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辐射诱导RNA分子8-羟基鸟嘌呤动态修饰规律和生物学功能研究

批准号:
32071290
项目类别:
面上项目
资助金额:
58.0 万元
负责人:
郑晓飞
学科分类:
核酸生物化学
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
郑晓飞

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
细胞中RNA氧化修饰普遍存在,与多种应激反应和疾病密切相关。8-羟基鸟嘌呤(8-OHG)是RNA氧化损伤修饰的重要形式,但其修饰规律和调控生物分子功能尚未得到阐明。本研究以辐射和过氧化氢诱导RNA分子8-OHG修饰的细胞为模型,采用我们在RNA的m6A修饰建库测序方法基础上改进的HyRIP-Seq和HiCLIP-Seq方法对RNA8-OHG修饰进行高通量分析,获得辐射诱导细胞8-OHG修饰RNA表达谱,揭示其修饰的动态规律;采用全基因组CRISPR-Cas9文库技术筛选参与8-OHG修饰RNA功能调控蛋白分子,同时探讨DNA损伤反应中重要分子ATM(ataxia telangiectasia-mutated gene)在RNA氧化损伤中的作用,阐释8-羟基鸟嘌呤动态修饰RNA的功能和调控作用。本研究将为全面揭示RNA8-OHG动态修饰特征和调控机制奠定基础。
英文摘要
Oxidative modifications of RNAs in cells are ubiquitous and are related to a variety of biological stress responses and diseases. 8-hydroxyguanine is an important modified type of RNA oxidative damage, but its modified pattern and regulatory mechanism have not been elucidated. In this study, the cell model of 8-hydroxyguanidine modification induced by radiation and hydrogen peroxide was used. We improved the HyRIP-Seq and HiCLIP-Seq methods based on the RNA m6A modified library sequencing method for RNA 8-hydroxyguanine modification analysis. The modified pattern and the dynamics of its modification with radiation-induced expression of 8-hydroxyguanine in RNAs will be revealed. Then,whole-genome CRISPR-Cas9 library technology will be used to screen for functional regulatory proteins of 8-hydroxyguanine-modified RNAs and we will investigate the role of ATM (ataxia telangiectasia-mutated gene) in RNA oxidative damage. These results will be disclosure of the characteristics and regulatory mechanisms of dynamic modification of RNAs.
细胞中RNA氧化修饰普遍存在,与多种应激反应和疾病密切相关。8-羟基鸟嘌呤(8-hydroxyguanine,8-OHG)是RNA氧化损伤修饰的重要形式,但其修饰规律和调控生物分子功能尚未得到阐明。本研究以辐射和过氧化氢诱导RNA分子8-OHG修饰的细胞为模型,通过高通量测序方法分析了A549细胞RNA 8-OHG修饰,发现RNA 8-OHG修饰呈现一定的规律性。通过体外氧化RNA方式建立了RNA氧化损伤细胞模型,研究结果表明氧化损伤RNA可以诱导ATM(ataxia telangiectasia-mutated,ATM)活化,氧化损伤RNA激活的ATM定位在细胞核中,且ATM参与介导氧化损伤RNA的稳定性。氧化损伤RNA可以诱导细胞衰老,抑制A549细胞增殖和诱导细胞周期阻滞。氧化RNA可以提高细胞中PRDX 1(perosiredoxin1,PRDX1)蛋白表达水平。在A549细胞过表达PRDX1,其上调ATM、SOD2(superoxide dismutase 2,SOD2)、ISG20(interferon-stimulated gene 20,ISG20)mRNA表达水平并减弱过氧化氢引起的mRNA氧化损伤,同时PRDX1蛋白水平影响ATM蛋白质水平及其磷酸化水平。在氧化或非氧化条件下,在细胞中PRDX1与ATM存在相互作用。本研究结果初步揭示了细胞内氧化RNA相关蛋白质分子调控机制,将有助于促进对细胞应激反应调控网络的认识和深入探究,并将为RNA氧化相关疾病的研究提供新的思路和方法。
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