肝脏不同细胞类型蛋白质组生物特性研究

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基本信息

项目摘要

肝脏是人体内最大的腺体，其主要功能包括物质代谢、防御、激素系统稳态、血液存储和pH调节、造血、免疫调节和器官结构形成和维持。正常肝脏中，不同类型的肝脏细胞既相互独立，又互相协同执行着肝脏完整的生物学功能。蛋白质组学研究的新方向是以细胞为单元的研究，肝脏蛋白质表达谱构建计划的目标之一，是构建肝脏不同细胞类型的蛋白质表达谱。本课题计划分离肝脏组织中肝实质细胞、肝窦内皮细胞、肝枯否氏细胞及肝星形细胞四种主要的细胞类型，并利用iTRAQ技术标记这些细胞来源的蛋白质组学样品，同时大规模鉴定和定量比较这些蛋白质，鉴定这些不同细胞类型特异性的蛋白质分子和信号途径，揭示肝脏特异功能的细胞和蛋白质组学基础。

结项摘要

实质性器官通常由多种类型的细胞组成，一般定义为实质细胞(PC)和非实质细胞(NPC)。到目前为止，器官的细胞组成特性都还不清楚。蛋白质组学有助于解析某一器官不同细胞类型分子特性，这将极大地扩展我们对器官形成及其细胞组成的认识。因此，我们构建了一个细胞水平的肝脏蛋白质图谱，在每种细胞类型中均鉴定到6000-8000个基因产物(GPs)，共10075个GPs。该数据集揭示了肝脏细胞组成的特性：(1)肝实质细胞（实质细胞类型）表达最少的、同质性最高，但最独特的蛋白质组模式，执行最基本的肝功能；(2) PC和NPC之间的劳动分工遵循“PC劳作，NPC触发”的模式；(3)NPC和PC之间的相互交流维持PC的表型。这项研究提供了细胞水平的肝脏蛋白质组数据集，并作为一种研究模型在分子水平解析细胞类型的组成和器官的特征。在本课题中，我们全面阐述了肝脏中各种类型细胞分工、协同、调控机制，进而揭示多细胞类型器官构成规律。

项目成果

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专利数量（0）
Regular patterns for proteome-wide distribution of protein abundance across species.
跨物种蛋白质丰度的蛋白质组范围分布的规律模式
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0032423
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    PloS one
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Zhong F;Yang D;Hao Y;Lin C;Jiang Y;Ying W;Wu S;Zhu Y;Liu S;Yang P;Qian X;He F
  • 通讯作者：
    He F
Network-based discovery of gene signature for vascular invasion prediction in HCC.
基于网络的 HCC 血管侵袭预测基因特征发现。
  • DOI：
    10.1016/j.jhep.2011.11.028
  • 发表时间：
    2012-06
  • 期刊：
    Journal of Hepatology
  • 影响因子：
    25.7
  • 作者：
    Liu W;He F;Jiang Y
  • 通讯作者：
    Jiang Y
A new insight into the impact of different proteases on SILAC quantitative proteome of the mouse liver. Proteomics
关于不同蛋白酶对小鼠肝脏 SILAC 定量蛋白质组影响的新见解。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    Proteomics
  • 影响因子：
    3.4
  • 作者：
    贺福初
  • 通讯作者：
    贺福初

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    贺福初;张成岗;李勇;陆承荣;张令强
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    张令强
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  • 发表时间：
    2015
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    --
  • 作者：
    屠欣怡;宋瑾;贺福初;周钢桥
  • 通讯作者：
    周钢桥
Reagent kit for auxiliary diagnosis of hepatoma
肝癌辅助诊断试剂盒
  • DOI：
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  • 发表时间：
    2010
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  • 影响因子：
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  • 通讯作者：
    齐菲菲
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    贺福初
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    生命的化学.2005,25（4）：281-4
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  • 作者：
    李怡;张令强;贺福初
  • 通讯作者：
    贺福初

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  • 项目类别：
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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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