课题基金 / 基金详情

非编码RNA竞争配对控制互斥剪接假说的证实和后续研究

批准号：
31071148
项目类别：
面上项目
资助金额：
35.0 万元
负责人：
金勇丰
依托单位：
浙江大学
学科分类：
基因表达及非编码序列调控
结题年份：
2013
批准年份：
2010
项目状态：
已结题
项目参与者：
方祥年、田男、杨赟、詹雷雷、方学智、王文峰、孟巧红、孙锋、张文静
关键词：
互斥剪接补偿突变非编码RNA竞争二级结构转录后调控

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要
互斥剪接（Mutually exclusive splicing）约占可变剪接总数的10%，但其发生机制远不清楚。2005年Cell杂志提出了非编码RNA竞争二级结构指导互斥剪接的假说，但一直无法证实。我们建立模型不仅首次证实了该假说，还补充了新观点：(1)这种RNA竞争系统中的非编码元件序列具有物种特异性，但二级结构是保守的; (2) RNA竞争互补强度与可变外显子的选择呈正相关； (3)通过插入突变表明这种RNA竞争系统是动态的可扩展的。在此基础上，进一步分析RNA双链体与5′剪接位点的距离、RNA双链体的环等对互斥剪接的影响，探明RNA双链体序列和结构与互斥剪接的相关性；并通过RNAi技术筛选能特异性抑制互斥外显子剪接的蛋白，探明RNA双链体是如何与抑制蛋白相互作用从而启动外显子的剪接，最终完善非编码RNA竞争双链体指导互斥剪接的模型, 有望揭示一种新的基因转录后表达调控方式。
英文摘要
互斥可变剪接是产生蛋白质和功能多样性的重要途径，但机制还不清楚，本项目发现普遍存在具有物种专一和二级结构保守的一类介导RNA可变剪接的特异顺式元件，揭示其通过二级结构水平上的物理性竞争作用而调控互斥剪接的机制，进而证实可变外显子的非随机可调控选择方式，其选择强度与RNA结构微小变化密切相关、与RNA配对强度呈正相关、与距离长度呈负相关，表明RNA二级结构物理性竞争和外显子选择的紧密关联，同时修正教科书或专著描述相关可变剪接机制；发现并阐析了Dscam基因互斥可变剪接新的RNA控制元件（LCR RNA）；已发表高水平研究论文5篇（其中IF近5或大于5的5篇，包括Nature子刊1篇），综述2篇，2012年全国RNA学术会议和生化学术会议报告各一次，2013年RNAi学术会议大会报告一次，2013年全国生化与分子生物学学会农业分会大会报告一次。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
ADAR-mediated RNA editing in non-coding RNA sequences
DOI： --
发表时间： 2013
期刊： Science China Life Sciences
影响因子：
作者： [Yun Yang, Xinxin Zhou, Yongfeng Jin, ]
通讯作者：
New insight into RNA secondary structure on alternative splicing of pre-mRNA
对前体 mRNA 选择性剪接的 RNA 二级结构的新见解
DOI： --
发表时间： 2011
期刊： RNA Biology
影响因子： 4.1
作者： [Jin Y, Yang Y, Zhang P]
通讯作者： Zhang P
An RNA architectural locus control region involved in Dscam mutually exclusive splicing.
参与 Dscam 互斥剪接的 RNA 结构位点控制区域
DOI： 10.1038/ncomms2269
发表时间： 2012
期刊： Nature communications
影响因子： 16.6
作者： []
通讯作者：
Conservation and regulation of alternative splicing by dynamic inter- and intra-intron base pairings in Lepidoptera 14-3-3z pre-mRNAs
鳞翅目 14-3-3z 前体 mRNA 中动态内含子间和内含子碱基配对对选择性剪接的保护和调节
DOI： 10.4161/rna.20205
发表时间： 2012-05
期刊： RNA Biology
影响因子： 4.1
作者： [Jin Y, Sun F, Wang X, Yue Y, Wang W, Zhang W, Zhan L, Tian N, Shi F]
通讯作者： Shi F
共 7 条
    ADAR对Dscam复杂可变剪接的调控功能和作用机制
    • 批准号：
      Z25C050006
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      0.0万元
    • 批准年份：
      2025
    • 负责人：
      金勇丰
    • 依托单位：
      浙江大学
    二斑叶螨类免疫球蛋白高度多样性形成机制和功能研究
    • 批准号：
      LD21C050002
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      0.0万元
    • 批准年份：
      2020
    • 负责人：
      金勇丰
    • 依托单位：
      浙江大学
    反义长链非编码RNA Dscam1AS 调控Dscam1可变剪接及其作用机制研究
    • 批准号：
      91740104
    • 项目类别：
      重大研究计划
    • 资助金额：
      100.0万元
    • 批准年份：
      2017
    • 负责人：
      金勇丰
    • 依托单位：
      浙江大学
    Dscam转录本5'端高度多样性的发现和调控机制及其功能研究
    • 批准号：
      31630089
    • 项目类别：
      重点项目
    • 资助金额：
      269.0万元
    • 批准年份：
      2016
    • 负责人：
      金勇丰
    • 依托单位：
      浙江大学
    国内基金
    海外基金