中胚层主导性microRNA基因簇的鉴定及其“表型弹性”的分子机制探索

批准号:
91440111
项目类别:
重大研究计划
资助金额:
80.0 万元
负责人:
余佳
依托单位:
学科分类:
C0601.遗传物质结构与功能
结题年份:
2017
批准年份:
2014
项目状态:
已结题
项目参与者:
苏瑞、刘光、赵华路、温馨、翟頔、王耕超、刘思琪、王雪
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中文摘要
miRNA的家族性与成簇性的基因组特征显示它们会形成复杂的功能叠加性与协同性组合,精密调控各种生物学进程。这些调控组合或可对由某种因素引起的表型变化进行及时补偿,导致敲除单个或几个miRNA的遗传学试验不会出现显著的生物学表型。我们将该调控模式引起的表型变化特点称为miRNA的“表型弹性”。我们以胚胎干细胞早期定向中胚层分化为模型,通过CRISPR/cas9介导的基因敲除方法系统鉴定这些在中胚层分化中占主导地位和/或不同阶段特异表达的miRNA基因簇,阐明它们在特定链系分化中的关键作用,并探讨miRNA簇各成员之间的“表型弹性”关系,解析“表型弹性”发生的分子机制。这些研究将有助于我们重新认识miRNA的生物学功能,深入理解miRNA成簇的生物学意义,同时有助于揭示胚胎干细胞分化的调控网络,更好地指导胚胎干细胞的体外定向分化。
英文摘要
Genomic properties and mechanistic function of microRNA (miRNA) indicate that they comprehensively regulate multiple biological processes by many additive and synergistic groups. These regulatory groups might compensate the phenotypic changes caused by specific factors in time, resulting in the reality that people couldn’t observe significant phenotypes after a single miRNA or several miRNAs knockdown. We define this phenotypic character induced by the complex regulatory pattern as “Phenotypic Fexibility” of miRNA. With the model of directed differentiation of embryonic stem cells (ESCs) into mesoderm cells, we will systematically identify the dominant miRNA clusters during the differentiation process or differentially expressed miRNA clusters at different developmental stages via CRISPR/cas9-mediated deletion, to elucidate their essential function in specific differentiation, investigate the relation of phenotypic fexibility among.different members of the miRNA clusters and analyze the molecular mechanism behind the synergistic regulation. All of the studies will contribute to re-recognize the biological function of miRNAs, understand the evolutional significance of miRNA clusters, uncover the regulatory network of differentiation of ESCs and guide the committed differentiation of ESCs in vitro.
miRNA的家族性与成簇性的基因组特征显示它们会形成复杂的功能叠加性与协同性组合,精密调控各种生物学进程。这些调控组合或可对由某种因素引起的表型变化进行及时补偿,导致敲除单个或几个miRNA的遗传学试验不会出现显著的生物学表型。我们将该调控模式引起的表型变化特点称为miRNA的“表型弹性”。在本项目中我们以胚胎干细胞向心肌细胞分化为模型,通过CRISPR/cas9介导的基因敲除方法系统鉴定了在心肌细胞分化中占主导地位的miRNA基因簇--miR-23~27~24基因簇,阐明了它们在心肌细胞分化中的关键作用,并发现miRNA簇各成员之间存在“表型弹性”关系,初步探讨了“表型弹性”发生的分子机制。这些研究将有助于我们重新认识miRNA的生物学功能,深入理解miRNA成簇的生物学意义,同时有助于揭示胚胎干细胞分化的调控网络,更好地指导胚胎干细胞的体外定向分化。
期刊论文列表
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QKI5-mediated alternative splicing of the histone variant macroH2A1 regulates gastric carcinogenesis.
QKI5介导的组蛋白变体macroH2A1的选择性剪接调节胃癌发生
DOI:10.18632/oncotarget.8739
发表时间:2016-05-31
期刊:Oncotarget
影响因子:--
作者:Li F;Yi P;Pi J;Li L;Hui J;Wang F;Liang A;Yu J
通讯作者:Yu J
KSRP specifies monocytic and granulocytic differentiation through regulating miR-129 biogenesis and RUNX1 expression.
KSRP 通过调节 miR-129 生物合成和 RUNX1 表达来指定单核细胞和粒细胞分化
DOI:10.1038/s41467-017-01425-3
发表时间:2017-11-10
期刊:Nature communications
影响因子:16.6
作者:Zhao H;Wang X;Yi P;Si Y;Tan P;He J;Yu S;Ren Y;Ma Y;Zhang J;Wang D;Wang F;Yu J
通讯作者:Yu J
单细胞多维组学解码造血干细胞损伤修复调控机制
- 批准号:92268205
- 项目类别:重大研究计划
- 资助金额:300.00万元
- 批准年份:2022
- 负责人:余佳
- 依托单位:
长链非编码RNA在造血髓系链系呈递及分化发育中的功能及机制研究
- 批准号:81530007
- 项目类别:重点项目
- 资助金额:273.0万元
- 批准年份:2015
- 负责人:余佳
- 依托单位:
Linc-CEBPG与KSRP的相互作用对单核细胞分化的调控作用及机理研究
- 批准号:31371322
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:80.0万元
- 批准年份:2013
- 负责人:余佳
- 依托单位:
幽门螺杆菌所致胃组织炎症恶性转化过程中“节点miRNA”分子的鉴定、分子机制及表达调控研究
- 批准号:91129716
- 项目类别:重大研究计划
- 资助金额:70.0万元
- 批准年份:2011
- 负责人:余佳
- 依托单位:
红系分化重要转录因子GATA-1和NF-E2调控的microRNA网络研究
- 批准号:31040021
- 项目类别:专项基金项目
- 资助金额:10.0万元
- 批准年份:2010
- 负责人:余佳
- 依托单位:
国内基金
海外基金
