基于比较蛋白质组研究策略的食管癌血清蛋白标志物识别及其功能分析
结题报告
批准号:
81072259
项目类别:
面上项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
尹立红
依托单位:
学科分类:
H3001.环境卫生
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
潘恩春、尤振兵、郭伟、王仪、刘宏德、李晓波、张娟、苏耀耀
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中文摘要
本研究通过构建基于凝胶的亚细胞蛋白质组2-DE-MALDI-TOF-MS和基于质谱的SELDI-TOF-MS蛋白芯片两种定量蛋白质组学分析策略,系统分析了细胞和血清中的食管癌相关差异表达蛋白质,初步筛选可用于早期发现食管癌的血清标志物,建立食管癌的血清标志物分类树模型。生物信息学预测差异蛋白的结构,识别具有分泌蛋白特征的候选蛋白进行蛋白功能及其信号通路调控网络的分析。构建候选蛋白的表达载体和siRNA沉默细胞模型,探讨候选蛋白对食管癌细胞的增殖、侵袭和迁移等行为、代谢和信号通路等的影响,结合质谱和免疫分析技术,识别候选蛋白在细胞信号通路的异常翻译后修饰特征,明确候选蛋白在食管癌发病机制中的作用,构建食管癌血清蛋白标志物的指标体系。通过对食管癌高危人群的筛检试验,评价筛检体系的诊断价值,为食管癌高危险人群的识别提供可靠的理论依据和有效的技术手段。
英文摘要
本研究采用8标的iTRAQ分析技术分别对28对食管鳞状细胞癌患者血浆和健康对照者血浆进行差异表达蛋白质组学的LC-MS/MS分析,共筛选得到19个差异蛋白质,其中15个在食管鳞状细胞癌组中低表达,4个在食管鳞状细胞癌组中高表达。GO分析显示,这些蛋白参与了免疫功能、代谢过程、细胞粘附、细胞凋亡等过程的调控。Western blot结果证实,在30对食管鳞状细胞癌患者血浆和健康对照者血浆的验证样本中,ECM-1在病例组和对照组中的蛋白水平差异有统计学意义,提示其可作为食管癌早期诊断的血浆蛋白候选标志。为进一步探讨食管癌的代谢特征在血浆中的表现及其与相关蛋白质的关系,本研究同时采用UPLC-MS技术分析了食管癌的血浆代谢组特征,共筛选得到ESCC组与健康对照组差异表达的小分子代谢物46 个,其中13 个上调,33个下调。利用METLIN对差异表达的差异特征物质以精确质量数进行检索,显示多种代谢分子与磷脂代谢密切相关,提示这一代谢过程在食管癌发生发展中可能发挥了较大的作用。研究还应用双向电泳技术探讨了前期筛选的食管癌相关蛋白MGMT在食管癌发病机制的可能作用,结合质谱技术识分离鉴定了14个与细胞恶性表型相关的差异蛋白。研究发表标注论文12篇,其中SCI收录8篇,会议论文6篇,培养博士研究生2名,硕士研究生2名。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Differential expression profiles of microRNAs as potential biomarkers for the early diagnosis of esophageal squamous cell carcinoma
microRNA的差异表达谱作为食管鳞状细胞癌早期诊断的潜在生物标志物
DOI:10.3892/or.2012.2105
发表时间:2013-01-01
期刊:ONCOLOGY REPORTS
影响因子:4.2
作者:Yang, Miao;Liu, Ran;Yin, Lihong
通讯作者:Yin, Lihong
CIRCULATING miR-155 EXPRESSION IN PLASMA: A POTENTIAL BIOMARKER FOR EARLY DIAGNOSIS OF ESOPHAGEAL CANCER IN HUMANS
血浆中循环 miR-155 表达:人类食管癌早期诊断的潜在生物标志物
DOI:10.1080/15287394.2012.699856
发表时间:2012-01-01
期刊:JOURNAL OF TOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL HEALTH-PART A-CURRENT ISSUES
影响因子:2.6
作者:Liu, Ran;Liao, Juan;Yin, Lihong
通讯作者:Yin, Lihong
Tumor-Suppressive Function of miR-139-5p in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
miR-139-5p 在食管鳞状细胞癌中的抑癌功能
DOI:10.1371/journal.pone.0077068
发表时间:2013-10-18
期刊:PLOS ONE
影响因子:3.7
作者:Liu, Ran;Yang, Miao;Kim, Sun Jung
通讯作者:Kim, Sun Jung
DOI:--
发表时间:--
期刊:中国科技论文在线
影响因子:--
作者:刘冉;潘恩春;王仪;尹立红;盛静逸;杨淼;浦跃朴;卢婷;郭伟;廖娟
通讯作者:廖娟
Malignant Progression in O6-Methylguanine-DNA Methyltransferase-Deficient Esophageal Cancer Cells Is Associated with Ezrin Protein
O6-甲基鸟嘌呤-DNA 甲基转移酶缺陷型食管癌细胞的恶性进展与 Ezrin 蛋白相关
DOI:--
发表时间:--
期刊:DNA and Cell Biology
影响因子:3.1
作者:Ran Liu;Yi Wang;Geyu Liang;Enchun Pan;Lihong Yin;Hui Liu;Yuepu Pu;JingYi Sheng;Wei Guo;Juan Zhang;Yaoyao Su;Derong Tang
通讯作者:Derong Tang
铜暴露通过CBP/CREB/FDX1诱导海马神经元铜死亡的表观调控机制与作用研究
  • 批准号:
    82373541
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    49万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    尹立红
  • 依托单位:
基于定量蛋白组学研究CREB转录因子在铜致小鼠认知障碍中的作用机制
  • 批准号:
    82073516
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    尹立红
  • 依托单位:
基于多组学的毒作用模式对亚硝胺暴露致食管癌风险研究
  • 批准号:
    81872588
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    尹立红
  • 依托单位:
miR-218相关信号通路调控HPV协同亚硝胺诱导人食管上皮细胞恶性转化作用研究
  • 批准号:
    81573191
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万元
  • 批准年份:
    2015
  • 负责人:
    尹立红
  • 依托单位:
秀丽隐杆线虫生殖毒理学替代模型研究
  • 批准号:
    81273123
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    尹立红
  • 依托单位:
食管癌相关差异表达基因的识别与调控机制
  • 批准号:
    30671732
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    28.0万元
  • 批准年份:
    2006
  • 负责人:
    尹立红
  • 依托单位:
食管癌高危险人群筛检基因与技术研究
  • 批准号:
    30571540
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    8.0万元
  • 批准年份:
    2005
  • 负责人:
    尹立红
  • 依托单位:
遗传易感性与环境暴露因素对肺癌发生交互作用的研究
  • 批准号:
    30170791
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    18.0万元
  • 批准年份:
    2001
  • 负责人:
    尹立红
  • 依托单位:
国内基金
海外基金