OxyS非编码RNA对秀丽线虫che-2基因表达与行为的调控
批准号:
31071132
项目类别:
面上项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
单革
依托单位:
学科分类:
基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
葛茜、刘辉杰、吴靓、牟苏嫣、夏赟、王晶晶
中文摘要
秀丽线虫(C. elegans)是一种独特的可用于研究非编码RNA的模式生物。目前还未有外源非编码RNA调控秀丽线虫基因表达及行为的报导。我们的初步实验显示,氧化胁迫下的大肠杆菌高量表达的一个非编码RNA- - OxyS RNA会调控秀丽线虫化学感受神经元中che-2基因的表达,并影响秀丽线虫的行为。在一些逆境胁迫下,大肠杆菌会高量表达类似OxyS RNA的一类非编码RNA。本项目将研究OxyS RNA及其它可能的这类大肠杆菌非编码RNA对取食细菌的秀丽线虫基因表达和行为的调控以及调控的分子机理。本项目的研究将提供细菌自身非编码RNA对取食细菌的动物进行基因表达和行为调控的实例,并加深我们对环境(包括食物)与动物基因表达及行为相互关系的认识。
英文摘要
在此基金的资助下,我们课题组发表了Nature Communications, The International Journal of Biochemistry & Cell Biology, Plos One, Chinese Science Bulletin (两篇), Journal of Genetics & Genomics 等数篇文章, 项目负责人单革均为这些论文的通讯作者。其中主要研究成果发表在Nature Communications (2012)。文章发表之后,Nature reviews Genetics 以Bacterial ncRNAs alter gene expression in worms为题做出点评; Nature reviews Microbiology也以 Non-coding RNAs make E. coli unpalatable为题做出点评。目前文章已被引用15次。. 食物和其它一些环境因子会影响动物行为及基因表达。细菌性食物中的差异会影响秀丽线虫的行为和寿命。但是在我们的工作之前,没有关于细菌是否可以利用自身产生的非编码RNA调控秀丽线虫的生理。我们发现两个大肠杆菌中的非编码RNA,OxyS和DsrA影响秀丽线虫的生理。OxyS下调che-2,从而抑制秀丽线虫化学感受;DsrA通过下调甘油双酰酯脂肪酶基因F42G9.6,从而缩短秀丽线虫寿命。我们也检测了秀丽线虫RNA干扰通路基因在OxyS 和DsrA调控中的作用。别的细菌,如枯草芽孢杆菌也可能利用其非编码RNA调控秀丽线虫基因表达。我们的研究表明大肠杆菌可以利用自身产生的非编码RNA调控秀丽线虫的生理状态,并且非编码RNA可以具有物种间的生态作用。. 我们描述了非编码RNA介导的细菌/细菌摄食者相互影响的一种潜在新模式。我们的研究还提供了种间基因调控以及外源性ncRNAs对秀丽线虫的生理调节,也是天然长非编码RNA物种间调控的第一个范例。非编码RNA可以具有物种间的调控作用,暗示非编码RNA可能参与了物种之间相互关系形成的进化过程。此研究对进一步认识非编码RNA的功能及功能机理具有一定的启示意义。
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Chinese worm community made delightful wiggles in Hefei September 6 to September 8, 2013.
2013年9月6日至9月8日,中国蠕虫社区在合肥度过了愉快的时光。
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
Science China Life Sciences
影响因子:
--
作者:
[Shan G, Shan G, Guang S, Guang S]
通讯作者:
Guang S
The targeting and functions of miRNA-383 are mediated by FMRP during spermatogenesis.
精子发生过程中 miRNA-383 的靶向和功能由 FMRP 介导
DOI:
10.1038/cddis.2013.138
发表时间:
2013-05-02
期刊:
Cell death & disease
影响因子:
9
作者:
[]
通讯作者:
Genome-Wide Identification of SNPs in MicroRNA Genes and the SNP Effects on MicroRNA Target Binding and Biogenesis
microRNA 基因中 SNP 的全基因组鉴定以及 SNP 对 microRNA 靶标结合和生物发生的影响
DOI:
10.1002/humu.21641
发表时间:
2012-01-01
期刊:
HUMAN MUTATION
影响因子:
3.9
作者:
[Gong, Jing, Tong, Yin, Guo, An-Yuan]
通讯作者:
Guo, An-Yuan
Signals from noncoding RNAs: Unconventional roles for conventional pol III transcripts
来自非编码 RNA 的信号:传统 pol III 转录物的非常规作用
DOI:
10.1016/j.biocel.2012.07.013
发表时间:
2012-11-01
期刊:
INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOCHEMISTRY & CELL BIOLOGY
影响因子:
4
作者:
[Hu, Shanshan, Wu, Jing, Shan, Ge]
通讯作者:
Shan, Ge
Robustness and Backbone Motif Structure of a Cancer Network Regulated by miR-17-92 Cluster during the G1/S Transition
G1/S 转变期间 miR-17-92 簇调控的癌症网络的稳健性和主干基序结构
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
PLos One
影响因子:
3.7
作者:
[Ge Shan, Ge Shan, Ya Jia, Ya Jia]
通讯作者:
Ya Jia
共 9 条
对动物保守环RNAs生理功能及功能机理的研究
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批准号:31930019
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项目类别:重点项目
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资助金额:297.0万元
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批准年份:2019
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负责人:单革
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依托单位:
特殊小RNA和lncRNA对干细胞染色体分离及染色质表观遗传状态的调控
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批准号:91519333
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项目类别:重大研究计划
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资助金额:67.0万元
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批准年份:2015
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负责人:单革
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依托单位:
秀丽线虫环境RNA干扰功能及功能机理研究
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批准号:31471225
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项目类别:面上项目
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资助金额:90.0万元
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批准年份:2014
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负责人:单革
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依托单位:
利用小鼠疾病模型研究DNA甲基化及非编码RNA在情感与记忆分子机制中的作用
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批准号:91232702
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项目类别:重大研究计划
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资助金额:70.0万元
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批准年份:2012
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负责人:单革
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依托单位:
成年神经干细胞中脆性X综合症致病蛋白通过microRNA通路对WNT信号转导通路的调控
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批准号:81171074
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项目类别:面上项目
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资助金额:60.0万元
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批准年份:2011
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负责人:单革
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依托单位:
国内基金
海外基金