发展和优化19F双量子偶极耦合脉冲序列及结合非天然氨基酸实现原位条件下蛋白质19F-19F距离测量
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:U1332138
- 项目类别:联合基金项目
- 资助金额:78.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:A3205.稳态强磁场
- 结题年份:2016
- 批准年份:2013
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2014-01-01 至2016-12-31
- 项目参与者:方葛敏; 张成伟; 李娟; 凌盛龙;
- 关键词:
项目摘要
19F is a 1/2 spin with 100% natural abundance and high gyromagnetic constant. In the passed years of studies, we have developed unnatural amino acid based 19F site-specific labeling and protein structure and dynamics analysis using nuclear magnetic resonance. To implement in situ protein dynamic conformation change and protein-protein interaction studies, accurate distance estimation between 19F-19F will be very important and necessary. .In this proposal, we will start from symmetry-based recoupling theory, select the best 19F-19F dipolar coupling double quantum methods, with exclusions of the unwanted or destructive interactions (19F chemical shift anisotropy, 1H-19F dipolar coupling and 19F chemical shift offsets) using Average Hamiltonian Theory (AHT) and its exclusion rules. Then, SIMPSON software will be applied to simulate the double quantum evolution. The double quantum filter efficiency estimations of different methods were applied to select the best double quantum methods, then to optimize the methods with implementation of supercycle, phase adjustment and dipolar coupling schemes. At the same time, new methods of double site specific 19F incorporation or double proteins with singly 19F incorporation are under development to achieve 19F-19F accurate distance measurement for protein conformation change and protein-protein interaction analysis, using the high field solid state NMR spectrometer with the high spinning rate magic angle spinning probe, in high magnetic field laboratory.
19F是一类高自然丰度、高旋磁比的1/2核自旋,我们过去的工作中发展了基于非天然氨基酸的19F定点标记和核磁共振的蛋白质结构和动力学分析。为了实现原位条件下蛋白质的动态结构变化和蛋白质相互作用研究,需要进一步发展高场高转速条件下19F-19F准确距离测量方法。.本项目将基于对称性同核偶极重耦合理论,应用平均哈密尔顿方法模拟多种自旋相互作用,有效排除对19F距离测量的不利因素(包括19F化学位移各向异性,1H-19F偶极耦合,19F化学位移变化等),获得19F双量子偶极耦合脉冲序列;进一步应用SIMPSON等模拟软件确认所选择的脉冲序列,优化超循环、相位及去耦条件,获得可靠的19F-19F准确距离测量的脉冲序列。同时发展蛋白质双位点或双蛋白质单点19F标记方法,在强磁场中心高场固体核磁共振和高速魔角旋转探头的支持下实现原位条件下19F-19F距离测量和蛋白质结构变化和相互作用分析。
结项摘要
本项目发展和优化了基于非天然氨基酸19F-tfmF的双标记技术,并在蛋白质的两个不同位点实现了19F标记,并根据19F-19F间的相互作用机制分析了蛋白质动态构象变化和蛋白质相互作用。同时,为了解决19F-tfmF的化学位移各向异性较小,而难以建立19F-19F同核偶极耦合和距离测量的实际问题,本项目引入了基于cys-的自由基双标记技术,并建立e-e之间的偶极耦合分析和距离测量,并应用双自由基标记样品,发展和优化了连续波(CW),脉冲(Double electron electron Resonance)电子自旋共振方法分析了多个膜蛋白的机构和动态构象变化。本项目发展的这些方法将对于进一步分析重要功能膜蛋白的动态构想变化及揭示其重要功能的物理化学机制具有非常重要的推动作用。依托本项目已经发表了7篇SCI论文,培养了2位博士研究生,1位硕士研究生。
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
CW-EPR studies revealed different motional properties and oligomeric states of the integrin beta1a transmembrane domain in detergent micelles or liposomes
CW-EPR 研究揭示了洗涤剂胶束或脂质体中整合素 β1a 跨膜结构域的不同运动特性和寡聚状态
- DOI:--
- 发表时间:2015
- 期刊:Scientific reports
- 影响因子:4.6
- 作者:Chaohua Lai;Ying Xiong;Longhua Zhang;Changlin Tian
- 通讯作者:Changlin Tian
General order parameter based correlation analysis of protein backbone motions between experimental NMR relaxation measurements and molecular dynamics simulations
基于通用序参数的实验 NMR 弛豫测量和分子动力学模拟之间蛋白质主链运动的相关性分析
- DOI:--
- 发表时间:2015
- 期刊:Biochemical and Biophysical Research Communications
- 影响因子:3.1
- 作者:Liu Q.;Shi C.;Yu L.;Zhang L.;Xiong Y.;Tian C.
- 通讯作者:Tian C.
Combined approaches of EPR and NMR illustrate only one transmembrane helix in the human IFITM3.
EPR 和 NMR 相结合的方法表明人类 IFITM3 中只有一个跨膜螺旋
- DOI:10.1038/srep24029
- 发表时间:2016-04-05
- 期刊:Scientific reports
- 影响因子:4.6
- 作者:Ling S;Zhang C;Wang W;Cai X;Yu L;Wu F;Zhang L;Tian C
- 通讯作者:Tian C
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其他文献
离子通道受其辅助亚基及外源性毒素调控的作用机制
- DOI:--
- 发表时间:2017
- 期刊:中国科学:生命科学
- 影响因子:--
- 作者:郭晓奇;文明;田长麟;张隆华
- 通讯作者:张隆华
其他文献
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