禾本科植物抗病基因组的分子进化及物种间相互利用的研究
批准号:
30970198
项目类别:
面上项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
杨四海
依托单位:
学科分类:
植物系统发生与进化
结题年份:
2012
批准年份:
2009
项目状态:
已结题
项目参与者:
王强、曾水云、孙小芹、吴莹、王娇、张小辉、岳家兴、谭生军
中文摘要
植物病虫害给农业生产与生态环境带来巨大的经济损失与压力,合理、高效地利用植物抗病遗传资源是防治植物病害最为有效的方法。从基因组的水平上了解禾本科植物抗病基因组的遗传变异模式,不仅能够有效的评估禾本科植物抗病基因遗传资源与进化规律,而且为高效的保存和利用这些遗传资源、提高抗病育种效率提供新的思路与理论。本研究拟采用比较基因组学的方法,对四个完全测序的禾本科植物抗病基因组及抗稻瘟病基因类群进行系统比较与分类,充分揭示不同基因组内抗病基因的产生与保存方式、基因重复与丢失频率及其分子特征、选择压力与基因类型等分子遗传基础与基本演化方式,并根据各种遗传参数,在分子的水平上了解这些抗病基因独特的进化与遗传方式;根据抗稻瘟病基因类群遗传变异规律,通过转基因的方式,探讨物种间抗病基因相互利用的可能性与机制,丰富抗稻瘟病的遗传资源,为寻求水稻持久抗稻瘟病基因提供新的思路。
英文摘要
植物病虫害给农业生产与生态环境带来巨大的经济损失与压力,合理、高效地利用植物抗病遗传资源是防治植物病害最为有效的方法。本研究从基因组的水平上了解禾本科植物抗病基因组的遗传变异模式,不仅能够有效的评估禾本科植物抗病基因遗传资源与进化规律,而且为高效的保存和利用这些遗传资源、提高抗病育种效率提供新的思路与理论。本研究用比较基因组学的方法,对四个完全测序的禾本科植物抗病基因组及抗稻瘟病基因类群进行系统比较与分类,充分揭示不同基因组内抗病基因的产生与保存方式、基因重复与丢失频率及其分子特征、选择压力与基因类型等分子遗传基础与基本演化方式,并根据重要遗传参数对比与推导,在分子的水平上了解了这些抗病基因独特的进化与遗传方式。同时,研究以禾本科抗真菌类基因的共同特点,以水稻抗稻瘟病基因为范例,根据这一类群基因的遗传变异规律,对基因的功能进行了预测,并通过转基因的方式,初步探讨了物种间抗病基因相互利用的可能性与机制,极大的丰富抗稻瘟病的遗传资源,为寻求水稻抗稻瘟病基因提供了新的思路。
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Recent duplications drive rapid diversification of trypsin genes in 12 Drosophila
最近的重复导致 12 种果蝇胰蛋白酶基因快速多样化
DOI:
10.1007/s10709-012-9682-5
发表时间:
2012-09
期刊:
Genetica: the International Journal On Genetics
影响因子:
--
作者:
[Luolan Li, Shabana Memon, Yuanchu Fan, Sihai Yang, Shengjun Tan]
通讯作者:
Shengjun Tan
Genome-wide survey of pseudogenes in 80 fully re-sequenced Arabidopsis thaliana accessions.
对 80 个完全重测序的拟南芥种质中的假基因进行全基因组调查
DOI:
10.1371/journal.pone.0051769
发表时间:
2012
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Wang L, Si W, Yao Y, Tian D, Araki H, Yang S]
通讯作者:
Yang S
DOI:
10.1016/j.plantsci.2010.06.017
发表时间:
2010-10
期刊:
Plant Science
影响因子:
5.2
作者:
[Ping Tang;Ying Zhang;Xiaoqin Sun;Dacheng Tian;Sihai Yang;Jing Ding]
通讯作者:
Ping Tang;Ying Zhang;Xiaoqin Sun;Dacheng Tian;Sihai Yang;Jing Ding
Relative evolutionary rates of NBS-encoding genes revealed by soybean segmental duplication
大豆片段复制揭示NBS编码基因的相对进化速率
DOI:
10.1007/s00438-010-0587-7
发表时间:
2011-01-01
期刊:
MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS
影响因子:
3.1
作者:
[Zhang, Xiaohui, Feng, Ying, Chen, Jian-Qun]
通讯作者:
Chen, Jian-Qun
Strong Positive Selection Drives Rapid Diversification of R-Genes in Arabidopsis Relatives
强烈的正选择驱动拟南芥近缘种 R 基因的快速多样化
DOI:
10.1007/s00239-009-9316-4
发表时间:
2010-02-01
期刊:
JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION
影响因子:
3.9
作者:
[Chen, Qihan, Han, Zhaoxue, Yang, Sihai]
通讯作者:
Yang, Sihai
共 11 条
脉孢菌脱氨基酶类似基因的演化及其超突变功能的作用机制
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:54万元
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批准年份:2022
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负责人:杨四海
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依托单位:
以sd1基因位点为检测标记的水稻基因转换研究
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批准号:31870205
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项目类别:面上项目
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资助金额:60.0万元
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批准年份:2018
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负责人:杨四海
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依托单位:
基因组异质性对减数分裂重组影响的ChIP-seq实验验证
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批准号:91631104
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项目类别:重大研究计划
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资助金额:100.0万元
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批准年份:2016
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负责人:杨四海
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依托单位:
多年生植物减数分裂突变与重组的研究
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批准号:31671322
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项目类别:面上项目
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资助金额:70.0万元
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批准年份:2016
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负责人:杨四海
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依托单位:
国内基金
海外基金