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基于全基因组、转录组和甲基化测序的瘢痕疙瘩易感基因探索研究
结题报告
批准号:
81671921
项目类别:
面上项目
资助金额:
52.0 万元
负责人:
刘伟
依托单位:
学科分类:
H1703.创面愈合与瘢痕
结题年份:
2020
批准年份:
2016
项目状态:
已结题
项目参与者:
金刚、夏玲玲、孙培、高振、康文锋、王文波、黄佳、程磊
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中文摘要
瘢痕疙瘩具有高度增长、侵袭、抵抗放化疗和高复发率等肿瘤特点,其“瘢痕体质”特征包括遗传倾向、基因突变、生长因子、细胞和炎症因子过度表达及内分泌激素异常等,且不同患者间的临床症状和预后存在巨大差异。以往瘢痕疙瘩研究多以“碎片化”和“盲人模象”模式进行。我们假设采用全基因组、转录组和表观遗传测序加上高通量蛋白芯片等技术,对最典型的临床病例的血样和组织标本开展宏观和多层次立体筛查,有望获得瘢痕疙瘩患者共有的易感基因和血清蛋白标志物以及不同以及个体间差异基因,作为瘢痕疙瘩患者诊断和预后判断和个体化治疗的基础。利用本单位的临床资源优势与国内顶级超高通量基因测序研究机构开展合作,以期将筛选出的基因和蛋白标志物制备成瘢痕疙瘩特异的诊断芯片,用于后续的大规模筛查和验证。同时,也将采用基因编辑手段来验证易感基因的功能。基于测序所发现的个体化差异,将初步开展体外细胞培养模型的个性化药物靶向治疗实验研究。
英文摘要
Keloid is a disease difficult to heal due to its tumor-like characters including rapid growth and invasion to normal skin and resistance to therapy with high recurrence rate. Keloid patients are also characterized by their specific diathesis including genetic predisposition and familial aggregation, gene mutation, abnormal production of growth factor, cytokine and inflammatory factors as well as abnormal hormonal levels. In addition, significant individual variation was also observed among different patients. In the past, keloid research was conducted within limited scope due to the shortcomings of available technology. In this study, we hypothesized that keloid genetic and protein markers are likely to defined by the application of whole-genome sequencing, transcriptome and epigenic sequencing to the best tissue samples of clinical cases, and these defined markers are likely to be manufactured as a special chip for keloid diagnosis and prognosis prediction. Meanwhile, the functions of defined genetic markers will also be verified with gene-editing technology. Furthermore, based on the individual variation of defined gene targets, individualized targeted drug therapy will also be experimented via available cancer target therapy drugs in an in vitro cell experimental model.
瘢痕疙瘩是一种浸润性生长、复发率高的肿瘤样疾病。常染色体显性遗传可能是其致病机制之一。然而,GWAS未能发现外显子区域的功能变异,而在非编码区发现了单核苷酸多态性,提示有必要进行创新性的遗传学研究。本研究采用GWAS、RNA-Sequence和Hi-C分析方法,以配对瘢痕疙瘩和正常皮肤为研究对象,对瘢痕疙瘩的遗传机制进行了剖析。利用RNA测序挖掘出的差异表达基因、miRNAs和lncRNAs构建网络。在此基础上,富集和验证了瘢痕疙瘩发病机制中的6条重要信号通路。此外,通过Hi-C数据定位了敏感位点上的拓扑相关结构域,并鉴定了6个差异表达的RNA。通过过表达和基因敲除实验证实它们在细胞周期和凋亡中的作用。本研究首次利用RNA序列和已报道的位点变异揭示了关键的生物标志物和信号通路,为揭示瘢痕疙瘩和其他通过GWAS未能成功找寻发病机制的疾病机制研究提供了一种可行的途径。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:--
发表时间:2018
期刊:中国美容整形外科杂志
影响因子:--
作者:刘海洋;董佳容;武晓莉;高振;夏玲玲;曹振东;刘伟
通讯作者:刘伟
Psychological stress enhances keloid development via stress hormone-induced abnormal cytokine profiles and inflammatory responses
心理压力通过应激激素诱导的异常细胞因子谱和炎症反应促进瘢痕疙瘩的发展
DOI:10.20517/2347-9264.2020.24
发表时间:2020
期刊:Plastic and Aesthetic Research
影响因子:--
作者:Yating Yang;Xiaoli Wu;Wei Liu
通讯作者:Wei Liu
Nintedanib inhibits keloid fibroblast functions by blocking the phosphorylation of multiple kinases and enhancing receptor internalization.
尼达尼布通过阻断多种激酶的磷酸化并增强受体内化来抑制瘢痕疙瘩成纤维细胞功能
DOI:10.1038/s41401-020-0381-y
发表时间:2020-09
期刊:Acta pharmacologica Sinica
影响因子:8.2
作者:Zhou BY;Wang WB;Wu XL;Zhang WJ;Zhou GD;Gao Z;Liu W
通讯作者:Liu W
Glycolysis in Keloids and Hypothesis on its Metabolic Heterogeneity
疤痕疙瘩中的糖酵解及其代谢异质性假设
DOI:--
发表时间:2020
期刊:Adv Plast Reconstr Surg
影响因子:--
作者:Yang YT;Gao Z;Liu W
通讯作者:Liu W
DOI:--
发表时间:2018
期刊:中国美容整形外科杂志
影响因子:--
作者:中国整形美容协会瘢痕医学分会常务委员会专家组
通讯作者:中国整形美容协会瘢痕医学分会常务委员会专家组
掺锂微孔化的3D全多孔聚醚醚酮通过调控巨噬细胞免疫微环境促进骨缺损修复的机制研究
  • 批准号:
    82102539
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    30万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
基于miR-21/mTOR/HIF1α信号轴研究丹灯纳米合剂通过活血化瘀双重作用防治口腔黏膜癌变的机制
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    55万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
模拟肌腱发育时空调控机制促进组织工程肌腱胶原合成与重塑
  • 批准号:
    31870967
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
PCOS患者卵泡液脂质谱改变对卵巢功能和辅助生殖结局的影响及机制的研究
  • 批准号:
    81671518
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
HMGB1-RAGE激活STAT3信号通路从而抑制小胶质细胞(MG)免疫活性的机制研究
  • 批准号:
    81502140
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    18.0万元
  • 批准年份:
    2015
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
肌腱细胞外基质和拓扑结构诱导人脂肪干细胞成肌腱分化的实验研究
  • 批准号:
    31470943
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    90.0万元
  • 批准年份:
    2014
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
环境内分泌干扰物AGEs在多囊卵巢综合征发病机制中的研究
  • 批准号:
    81471424
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    67.0万元
  • 批准年份:
    2014
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
口腔黏膜白斑癌变lncRNA表达谱的构建及其对PDPN过表达的调控
  • 批准号:
    81302358
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万元
  • 批准年份:
    2013
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
硫酸脱氢表雄酮对脂肪功能的影响及其在多囊卵巢综合征发病中的作用
  • 批准号:
    81270875
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
模拟肌腱细胞形态和力学微环境诱导ASC成肌腱分化及机制探讨
  • 批准号:
    31170937
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    刘伟
  • 依托单位:
国内基金
海外基金