凡纳滨对虾重组激活基因RAGs的结构与功能研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41776158
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Recombination-activating genes (RAGs) mediated V(D)J recombination provides an essential material foundation for the specific recognition to pathogens and immunological memory of their adaptive immune system in vertebrates. The origin and evolution of RAGs have been always a hot research topic for adaptive immunity. Along with the identification of RAGs homologues in animals at lower evolutionary position (such as cephalochordate and insects), more and more evidence support the hypothesis that RAGs originate from a transposable element. However, some key issues including the function of RAGs in invertebrate and the origin of RAG2 are still not clear. In our previous study, we identified the RAGs-like genes in the transcriptome of Litopenaeus vannamei (LvRAG1-like and LvRAG2-like). They shared high sequence similarity with RAGs homologues in lancelet and showed co-expression pattern which is similar to that of RAGs in vertebrates. The present study will reveal the gene structure of LvRAGs-like. The active characteristics of LvRAG1-like and LvRAG2-like protein will be clarified, and their biological functions in shrimp will be studied. The data will not only provide new evidence for the origin and evolution of RAGs, but also enrich our knowledge on the immune system in invertebrates.
脊椎动物重组激活基因RAGs介导的V(D)J基因重排为其适应性免疫系统对病原的特异性识别和免疫记忆提供了重要物质基础。RAGs的起源和进化一直是适应性免疫研究的热点。随着RAGs同源基因在进化地位更低等动物(头索动物和昆虫)中被发现,RAGs基因起源于转座子的假说得到更多证据的支持。然而,RAGs在无脊椎动物中的功能以及RAG2如何起源等关键问题仍不清楚。近期我们在对虾转录组中发现RAGs类似基因LvRAG1-like和LvRAG2-like,它们与头索动物文昌鱼的RAGs具有较高序列相似性且与脊椎动物RAGs具有类似的协同表达特征。本项目拟解析对虾RAG类似基因(LvRAGs-like)的结构特征及LvRAG1-like和LvRAG2-like蛋白的活性特点,探讨它们的生物学功能,以期为脊椎动物RAGs的起源与进化提供新的证据,同时也将丰富无脊椎动物免疫的基础理论。

结项摘要

脊椎动物重组激活基因RAGs介导的V(D)J基因重排为其适应性免疫系统对病原的特异性识别和免疫记忆提供了重要物质基础。RAGs的起源和进化一直是适应性免疫研究的热点。随着RAGs同源基因在进化地位更低等动物(头索动物和昆虫)中被发现,RAGs基因起源于转座子的假说得到更多证据的支持。然而,RAGs在无脊椎动物中的功能以及RAG2如何起源等关键问题仍不清楚。本项目基于在对虾转录组中发现的与文昌鱼RAGs具有较高序列相似性的基因LvRAG1-like和LvRAG2-like,分析了对虾RAGs类似基因的结构和表达特征,并探讨了它们可能的生物学功能;同时,研究了对虾不同类型血细胞的组成及功能,并分析了其应对病原感染的免疫响应,以期为研究RAGs在对虾血细胞中的功能奠定基础。研究结果发现,LvRAG1-like和LvRAG2-like在对虾基因组中都是只存在一个拷贝,且二者在基因组中并不相邻,但二者均存在选择性剪切现象,可产生不同形式的成熟蛋白,这些特征与文昌鱼中RAGs转座子的基因特征完全不同;LvRAG1-like和LvRAG2-like呈现相同的组织表达模式,与脊椎动物RAGs的组织协同表达特征类似;LvRAG1-like具有核定位信号,主要在细胞核中表达,少量在细胞质中表达,与文昌鱼RAG1的亚细胞定位一致;LvRAGs-like主要在卵巢中表达,且与对虾“免疫致敏”现象存在一定的关联,推测它们可能发挥重组酶活性,发挥多种生物学功能;获得了昆虫表达的LvRAGs-like蛋白,为后续开展蛋白水平的研究奠定了基础。明确了不同类型对虾血细胞的免疫学功能,发现对虾血细胞介导神经内分泌免疫参与病毒感染过程。研究结果初步探明了对虾RAG类似基因的结构特征及生物学功能,为RAGs的起源与进化提供了新的证据,同时也丰富了无脊椎动物免疫的基础理论。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(1)
科研奖励数量(2)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Transcriptome analysis reveals the activation of neuroendocrine-immune system in shrimp hemocytes at the early stage of WSSV infection
转录组分析揭示了 WSSV 感染早期虾血细胞神经内分泌免疫系统的激活
  • DOI:
    10.1186/s12864-019-5614-4
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    BMC Genomics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Wang Fuxuan;Li Shihao;Xiang Jianhai;Li Fuhua
  • 通讯作者:
    Li Fuhua
Characterization of a Lymphoid Organ Specific Anti-lipopolysaccharide Factor From Shrimp Reveals Structure-Activity Relationship of the LPS-Binding Domain
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  • DOI:
    10.3389/fimmu.2019.00872
  • 发表时间:
    2019-04-24
  • 期刊:
    FRONTIERS IN IMMUNOLOGY
  • 影响因子:
    7.3
  • 作者:
    Li, Shihao;Lv, Xinjia;Xiang, Jianhai
  • 通讯作者:
    Xiang, Jianhai
An E3 ubiquitin ligase TRIM9 is involved in WSSV infection via interaction with beta-TrCP
E3 泛素连接酶 TRIM9 通过与 β-TrCP 相互作用参与 WSSV 感染
  • DOI:
    10.1016/j.dci.2019.03.014
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Developmental and Comparative Immunology
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Sun Mingzhe;Li Shihao;Yu Kuijie;Xiang Jianhai;Li Fuhua
  • 通讯作者:
    Li Fuhua
The immune function of a NLR like gene, LvNLRPL1, in the Pacific whiteleg shrimp Litopenaeus vannamei
南美白对虾 NLR 样基因 LvNLRPL1 的免疫功能
  • DOI:
    10.1016/j.dci.2021.104311
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Developmental and Comparative Immunology
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Xuechun Li;Shihao Li;Yang Yu;Xiaojun Zhang;Jianhai Xiang;Fuhua Li
  • 通讯作者:
    Fuhua Li
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选择性剪接的全基因组分析为了解太平洋白虾凡纳滨对虾的应激反应提供了见解
  • DOI:
    10.3389/fgene.2019.00845
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Frontiers in Genetics
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Zhang Xiaoxi;Yuan Jianbo;Zhang Xiaojun;Liu Chengzhang;Xiang Jianhai;Li Fuhua
  • 通讯作者:
    Li Fuhua

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  • 通讯作者:
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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