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拟南芥PPR基因AtECB2调控叶绿体转录本编辑及叶绿体发育的分子机理

批准号:
31370271
项目类别:
面上项目
资助金额:
82.0 万元
负责人:
杨仲南
依托单位:
学科分类:
植物光合与固氮
结题年份:
2017
批准年份:
2013
项目状态:
已结题
项目参与者:
黄超、赵湍湍、叶琳珊、成玲

项目摘要

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项目成果

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中文摘要
叶绿体中PPR家族成员广泛参与质体转录本的RNA编辑,但是对其分子机理的了解非常有限。AtECB2是该家族DYW亚群中的成员,调控拟南芥叶绿体转录本accD 和ndhF上3个位点的编辑,以及通过PEP(plastid encoded polymerase)依赖的质体基因表达调控叶绿体发育。本项目将结合遗传学,分子生物学和生物化学等相关技术深入研究ECB2调控叶绿体转录本编辑及叶绿体发育的机理,包括:1)确定AtECB2结合其靶位点序列及DYW结构域与RNA编辑的关系;2)鉴定与AtECB2一起参与RNA编辑的组分,分析与MORFs(Multiple organellar RNA editing factor)蛋白质家族是否有相互作用;3)阐明AtECB2影响质体基因表达的机理。
英文摘要
PPR members are widely involved in RNA editing in chloroplast. However, its molecular mechnism is quite limited. AtECB2 is a member of PPR-DYW. It regulates the editing of three sites in accD and ndhF, and chloroplast development through PEP-dependent plastid gene expression. In this project, we will investigate the molecular mechnism of AtECB2 in regulating RNA editing and chloroplast development using comprehensive techniques including genetics, molecular biology and biochemistry. This project will: 1) identify the binding sites of AtECB2 in accD and ndhF and the function of DYW domain for RNA editing; 2)characterize the factors associated with AtECB2 for RNA editing and analyze the involvement of MORFs(Multiple organellar RNA editing factor) in this process; 3)investigate the mechnism that AtECB2 affect PEP-dependent plastid gene expression.
叶绿体RNA编辑是基因转录后加工的一种主要形式,负责将前体RNA上特定位点的胞嘧啶C转换为尿嘧啶U。RNA编辑依赖于一大类的PPR家族蛋白和众多非PPR蛋白。我们前期的工作分离鉴定到了一个PPR蛋白AtECB2功能缺失的突变体atecb2-1,该突变体中叶绿体基因accD以及ndhF的编辑效率严重下降,但其分子机理不清楚。本项目中,我们对AtECB2调控叶绿体基因RNA编辑的机理进行了深入研究,取得了以下重要结果:1、RNA免疫共沉淀实验证明了AtECB2能够直接参与叶绿体基因的编辑过程。2、AtECB2的DYW结构域具有锌离子结合能力且对RNA编辑是必须的。3、质谱分析鉴定到了一个新的RNA编辑因子HEMC。4、HEMC介导AtECB2与非PPR蛋白MORF8互作。这些结果有助于进一步的了解叶绿体RNA编辑过程。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Rubisco accumulation is important for the greening of the fln2-4 mutant in Arabidopsis
Rubisco积累对于拟南芥fln2-4突变体的绿化很重要
DOI: 10.1016/j.plantsci.2015.04.005
发表时间: 2015-07-01
期刊: PLANT SCIENCE
影响因子: 5.2
作者: [Huang, Chao, Yu, Qing-Bo, Yang, Zhong-Nan]
通讯作者: Yang, Zhong-Nan
DOI: 10.3389/fpls.2014.00316
发表时间: 2014
期刊: Frontiers in plant science
影响因子: 5.6
作者: [Yu QB, Huang C, Yang ZN]
通讯作者: Yang ZN
Roles of the nuclear-encoded chloroplast SMR domain-containing PPR protein SVR7 in photosynthesis and oxidative stress tolerance in Arabidopsis
核编码叶绿体 SMR 结构域 PPR 蛋白 SVR7 在拟南芥光合作用和氧化应激耐受性中的作用
DOI: 10.1007/s12374-014-0041-1
发表时间: 2014-10-01
期刊: JOURNAL OF PLANT BIOLOGY
影响因子: 2.9
作者: [Lv, He-Xin, Huang, Chao, Yang, Zhong-Nan]
通讯作者: Yang, Zhong-Nan
Porphobilinogen deaminase HEMC interacts with the PPR-protein AtECB2 for chloroplast RNA editing
胆色素原脱氨酶 HEMC 与 PPR 蛋白 AtECB2 相互作用进行叶绿体 RNA 编辑
DOI: 10.1111/tpj.13672
发表时间: 2017-11-01
期刊: PLANT JOURNAL
影响因子: 7.2
作者: [Huang, Chao, Yu, Qing-Bo, Yang, Zhong-Nan]
通讯作者: Yang, Zhong-Nan
温度调控花粉壁发育的机理
  • 批准号:
    31930009
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    302.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    杨仲南
  • 依托单位:
花粉表面蛋白在花粉发育、花粉与柱头识别中的作用
  • 批准号:
    31870296
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    杨仲南
  • 依托单位:
花药中层细胞发育及调控
  • 批准号:
    31670314
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    杨仲南
  • 依托单位:
转录因子TDF1结合位点分析及直接调控下游基因鉴定
  • 批准号:
    30770206
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    30.0万元
  • 批准年份:
    2007
  • 负责人:
    杨仲南
  • 依托单位:
国内基金
海外基金