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调控TLRs信号通路候选miRNAs靶基因3'UTR内SNPs对口腔鳞状细胞癌发病的影响及其后续功能分析

批准号:
81001208
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
20.0 万元
负责人:
廖玍
依托单位:
学科分类:
肿瘤学
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
陈国弟、李一、周瑜、刘博、梁伟波、黄进、张菁、魏丹凤、金淑慧

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要
最新研究表明 ,miRNA靶基因3'UTR内存在着单核苷酸多态性(SNPs)可以影响miRNA对靶基因表达的调控作用,并提示此机制可能与肿瘤的发生发展与转移有关。本课题拟运用生物信息学筛选调控TLRs信号通路候选miRNAs,定制特异性TLRs信号通路相关miRNAs 芯片,利用miRNAs芯片建立OSCC与非OSCC人群的miRNAs表达谱,筛查差异性miRNAs,运用生物信息学技术筛选差异性miRNAs靶基因3′UTRs 内SNPs, HRM技术分型检测SNPs与OSCC之间的易感性,利用分子生物学技术研究差异SNPs对miRNAs表达影响,进一步阐述SNPs与OSCC发生发展之间的分子机制。
英文摘要
口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma, OSCC)是常见的人类恶性肿瘤之一,其五年生存率只有大约50%。已有多条细胞信号通路被认为与OSCC相关联,其中,Toll样受体通路相关的一系列蛋白已被证实与OSCC的发生发展密切相关。然而到目前为止,Toll样受体通路相关基因其多态性的存在对OSCC易感性的影响仍不明确。关于基因多态性和疾病易感性相关性的研究,目前主要集中在探讨基因编码区的SNPs位点对疾病易感性的影响。对于基因非编码区的SNPs位点与疾病易感性关系的研究仍非常有限,机制至今不明。.在本研究中,我们综合运用多种生物信息学方法,来筛选与OSCC相关的Toll样受体通路基因的microRNA靶点区上的单核苷酸多态性位点(SNPs)。通过该方法,我们初步纳入了90个OSCC相关的Toll样受体通路基因上的相关SNP位点,最终筛选出16个候选SNP位点进行后续分析。在对这16个候选SNP位点进行人群队列研究后,发现了位于TRAF6基因3’UTR区的SNP位点rs5030486,与OSCC易感性有显著性关联。研究结果显示,rs5030486位点的AG基因型有可能降低OSCC的发病风险,同时,该基因型有可能降低OSCC的复发风险。此外,我们检测了24例OSCC患者外周血单核细胞中TRAF6的mRNA表达水平,结果显示,携带rs5030486位点不同基因型的OSCC患者其外周血中的TRAF6表达量有显著性差异,这提示我们该SNP位点可能通过改变mRNA表达水平来影响OSCC的易感性。.综上,本研究通过先进的生物信息学筛查手段,及随后的人群队列研究,发现了位于TRAF6基因microRNA靶点区上的SNP位点rs5030486与OSCC的发生发展可能存在相关性。这一结果有助于进一步阐明非编码区SNP位点影响疾病易感性的潜在机制,同时提示我们,该SNP位点可作为OSCC诊断和预后判断的新的候选分子靶标。此外,我们也对研究疾病相关基因的microRNA靶点区SNP的筛选提供了一种新的生物信息学探索模式。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
The -308G/A polymorphism of the tumor necrosis factor-alpha gene is associated with the risk of upper aerodigestive tract cancer: a meta-analysis.
肿瘤坏死因子-α 基因的 -308G/A 多态性与上呼吸消化道癌症的风险相关:一项荟萃分析。
DOI: 10.1620/tjem.229.245
发表时间: 2013
期刊: The Tohoku journal of experimental medicine
影响因子: --
作者: [Jiayi Wang, Xin Jin, Hui Wang, Jiantang Yang, Li, Lei Lei, Xiaoxu Li, Yu Zhou, X. Zeng, Lu Jiang, Ga Liao, H. Dan, Qianming Chen]
通讯作者: Qianming Chen
Host genetic susceptibility to oral cancer: evidence from meta-analyses and pooled analyses.
宿主对口腔癌的遗传易感性:荟萃分析和汇总分析的证据。
DOI: 10.1111/odi.12184
发表时间: 2014-10
期刊: Oral Diseases
影响因子: 3.8
作者: [Liao, Ga, Wang, Yun, Zhou, Yuqiao, Li, Taiwen, Zeng, Dequan, Li, Jing, Dan, Hongxia, Chen, Qianming]
通讯作者: Chen, Qianming
口腔微生物组-宿主共代谢调控黏膜免疫微环境机制研究
  • 批准号:
    32071462
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    廖玍
  • 依托单位:
口腔微生物组-宿主共代谢调控黏膜免疫微环境机制研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    --
  • 资助金额:
    58万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    廖玍
  • 依托单位:
多组学联合研究口腔鳞状细胞癌发病机制及分子标记物联合检验潜能
  • 批准号:
    81772275
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    56.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    廖玍
  • 依托单位:
口腔扁平苔藓遗传-环境因素交互作用及协同致病机理研究
  • 批准号:
    81470746
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    73.0万元
  • 批准年份:
    2014
  • 负责人:
    廖玍
  • 依托单位:
国内基金
海外基金