表时间:2018
期刊:军事医学
影响因子:--
作者:薛勇;田宝磊;付汉江;葛常辉;李清;郑晓飞
通讯作者:郑晓飞
A long non-coding RNA lncRNA-PE promotes invasion and epithelial-mesenchymal transition in hepatocellular carcinoma through the miR-200a/b-ZEB1 pathway
长非编码RNA lncRNA-PE通过miR-200a/b-ZEB1途径促进肝细胞癌的侵袭和上皮间质转化
DOI:10.1177/1010428317705756
发表时间:2017
期刊:Tumor Biology
影响因子:--
作者:Shen Y;Liu S;Yuan H;Ying X;Fu H;Zheng X
通讯作者:Zheng X
DOI:--
发表时间:2018
期刊:军事医学
影响因子:--
作者:薛勇;付汉江;葛常辉;李清;郑晓飞
通讯作者:郑晓飞
辐射诱导RNA分子8-羟基鸟嘌呤动态修饰规律和生物学功能研究
- 批准号:32071290
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:58万元
- 批准年份:2020
- 负责人:郑晓飞
- 依托单位:
长链非编码RNA稳定性相关RNA结构元件与RNA降解关系研究
- 批准号:91540202
- 项目类别:重大研究计划
- 资助金额:290.0万元
- 批准年份:2015
- 负责人:郑晓飞
- 依托单位:
RNase L加工生成miRNA机制及生物学意义研究
- 批准号:31270836
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:80.0万元
- 批准年份:2012
- 负责人:郑晓飞
- 依托单位:
tRNA半分子的细胞调控功能研究
- 批准号:31070702
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:40.0万元
- 批准年份:2010
- 负责人:郑晓飞
- 依托单位:
新的pre-miRNA生成核酸酶的发现和功能研究
- 批准号:30870529
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:32.0万元
- 批准年份:2008
- 负责人:郑晓飞
- 依托单位:
half-tRNA克隆分析及其生物学功能研究
- 批准号:30670440
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:30.0万元
- 批准年份:2006
- 负责人:郑晓飞
- 依托单位:
细胞外通讯RNA克隆分析及其在肿瘤细胞中的作用
- 批准号:30470899
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:21.0万元
- 批准年份:2004
- 负责人:郑晓飞
- 依托单位:
肝细胞特异表达hTRT反义载体构建及抗肝癌作用研究
- 批准号:30070859
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:16.0万元
- 批准年份:2000
- 负责人:郑晓飞
- 依托单位:
国内基金
海外基金
