甲胎蛋白（alpha-fetoprotein, AFP）是肝细胞肝癌（hepatocellular carcinoma, HCC）的重要肿瘤标志物，广泛用于HCC的早期筛查和辅助诊断。但长期以来，大约20-30%的HCC患者AFP水平并不升高，导致诊断敏感性下降。关于AFP在HCC中作用的分子机理尚不清楚。本研究通过分析AFP（＋）和AFP（－）的HCC亚细胞蛋白质组的差异表达谱，分别鉴定AFP（＋）和AFP（－）的HCC的关键蛋白；分析AFP（＋）和AFP（－）的HCC亚细胞蛋白裂解物中AFP特异结合蛋白和相互作用蛋白谱，了解AFP蛋白复合体及其相关信号网络在HCC发生发展中作用的分子机理。制备针对AFP相关关键蛋白的基因工程抗体，通过大样本血清学和组织芯片上的验证，寻找能与AFP互补或联合使用的新的肝癌标志物，提高HCC，特别是AFP阴性的HCC临床诊断的准确性。