The International Nucleotide Sequence Database Collaboration.
The International Nucleotide Sequence Database Collaboration.
复制标题
DOI：
10.1093/nar/gkq1150
复制
发表时间：
2011-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
International Nucleotide Sequence Database Collaboration
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Cochrane G;Karsch-Mizrachi I;Nakamura Y;International Nucleotide Sequence Database Collaboration
在国际核苷酸序列数据库协作（INSDC; http://www.insdc.org）下，捕获、保存和呈现全球综合公共域核苷酸序列。这一长期合作的合作伙伴密切合作，提供数据格式和约定，以便能够向其数据库提交一致的数据，并支持地球仪的定期数据交换。在自由获取数据和与期刊出版商的关系方面，明确界定的政策和治理使INSDC数据库成为科学记录的主要提供者和全球生物信息学数据基础设施的核心基础。虽然序列数据量的增长对INSDC的合作伙伴来说不再是一个惊喜，但我们近年来目睹的主流科学对下一代测序技术的采用为增长带来了一个台阶式的变化，这必然会对INSDC的战略产生明确的影响。在本文中，我们介绍了INSDC，概述了数据增长模式，并评论了增长带来的挑战。
Under the International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC; http://www.insdc.org), globally comprehensive public domain nucleotide sequence is captured, preserved and presented. The partners of this long-standing collaboration work closely together to provide data formats and conventions that enable consistent data submission to their databases and support regular data exchange around the globe. Clearly defined policy and governance in relation to free access to data and relationships with journal publishers have positioned INSDC databases as a key provider of the scientific record and a core foundation for the global bioinformatics data infrastructure. While growth in sequence data volumes comes no longer as a surprise to INSDC partners, the uptake of next-generation sequencing technology by mainstream science that we have witnessed in recent years brings a step-change to growth, necessarily making a clear mark on INSDC strategy. In this article, we introduce the INSDC, outline data growth patterns and comment on the challenges of increased growth.
登录
查看更多内容
影响因子：
14.9
作者：
Benson DA;Cavanaugh M;Clark K;Karsch-Mizrachi I;Lipman DJ;Ostell J;Sayers EW
通讯作者：
Sayers EW
影响因子：
14.9
作者：
Kaminuma E;Mashima J;Kodama Y;Gojobori T;Ogasawara O;Okubo K;Takagi T;Nakamura Y
通讯作者：
Nakamura Y
影响因子：
14.9
作者：
Leinonen R;Akhtar R;Birney E;Bower L;Cerdeno-Tárraga A;Cheng Y;Cleland I;Faruque N;Goodgame N;Gibson R;Hoad G;Jang M;Pakseresht N;Plaister S;Radhakrishnan R;Reddy K;Sobhany S;Ten Hoopen P;Vaughan R;Zalunin V;Cochrane G
通讯作者：
Cochrane G
影响因子：
14.9
作者：
Parkinson H;Kapushesky M;Kolesnikov N;Rustici G;Shojatalab M;Abeygunawardena N;Berube H;Dylag M;Emam I;Farne A;Holloway E;Lukk M;Malone J;Mani R;Pilicheva E;Rayner TF;Rezwan F;Sharma A;Williams E;Bradley XZ;Adamusiak T;Brandizi M;Burdett T;Coulson R;Krestyaninova M;Kurnosov P;Maguire E;Neogi SG;Rocca-Serra P;Sansone SA;Sklyar N;Zhao M;Sarkans U;Brazma A
通讯作者：
Brazma A
影响因子：
14.9
作者：
Barrett T;Troup DB;Wilhite SE;Ledoux P;Rudnev D;Evangelista C;Kim IF;Soboleva A;Tomashevsky M;Marshall KA;Phillippy KH;Sherman PM;Muertter RN;Edgar R
通讯作者：
Edgar R