大豆疫霉菌新型效应蛋白的转录调控研究
批准号:
30900932
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
22.0 万元
负责人:
董莎萌
依托单位:
学科分类:
植物病理学
结题年份:
2012
批准年份:
2009
项目状态:
已结题
项目参与者:
王源超、赵伟、于丹、崔林开、王晓莉、盛玉婷、杨新宇
中文摘要
本项目拟开展大豆疫霉菌侵染过程中新型致病因子-RXLR效应蛋白的转录调控研究。申请者首先基于已有的基因芯片数据和大豆疫霉菌全基因组数据,采用生物信息学手段筛选可能调控RXLR效应蛋白的转录因子,进而采用已成熟的RNA干涉技术逐一在大豆疫霉菌中沉默候选基因,找到目标基因。然后利用酵母单杂交、凝胶阻滞电泳等技术对转录因子与转录元件的结合进行确认;对转录因子的细胞定位进行检测;并对转录元件的核心DNA序列和转录因子的保守氨基酸位点进行突变,在分子水平上阐明RXLR蛋白的转录调控过程。最后,利用基因芯片技术检测受转录因子的靶基因,并将之与转录元件在基因组中分布进行分析,在基因组水平上解释转录因子与靶基因之间的调控网络模型;从而阐明大豆疫霉菌侵染过程中这类新型致病因子的转录调控机理。
英文摘要
利用高通量技术筛选到大豆疫霉菌重要的RxLR效应因子及其调控蛋白,明确他们的生物学功能是本项目的研究重点。课题组首先将全基因组基因预测与基因芯片以及全转录组测序两种高通量技术结合,筛选分析了457个RxLR效应蛋白以及292个转录因子的转录模式。其次,课题组明确报道了两个RxLR基因的生物学功能,确定其中一个为无毒基因Avr5,另外一个为无毒基因Avr3b。 特别是利用遗传学和生物化学等技术手段明确了Avr3b编码一个具有Nudix水解酶活性转运蛋白,首次发现疫霉菌通过分泌转运Nudix水解酶促进侵染的这一新型致病机理。最后,本课题组筛选到5个转录因子与RxLR效应因子的转录模式密切相关,通过瞬时和稳定基因沉默确定其中1个Myb转录因子MYB1受到激酶PsSAK1的调节,MYB1的沉默显著降低疫霉菌致病性并干扰RxLR效应因子的转录调控。本研究对在基因组水平上解释转录因子与靶基因之间的调控网络模型,阐明大豆疫霉菌侵染过程中新型致病因子的转录调控机理具有理论意义。
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Sequence variants of the Phytophthora sojae RXLR effector Avr3a/5 are differentially recognized by Rps3a and Rps5 in soybean.
大豆疫霉 RXLR 效应子 Avr3a/5 的序列变异体被 Rps3a 和 Rps5 差异识别
DOI:
10.1371/journal.pone.0020172
发表时间:
2011
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Dong S, Yu D, Cui L, Qutob D, Tedman-Jones J, Kale SD, Tyler BM, Wang Y, Gijzen M]
通讯作者:
Gijzen M
Phytophthora sojae avirulence effector Avr3b is a secreted NADH and ADP-ribose pyrophosphorylase that modulates plant immunity.
大豆疫霉无毒效应子 Avr3b 是一种分泌型 NADH 和 ADP-核糖焦磷酸化酶,可调节植物免疫
DOI:
10.1371/journal.ppat.1002353
发表时间:
2011-11
期刊:
PLoS pathogens
影响因子:
6.7
作者:
[Dong S, Yin W, Kong G, Yang X, Qutob D, Chen Q, Kale SD, Sui Y, Zhang Z, Dou D, Zheng X, Gijzen M, Tyler BM, Wang Y]
通讯作者:
Wang Y
A Myb transcription factor of Phytophthora sojae, regulated by MAP kinase PsSAK1, is required for zoospore development.
大豆疫霉的 Myb 转录因子受 MAP 激酶 PsSAK1 调节,是游动孢子发育所必需的
DOI:
10.1371/journal.pone.0040246
发表时间:
2012
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Zhang M, Lu J, Tao K, Ye W, Li A, Liu X, Kong L, Dong S, Zheng X, Wang Y]
通讯作者:
Wang Y
依赖mRNA剪切调控的马铃薯晚疫病持久抗性激活机制
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批准号:--
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项目类别:--
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资助金额:293万元
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批准年份:2021
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负责人:董莎萌
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依托单位:
致病疫霉寄主专化性的转录组变异机制
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批准号:32111530120
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项目类别:国际(地区)合作与交流项目
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资助金额:9.9万元
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批准年份:2021
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负责人:董莎萌
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依托单位:
致病疫霉寄主专化性的转录组变异机制
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批准号:--
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项目类别:国际(地区)合作与交流项目
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资助金额:--
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批准年份:2020
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负责人:董莎萌
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依托单位:
马铃薯广谱抗病基因Rpi-vnt1识别致病疫霉的分子机制
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批准号:31972252
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项目类别:面上项目
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资助金额:57.0万元
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批准年份:2019
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负责人:董莎萌
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依托单位:
疫霉菌新型效应蛋白SCR2调节植物免疫反应的作用机制研究
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批准号:31772144
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项目类别:面上项目
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资助金额:60.0万元
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批准年份:2017
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负责人:董莎萌
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依托单位:
国内基金
海外基金