Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) genome and transcriptome.
Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) genome and transcriptome.
复制标题
DOI：
10.1371/journal.pone.0195461
复制
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Devlin RH
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Christensen KA;Leong JS;Sakhrani D;Biagi CA;Minkley DR;Withler RE;Rondeau EB;Koop BF;Devlin RH
在统一研究中的基因组资源和比较物种之间的数据时，通常没有比基因组序列更好的资源。拥有奇努克鲑鱼（Oncorhynchus tshawytscha）的参考基因组将使太平洋鲑鱼，大西洋鲑鱼和虹鳟鱼的广泛基因组资源在提出与奇努克鲑鱼相关的问题时得到利用。奇努克鲑鱼的广泛分布，长期的文化影响，进化历史，大量的孵化生产，以及最近的野生种群数量下降，使其成为一个重要的研究物种。在这项研究中，我们测序和组装的基因组的奇利瓦克河孵化场女性奇努克鲑鱼（雌核发育和纯合子在所有位点）。有了参考基因组序列，人们可以对这个物种的性质及其在迅速变化的世界中的作用提出新的问题。
When unifying genomic resources among studies and comparing data between species, there is often no better resource than a genome sequence. Having a reference genome for the Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) will enable the extensive genomic resources available for Pacific salmon, Atlantic salmon, and rainbow trout to be leveraged when asking questions related to the Chinook salmon. The Chinook salmon’s wide distribution, long cultural impact, evolutionary history, substantial hatchery production, and recent wild-population decline make it an important research species. In this study, we sequenced and assembled the genome of a Chilliwack River Hatchery female Chinook salmon (gynogenetic and homozygous at all loci). With a reference genome sequence, new questions can be asked about the nature of this species, and its role in a rapidly changing world.
登录
查看更多内容
影响因子：
16.6
作者：
Berthelot, Camille;Brunet, Frederic;Chalopin, Domitille;Juanchich, Amelie;Bernard, Maria;Noel, Benjamin;Bento, Pascal;Da Silva, Corinne;Labadie, Karine;Alberti, Adriana;Aury, Jean-Marc;Louis, Alexandra;Dehais, Patrice;Bardou, Philippe;Montfort, Jerome;Klopp, Christophe;Cabau, Cedric;Gaspin, Christine;Thorgaard, Gary H.;Boussaha, Mekki;Quillet, Edwige;Guyomard, Rene;Galiana, Delphine;Bobe, Julien;Volff, Jean-Nicolas;Genet, Carine;Wincker, Patrick;Jaillon, Olivier;Roest Crollius, Hugues;Guiguen, Yann
通讯作者：
Guiguen, Yann
影响因子：
1.7
作者：
Jurka, J;Kapitonov, VV;Walichiewicz, J
通讯作者：
Walichiewicz, J
全基因组协会研究（GWAS）关于大西洋鲑鱼（Salmo Salar）性成熟时的增长率和年龄。
影响因子：
3.7
作者：
Gutierrez AP;Yáñez JM;Fukui S;Swift B;Davidson WS
通讯作者：
Davidson WS
影响因子：
4.6
作者：
Chasco BE;Kaplan IC;Thomas AC;Acevedo-Gutiérrez A;Noren DP;Ford MJ;Hanson MB;Scordino JJ;Jeffries SJ;Marshall KN;Shelton AO;Matkin C;Burke BJ;Ward EJ
通讯作者：
Ward EJ
影响因子：
14.9
作者：
Finn RD;Mistry J;Tate J;Coggill P;Heger A;Pollington JE;Gavin OL;Gunasekaran P;Ceric G;Forslund K;Holm L;Sonnhammer EL;Eddy SR;Bateman A
通讯作者：
Bateman A